A la tercera setmana comença l'organogènesi. La línia primitiva (gastrulació, fins la 4arta setmana): no arriba ni fins la placa pre o procordal ni fins la cloacal, va de cranial a caudal (diferenciació de cranial a caudal) quedant per tant cada cop més caudal (al créixer l'embrió cap a cranial), les seves cèl·lules són pluripotents (si ho continuen sent es forma un teratoma sacrococcigi, malformació congènita). La neurolació (formació del tub neural) s'estén fins a la 5ena setmana, i del rodet neural se'n forma la cresta neural.