Se recomienda utilizar la rifabutina a mitad de dosis en lugar de la rifampicina en los esquemas terapéuticos habituales y el nelfinavir o el indinavir como inhibidores de la proteasa. La profilaxis no debe hacerse en los pacientes anérgicos y pueden usarse pautas cortas con dos fármacos (rifampicina y pirazinamida) en los pacientes que la precisen.