La couleur de l'iris présente de nombreuses variations qui sont sous la dépendance d'un facteur constant, la pigmentation noire de l'épithélium postérieur qui apparaît bleue àa travers le stroma irien non pigmenté et d'un facteur variable, la pigmentation du stroma et surtout de la couche antérieure; plus celui-ci est riche en pigment, plus l'iris sera foncé. Divers facteurs jouent dans cette pigmentation et dans l'établissement des nuances: la qualité et la densité du pigment, l'épaisseur du stroma et de l'épithélium.