Une troisième flottille opére dans le golfe de Guinée comme dans toutes les mers du monde : celles des bateaux-pirates qui pratiquent une pêche illégale, non déclarée et non réglementée (dite INN, ou IUU en anglais). Ces navires sont immatriculés sous pavillon de complaisance, c'est-à-dire dans des pays très peu exigeants sur les plans administratif, fiscal et social ; certains n'ont même pas d'immatriculation, donc d'existence légale ! Ils pêchent au mépris du droit international (zones économiques exclusives) et des réglementations de gestion des ressources, et leurs captures sont "blanchies" par le transbordement en pleine mer sur des cargos frigorifiques ou d'autres bateaux de pêche.