Balantidium coli es el único ciliado parásito del hombre, sin embargo especies coprófilas se encuentran ocasionalmente. Es de distribución completa en el mundo, vive en el intestino grueso, es patogénico, causando la balantidiasis. Esta enfermedad ocurre en 1% de la población humana, pero la tasa puede ser tan alta como el 100% en cochinos. Puede ser encontrado en monos y perros. Un quiste funciona como la forma infectante, vía oral, al ser comido, ellos se desenquistan en el intestino y se liberan los ciliados, alimentándose sobre fragmentos celulares, granos de almidón, materia fecal y otra materia orgánica. Frecuentemente invaden la mucosa y la submucosa del intestino grueso y ciego del huésped, causando varias lesiones ulcerativas y que a veces ocupan todo el intestino.