El presente estudio se desarrolló bajo el marco del proyecto europeo PigQTech cuyo
objetivo es investigar si QTLs de importancia económica en la industria productora
porcina, previamente descritos en cruces de razas divergentes, se encuentran
segregando en poblaciones comerciales. En el presente estudio se analizaron dos
poblaciones porcinas de tipo comercial Pietrain y Large White, donde fue analizada la
presencia de QTLs, búsqueda y análisis de genes candidatos. La búsqueda de QTLs se
efectuó mediante el análisis de la segregación alelica de microsatélites y su relación con
los caracteres productivos medidos. Se analizaron 10 regiones de los cromosomas 1, 2,
3, 4, 6, 7, 8, 9, 10, 13, tres de las cuales fueron utilizadas como regiones control (1, 6, 9)
por no haber QTLs descritos previamente en ellas. Los resultados muestran segregación
de QTLs para los cromosomas 2, 3, 4, 7 y para las regiones control 1 y 9 en la población
Large White, mientras en la población Pietrain se detectaron QTL en los cromosomas 7
y 8. En resumen, se observó que los QTLs descritos en cruces de razas divergentes están
presentes en poblaciones comerciales, sin embargo no segregan por igual entre las
distintas poblaciones.
Adicionalmente se realizó un estudio de asociación de los genes candidatos H-FABP,
receptor de leptina (LEPR) y la piruvato carboxilasa (PC). El gen H-FABP reveló la
existencia de asociación entre los distintos genotipos para los caracteres de grasa dorsal,
longitud de canal y pH, sin embargo estas asociaciones no se presentan por igual en las
distintas poblaciones. El análisis de asociación del gen receptor de leptina reveló la
existencia de asociación entre sus distintos genotipos con un menor pH a las 24 horas
postmortem, sin embargo esta asociación se presentó solo en la población Large White.
La secuenciación del cDNA del gen de la piruvato carboxilasa reveló una alta similitud
nucleotídica con la de otras especies de mamíferos, y que además es polimórfica. Así
mismo el mapeo mediante el panel de células somáticas híbridas irradiadas reveló que el
gen de la PC está localizado en el cromosoma 2 en el brazo p entre los microsatélites SW2623 (9.8 cM) y el SW256 (19 cM).
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The present study was developped under the framework of the European PigQTech
project, whose objective was to investigate the segregation of economically important
QTLs previously described in divergent pig crosses in commercial populations. In the
present study, we analysed the segregation of QTL and candidate genes in Pietrain and
Large White. The search of QTLs was made by the analysis of the microsatellite allelic
segregation and its influence on the recorded commercial traits. Ten regions on
chromosomes 1, 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9, 10 and 13 were analysed. As not QTL had been
previously described in the regions located in chromosomes 1, 6 and 9, we used these
segments as control regions. In Large White, results showed segregation of QTLs in
chromosomes 2, 3, 4 and 7 as well as in the Ssc1 and Ssc9 control regions. The analysis
in Pietrain indicated the presence of QTL in chromosomes 7 and 8. In summary, we
observed that QTLs described in experimental pig crosses are also present in
commercial breeds. However these QTLs do not show the same segregation pattern
among different populations.
Additionally, we carried out an association analysis of the heart fatty acid binding
protein (H-FABP), leptin receptor (LEPR) and pyruvate carboxylase (PC) candidate
genes. The association analysis between H-FABP and the recorded traits, revealed the
influence of this gene on back fat thickness, carcass length and pH in some of our
populations. Influence of LEPR on the pH at 24 hours postmortem was detected in
Large White. The analysis of the nucleotidic sequence of the PC cDNA, revealed both a
high similarity between other mammal species, and the existence of sequence
polymorphism in our populations. Furthermore, we allocated PC in the short arm of
chromosome 2 (2p), between the markers SW2623 (9.8 cM) and SW256 (19 cM) in an
RH panel.
