Aunque durante cierto tiempo se ha especulado sobre el posible origen del petróleo, hoy, está fuera de toda duda su origen orgánico, al comprobarse la presencia de restos indiscutibles de materia orgánica y sobre todo la de bacterias asociadas a yacimientos petrolíferos, que indican reacciones bacterianas anaerobias a partir de restos animales y vegetales.