Les lesions es localitzen exclusivament al sistema nerviós central. Consten de: vacuolització neuronal simètrica i bilateral tant del pericarió com de les prolongacions neuronals (neuròpil de la s. grisa); astròglia hipertròfica associada a la presència de la vacuolització; degeneració neuronal i pèrdua de neurones; amiloïdosi cerebral (en un 5% dels casos; un 50% en Scrapie). Aquestes plaques són positives a la prova immunohistoquímica per detectar PrP.