Il valore dell'esame dell'espettorato, nell'analisi della AE in BPCO, è considerato da molti inaffidabile. Una tale conclusione è ingiustificata se vengono seguiti tre raccomandazioni: raccolta del campione lungo un arco di tempo che permetta di contenere con ogni probabilità materiale proveniente dall'area broncopolmonare, selezione microscopica di una quantità esclusiva della secrezione orofaringea e utilizzazione di questo materiale selezionato per successive valutazioni microscopiche e colturali.