Web of Science: 5 cites, Scopus: 4 cites, Google Scholar: cites
MamPol : a database of nucleotide polymorphism in the Mammalia class
Egea Sánchez, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i Microbiologia)
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i Microbiologia)
Fernández del Castillo, Enol (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura d'Ordinadors i Sistemes Operatius)
Senar Rosell, Miquel Àngel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura d'Ordinadors i Sistemes Operatius)
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i Microbiologia)

Data: 2006
Resum: Multi-locus and multi-species nucleotide diversity studies would benefit enormously from a public database encompassing high-quality haplotypic sequences with their associated genetic diversity measures. MamPol, 'Mammalia Polymorphism Database', is a website containing all the well-annotated polymorphic sequences available in GenBank for the Mammalia class grouped by name of organism and gene. Diversity measures of single nucleotide polymorphisms are provided for each set of haplotypic homologous sequences, including polymorphism at synonymous and non-synonymous sites, linkage disequilibrium and codon bias. Data gathering, calculation of diversity measures and daily updates are automatically performed using PDA software. The MamPol website includes several interfaces for browsing the contents of the database and making customizable comparative searches of different species or taxonomic groups. It also contains a set of tools for simple re-analysis of the available data and a statistics section that is updated daily and summarizes the contents of the database. MamPol is available at and can be downloaded via FTP.
Nota: Número d'acord de subvenció MICYT/BES-2003-0416
Nota: Número d'acord de subvenció MEC/BFU2006-08640/BMC
Nota: Número d'acord de subvenció MEC/TIN 2004-03388
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/2005FI-00328
Drets: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Llengua: Anglès.
Document: article ; recerca ; publishedVersion
Publicat a: Nucleic Acids Research, Vol. 35, Issue suppl. 1 (January 2007) , p. D624-D629, ISSN 0305-1048

PMID: 17142236
DOI: 10.1093/nar/gkl833


6 p, 331.8 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats

 Registre creat el 2017-12-20, darrera modificació el 2019-05-22



   Favorit i Compartir