Comme toutes les planètes géantes gazeuses, la haute atmosphère de Neptune est parcourue par des vents très violents, les plus violents jamais enregistrés dans le système solaire. Notamment près de la grande tâche sombre (un anticyclone sensiblement identique à la grande tâche rouge de Jupiter, situé à 22°de latitude sud, faisant le tour de la planète en 18h20) où les vents peuvent souffler jusqu'à 2 000km/h !! La grande tâche sombre a été observée en 1989 par Voyager2 lors de son passage, cependant elle semble avoir disparu depuis 1994 … Peut-être a-t-elle été dissipée par les vents violents soufflant à sa périphérie ou alors elle est tout simplement masquée par une couche nuageuse supérieure. Cette tâche est de la taille de la Terre alors que la grande tâche rouge de Jupiter est deux fois plus grosse !