Se puede desarrollar en los ovarios (endometriomas), en la zona del recto y la vagina, o en la cavidad abdominal y pelvis.

El dolor también aparece en las relaciones sexuales y provoca infertilidad, ya que al crecer fuera del útero, el tejido puede bloquear las trompas o alterar la función del ovario. Alrededor del 40% de las mujeres con endometriosis no son fértiles.

En la exploración física el especialista puede notar la presencia de una masa de tejido detrás del útero. A veces no es fácil su diagnóstico, y para confirmarlo se extrae una pequeña muestra del tejido endometrial, y otras técnicas como la observación de la cavidad abdominal, mediante un tubo de fibra óptica (laparoscopia), y también con ecografía, o resonancia. Los tratamientos dependerán de la agresión de la enfermedad y de la voluntad de la mujer de quedarse embarazada. Puede ser un tratamiento con fármacos para suprimir la actividad de los ovarios y reducir así el crecimiento del tejido endometrial, como son los anticonceptivos orales, progestágenos, danocrina y agonistas de la hormona liberadora de gonadotropinas (GnRH). Los tratamientos farmacológicos no curan la endometriosis, son complejos porque dependerá de la edad de la mujer, la extensión de la endometriosis, el dolor que provoca... La enfermedad perdura mientras los ovarios están activos, con la menopausia desaparece.

Es una enfermedad que los especialistas consideran infradiagnosticada, y que debería instaurarse un tratamiento lo más pronto posible, para evitar que siga extendiéndose el tejido y provocando dolor y otros síntomas. También se puede recurrir a la cirugía para extirpar la mayor parte posible del tejido que ha crecido fuera de su sitio, o la extirpación del útero. Hoy en día hay cirugías más conservadoras. Está indicada en mujeres con endometriosis severa que desean mantener la posibilidad de embarazo. Consiste en extirpar sólo el tejido endometrial, eliminar quistes y adherencias y restaurar lo mejor posible la anatomía pélvica. Los índices de embarazo logrados tras la cirugía conservadora varían según la severidad: en los casos leves aproximadamente el 75% de las afectadas logra el embarazo, en los moderados el 55% y en los severos el 35%.

Algunas asociaciones de pacientes están intentado que la administración sanitaria considere la endometriosis como una enfermedad invalidante, y en algunas comunidades, como en Andalucía se están creando Unidades especializadas.