A partir de 1872, Pasteur repris ses travaux et découvrit les germes responsables des plus terribles infections, le staphylocoque et le streptocoque. Il inversa la théorie de Lister qui voulait que les germes n’étaient amenés par l’air mais par contact et qu’il fallait surtout éviter de les transmettre et de les détruire avant qu’ils n’atteignent la plaie opératoire. Par le lavage des mains et des instruments et la stérilisation par la chaleur de tout le matériel du chirurgien, il inventa l’asepsie.