Azithromycin ist von allen Makroliden am aktivsten gegen Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis, Neisseria gonorrhoeae und Mykoplasmen. Es ist jedoch weniger wirksam als die anderen Makrolide gegen Streptokokken und Bordetella pertussis. Azithromycin ist auch gegen Campylobacter sp. hochwirksam; Erythromycin ist allerdings klinisch viel besser dokumentiert.