Membranen inneholder mange transportproteiner, den spesialiseres til en liten membranflekk under den synaptiske spalte, denne kalles den aktive sone og inneholder mange spenningsavhengige Ca++ kanaler og frisettingsproteiner (som ikke er vanlig ved ultrastrukturell analyse). Videre sees tydelig ansamlinger av synaptiske vesikler (blærer) i denne sonen, mens noen få mitokondrier evt. ligger lenger inn mot basis. Av og til kan noen endocytotiske strukturer sees, f.eks. tidlige endosomer.