Però no tot són avantatges per al mencionat mètode d'implementació, ja que a l'eficiència del procés de cerac s'uneix un és poc apropiat de la memòria reservada per emmagatzaemar l'arbre, ja que a més d'haver de reservar una posició de l'array per a cada node de l'arbre, també se n'ha de reservar una per a cada possible descendent esquerre i dret dels nodes, encara que no apareguin a l'arbre.