La diagnosi si effettua con l’esame esofagogastroscoduodenoscopico che evidenzia le plicature ridotte a livello duodenale e la mancante del naturale aspetto "vellutato" della mucosa. Con i test che ricercano gli anticorpi anti Endomisio ed anti-gliadina ericercando la celiachia in adulti sintomatici mediante l'utilizzo del nuovo test ELISA per la determinazione degli anticorpi contro la ransglutaminasi tessutale umana (anti h-tTg). La biopsia intestinale, infine, è un prezioso mezzo diagnostico; le biopsie sono ottenute al livello del legamento del TREIZ.