De entre todas las capillas merecen especial atención la capilla de San Juan Evangelista, con dos interesantes sepulcros góticos; la de Nuestra Señora de Gracia, en la que se encuentran los dos sepulcros más antiguos de cuantos alberga el templo, de los siglos XII y XIII; y la de San Antolín, con retablo del siglo XVI.