La desintoxicación es preferible realizarla con el uso de agonistas alfa-2 adrenérgicos, evitando los agonistas opiáceos, dado el largo periodo tras la última dosis de metadona preciso para introducir la naltrexona. La verificación del estado libre de opiáceos, necesaria para reducir la probabilidad de precipitar abstinencia al administrar naltrexona (que dura más de 24 horas), puede realizarse mediante examen de orina o con la prueba de la naloxona (antagonista cuyo efecto dura tan solo media hora).