Per citar aquest document: http://ddd.uab.cat/record/144530
Analysis-driven lossy compression of DNA microarray images
Hernández Cabronero, Miguel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria de la Informació i de les Comunicacions)
Blanes Garcia, Ian (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria de la Informació i de les Comunicacions)
Pinho, Armando J. (Universidade de Aveiro. DETI/IEETA)
Marcellin, Michael W. (University of Arizona. Department of Electrical and Computer Engineering)
Serra Sagristà, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria de la Informació i de les Comunicacions)

Data: 2016
Resum: DNA microarrays are one of the fastest-growing new technologies in the field of genetic research, and DNA microarray images continue to grow in number and size. Since analysis techniques are under active and ongoing development, storage, transmission and sharing of DNA microarray images need be addressed, with compression playing a significant role. However, existing lossless coding algorithms yield only limited compression performance (compression ratios below 2:1), whereas lossy coding methods may introduce unacceptable distortions in the analysis process. This work introduces a novel Relative Quantizer (RQ), which employs non-uniform quantization intervals designed for improved compression while bounding the impact on the DNA microarray analysis. This quantizer constrains the maximum relative error introduced into quantized imagery, devoting higher precision to pixels critical to the analysis process. For suitable parameter choices, the resulting variations in the DNA microarray analysis are less than half of those inherent to the experimental variability. Experimental results reveal that appropriate analysis can still be performed for average compression ratios exceeding 4. 5:1.
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/TIN2012-38102-C03-03
Nota: Número d'acord de subvenció MEC/FPU-AP2010-0172
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2014-SGR-691
Drets: Tots els drets reservats
Llengua: Anglès
Document: article ; recerca ; acceptedVersion
Matèria: DNA microarray images ; Image compression ; Quantization
Publicat a: Medical Imaging, IEEE Transactions, Vol. 35 Issue 2 (Feb. 2016) , p. 654-664, ISSN 0278-0062

DOI: 10.1109/TMI.2015.2489262


Post-print
11 p, 3.0 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Enginyeries > Group on Interactive Coding of Images (GICI)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats

 Registre creat el 2015-12-09, darrera modificació el 2016-06-04



   Favorit i Compartir