Não existe um antiepiléptico específico para a SXF, pelo que é necessário intervir com o antiepiléptico mais eficaz segundo o tipo de crises, avaliando além disso a tolerância e os possíveis efeitos sobre o comportamento. Outro aspecto que pode merecer uma atenção especial é o problema da insónia que algumas crianças com SXF apresentam. Neste caso a melatonina pode ser muito útil.