Per citar aquest document: http://ddd.uab.cat/record/98268
Optimització d'una aplicacio bioinformàtica d'alineament de seqüències executada en processadors multi-core i many-core (GPUs)
Figuera Penedo, Carles
Moure López, Juan Carlos
Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria

Data: 2011
Descripció: 76 p.
Resum: Las aplicaciones de alineamiento de secuencias son una herramienta importante para la comunidad científica. Estas aplicaciones bioinformáticas son usadas en muchos campos distintos como pueden ser la medicina, la biología, la farmacología, la genética, etc. A día de hoy los algoritmos de alineamiento de secuencias tienen una complejidad elevada y cada día tienen que manejar un volumen de datos más grande. Por esta razón se deben buscar alternativas para que estas aplicaciones sean capaces de manejar el aumento de tamaño que los bancos de secuencias están sufriendo día a día. En este proyecto se estudian y se investigan mejoras en este tipo de aplicaciones como puede ser el uso de sistemas paralelos que pueden mejorar el rendimiento notablemente.
Resum: Les aplicacions d'alineament de seqüències són una eina important per a la comunitat científica. Aquestes aplicacions bioinformàtiques són utilitzades en molts camps diferents com poden ser la medicina, la biologia, la farmacologia, la genètica, etc. A dia d'avui els algorismes d'alineament de seqüències tenen una complexitat elevada i cada dia han de gestionar un volum de dades més gran. Per això s'han de buscar alternatives per a que aquestes aplicacions siguin capaces de gestionar l'augment de mida que els bancs de seqüències estan patint dia a dia. En aquest projecte s'estudien i s'investiguen millores en aquest tipus d'aplicacions com pot ser l'ús de sistemes paral·leles que poden millorar el rendiment notablement.
Resum: The sequence alignment applications are an important tool for the scientific community. These bioinformatics applications are used in many different fields such as medicine, biology, pharmacology, genetics, etc. Today the sequence alignment algorithms are highly complex and every day have to handle a large volume of data. For this reason we must find alternatives for these applications are able to handle the increased size of sequences that banks are suffering every day. In this project we study and investigate improvements in these applications such as the use of parallel systems that can improve performance significantly.
Drets: L'accés als continguts d'aquest document queda condicionat a l'acceptació de les condicions d'ús establertes per la següent llicència Creative Commons: Creative Commons
Llengua: Castellà.
Document: bachelorThesis
Matèria: Bioinformàtica ; Algorismes computacionals ; Genomes -- Processament de dades

Adreça alternativa: http://hdl.handle.net/2072/196781


Projecte
76 p, 2.4 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Treballs de recerca i projectes de final de carrera > Enginyeria. Projectes de final de carrera > Enginyeria Informàtica. PFC

 Registre creat el 2012-08-31, darrera modificació el 2016-06-11



   Favorit i Compartir