The "CPC clip motif" : a conserved structural signature for heparin-binding proteins
Torrent Burgas, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Nogués Bara, Maria Victòria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Andreu Martínez, David (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut)
Boix i Borràs, Esther (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)

Data:	2012
Resum:	Glycosaminoglycans (GAGs) are essential molecules that regulate diverse biological processes including cell adhesion, differentiation, signaling and growth, by interaction with a wide variety of proteins. However, despite the efforts committed to understand the molecular nature of the interactions in protein-GAG complexes, the answer to this question remains elusive. In the present study the interphases of 20 heparin-binding proteins have been analyzed searching for a conserved structural pattern. We have found that a structural motif encompassing one polar and two cationic residues (which has been named the CPC clip motif) is conserved among all the proteins deposited in the PDB. The distances between the α carbons and the side chain center of gravity of the residues composing this motif are also conserved. Furthermore, this pattern can be found in other proteins suggested to bind heparin for which no structural information is available. Hence we propose that the CPC clip motif, working like a staple, is a primary contributor to the attachment of heparin and other sulfated GAGs to heparin-binding proteins.
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; Versió publicada
Matèria:	Proteïnes ; Glycosaminoglycans ; Proteins
Publicat a:	PloS one, Vol. 7, Issue 8 (August 2012) , p. e42692, ISSN 1932-6203

DOI: 10.1371/journal.pone.0042692
PMID: 22880084

8 p, 984.8 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles publicats