Sempre secondo il rapporto ISAAA, oltre all’incremento quantitativo del raccolto, del reddito degli agricoltori e alla diminuzione dell’utilizzo dei fitofarmaci, esistono dei vantaggi anche dal punto di vista della salute: «é ormai evidente che gli alimenti e i mangimi derivanti dal mais Bt sono spesso più sicuri di quelli derivanti da varietà di mais tradizionali poiché contengono livelli minori di una particolare micotossina, la fumonisina».