Ce sont les recherches biochimiques qui ont conduit à separer nettement les peroxysomes des lysosomes. Par centrifugation en gradient de densité, De Duve a montré que l´urate-oxydase puis la D-amino-acide oxydase, la catalase et la L-hydroxy-acide oxydase appartiennent à une classe d´organites cytoplasmiques différente à la fois des lysosomes, des mitochondries et des microsomes.