En l’administració conjunta amb altres medicaments que són metabolitzats, principalment, per l’enzim CYP2D6, al qual l’escitalopram inhibeix, i que tenen un marge terapèutic estret, p.e. flecaïnida, propafenona, i metoprolol (quan s’utilitza en la insuficiència cardíaca), o amb alguns medicaments que actuen sobre l’SNC, p.e. antidepressius, com són desipramina, clomipramina i nortriptilina o antipsicòtics, com ara risperidona, tioridacina i haloperidol, pot ser necessari un ajustament de la dosificació.