Test for positional candidate genes for body composition on pig chromosome 6
Ovilo, Cristina (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya))
Oliver, Àngels (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Centre de Tecnologia de la Carn (Girona, Catalunya))
Noguera, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
Clop, Alex (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Barragán, Carmen (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya))
Varona, Luis (Universitat de Lleida. Departament de Producció Animal)
Rodriguez, Carmen (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya))
Toro, Miguel (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya))
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Perez-Enciso, Miguel (Universitat de Lleida. Departament de Producció Animal)
Silió, Luis (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya))

Data:	2002
Resum:	One QTL affecting backfat thickness (BF), intramuscular fat content (IMF) and eye muscle area (MA) was previously localized on porcine chromosome 6 in an F2 cross between Iberian and Landrace pigs. This work was done to study the effect of two positional candidate genes on these traits: H-FABP and LEPR genes. The QTL mapping analysis was repeated with a regression method using genotypes for seven microsatellites and two PCR-RFLPs in the H-FABP and LEPR genes. H-FABP and LEPR genes were located at 85. 4 and 107 cM respectively, by linkage analysis. The effects of the candidate gene polymorphisms were analyzed in two ways. When an animal model was fitted, both genes showed significant effects on fatness traits, the H-FABP polymorphism showed significant effects on IMF and MA, and the LEPR polymorphism on BF and IMF. But when the candidate gene effect was included in a QTL regression analysis these associations were not observed, suggesting that they must not be the causal mutations responsible for the effects found. Differences in the results of both analyses showed the inadequacy of the animal model approach for the evaluation of positional candidate genes in populations with linkage disequilibrium, when the probabilities of the parental origin of the QTL alleles are not included in the model.
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; Versió publicada
Matèria:	Candidate gene ; H-FABP ; LEPR ; QTL ; Pigs
Publicat a:	Genetics, selection, evolution, Vol. 34 (July 2002) , p. 465-479, ISSN 1297-9686

DOI: 10.1186/1297-9686-34-4-465
PMID: 12270105

15 p, 926.4 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles publicats