La transmisión de la FA es extraordinariamente fácil, razón de su importancia sanitaria. Esta puede tener lugar por vía aerógena, lo que es un factor de enorme trascendencia desde el punto de vista epidemiológico, ya que los animales enfermos excretan en sus secreciones respiratorias grandes cantidades de partículas víricas. Este hecho, unido a la relativa resistencia del virus [virus de la fiebre aftosa], que en condiciones de humedad y temperatura adecuadas logra sobrevivir varias horas, le permite desplazarse por el aire posibilitando así la difusión lejana.