Les affections congénitales,qui occasionnent des maux de dos, comprennent la spondylolyse (malformation osseuse dans la partie postérieure de la vertèbre lombaire), qui peut à son tour causer la spondylolisthésis (déplacement d'une vertèbre relativement à une autre en raison d'une instabilité à cet endroit), la spina bifida et les vertèbres de transition (de forme anormale) à l'articulation sacrovertébrale.