High-speed Polymerase chain reaction in CMOS-compatible chips

High-speed Polymerase chain reaction in CMOS-compatible chips

Veure els fitxers associats amb aquesta Tesi

AutorErill Sagalés, Ivan
Adreça de correu electrònic Ivan.Erill@uab.es
URLhttp://www.tdx.cat/TDX-0602103-181756
TítolHigh-speed Polymerase chain reaction in CMOS-compatible chips
Llengua Anglès
UniversitatUAB
Departament/Institut401 - DEPARTAMENT D'INFORMATICA
Àrea de coneixement Tecnologies
Matèries
  • 68 - Indústries, oficis i comerç d'articles acabats. Tecnologia cibernètica i automàtica
  • Dipòsit legal/ISBN B.4.604-2003/84-688-1025-8
    Direcció de la tesi
  • Aguiló Llobet, Jordi. Director de la Tesi
  • Barbé Garcia, Jordi. Director de la Tesi
  • Paraules clau
  • Silici
  • PCR
  • Chip
  • Data de defensa29-11-2002

    Resum

    En la última década del siglo XX, el campo de los microsistemas para análisis total (µ-TAS) y, más concretamente, el de los DNA-chips ha adquirido una importancia preponderante en el ámbito de los microsistemas. En gran parte, el creciente interés por estos dispositivos se debe a las substanciales mejoras que prometen: análisis más rápidos, baratos y automatizados, pero también es debido a la posibilidad de implementar técnicas analíticas antes impensables (e.g. chips de hibridación). En el caso particular de los DNA-chips, se han desarrollado prototipos funcionales para PCR, LCR, electroforesis en gel, di-electroforesis, hibridación y varias combinaciones de estas técnicas, al tiempo que los chips de hibridación masiva (mayoritariamente basados en arrayers) han llegado a convertirse en un éxito comercial. Aun así, y aunque se ha llevado a cabo mucho trabajo en estos años, es necesaria todavía mucha investigación para afrontar algunos de los principales retos de los DNA-chips.

    En el transcurso de esta tesis doctoral, se ha llevado a cabo el desarrollo un proceso tecnológico común para la fabricación de DNA-chips multifunción (i.e. sistemas versátiles basados en PCR y electroforesis), poniendo un especial énfasis en la compatibilidad con los procesos CMOS estándar, a fin de conseguir desarrollar prototipos proto-industriales. Como demostrador de esta puesta a punto tecnológica, se han diseñado, fabricado y testado chips de PCR, y la PCR en chips ha sido optimizada con respecto a materiales de fabricación, metodologías de inserción/extracción, composición bioquímica de la mix de PCR, diferentes configuraciones de calentadores/sensores (Peltier/termopares vs. resistencias integradas) y la cinética de la reacción.

    --------------------------------------------------

    In the last decade of the twentieth century, the fields of µ-TAS and, more specifically, DNA-chips have acquired increasing importance in the microsystems arena. The main reason for this surge of interest lies in the advantages these new devices seek to bring forth: faster, cheaper and completely automated analyses, and also in the outbreak of novel analytical techniques (e.g. hybridization chips). In the particular case of DNA-chips, functional prototypes have been demonstrated for PCR, LCR, gel electrophoresis, di-electrophoresis, hybridization and various combinations of these techniques, whilst hybridization chips (mainly arrayer chips) have become a successful market application. But, even though a considerable amount of work has been carried out in these few years, much research is still required to address fundamental problems of DNA-chips.

    In this doctoral work, a common-ground technological setup for the production of multifunction DNA-chips (i.e. PCR plus electrophoresis systems) has been laid down, placing strong emphasis in its compatibility with standard CMOS processes in order to produce proto-industrial prototypes. As a demonstrator of this technological setup, PCR-chips have been designed, manufactured and tested, and the chip PCR reaction has been optimized with respect to surface materials, insertion and extraction methods, biochemical mix composition, heater/sensor setups (Peltier/thermocouple vs. thin-film driven systems) and reaction kinetics.

    Documents ADVERTIMENT. La consulta d'aquesta tesi queda condicionada a l'acceptació de les següents condicions d'ús.

    La difusió d'aquesta tesi per mitjà del servei TDX ha estat autoritzada pels titulars dels drets de propietat intel.lectual únicament per a usos privats emmarcats en activitats d'investigació i docència. No s'autoritza la seva reproducció amb finalitats de lucre ni la seva difusió i posada a disposició des d'un lloc aliè al servei TDX. No s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing).

    Aquesta reserva de drets afecta tant al resum de presentació de la tesi com als seus continguts. En la utilització o cita de parts de la tesi és obligat indicar el nom de la persona autora.

  • ies01de35.pdf
  • ies02de35.pdf
  • ies03de35.pdf
  • ies04de35.pdf
  • ies05de35.pdf
  • ies06de35.pdf
  • ies07de35.pdf
  • ies08de35.pdf
  • ies09de35.pdf
  • ies10de35.pdf
  • ies11de35.pdf
  • ies12de35.pdf
  • ies13de35.pdf
  • ies14de35.pdf
  • ies15de35.pdf
  • ies16de35.pdf
  • ies17de35.pdf
  • ies18de35.pdf
  • ies19de35.pdf
  • ies20de35.pdf
  • ies21de35.pdf
  • ies22de35.pdf
  • ies23de35.pdf
  • ies24de35.pdf
  • ies25de35.pdf
  • ies26de35.pdf
  • ies27de35.pdf
  • ies28de35.pdf
  • ies29de35.pdf
  • ies30de35.pdf
  • ies31de35.pdf
  • ies32de35.pdf
  • ies33de35.pdf
  • ies34de35.pdf
  • ies35de35.pdf
  • NOVA CERCA
    Organization:UAB Author:Erill,Sagalés,Ivan URN:http://www.tdx.cat/TDX-0602103-181756 Title:High-speed Polymerase chain reaction in CMOS-compatible chips Department:401 - DEPARTAMENT D'INFORMATICA Subject:CDU68 Advisor:Aguiló Llobet, Jordi. Director de la Tesi Advisor:Barbé Garcia, Jordi. Director de la Tesi Keywords:Silici Keywords:PCR Keywords:Chip DefenseDate:29-11-2002