Brain metabolic pattern analysis using a magnetic resonance spectra classification software in experimental stroke
Jiménez Xarrié, Elena (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Dàvila Huerta, Myriam (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Candiota Silveira, Ana Paula (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Delgado Mederos, Raquel (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Ortega Martorell, Sandra (Liverpool John Moores University. Department of Applied Mathematics)
Julià Sapé, Ma. Margarita (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Arús i Caraltó, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Martí-Fàbregas, Joan (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau)
Universitat Autònoma de Barcelona

Data:	2017
Resum:	Magnetic resonance spectroscopy (MRS) provides non-invasive information about the metabolic pattern of the brain parenchyma in vivo. The SpectraClassifier software performs MRS pattern-recognition by determining the spectral features (metabolites) which can be used objectively to classify spectra. Our aim was to develop an Infarct Evolution Classifier and a Brain Regions Classifier in a rat model of focal ischemic stroke using SpectraClassifier. A total of 164 single-voxel proton spectra obtained with a 7 Tesla magnet at an echo time of 12 ms from non-infarcted parenchyma, subventricular zones and infarcted parenchyma were analyzed with SpectraClassifier (). The spectra corresponded to Sprague-Dawley rats (healthy rats, n = 7) and stroke rats at day 1 post-stroke (acute phase, n = 6 rats) and at days 7 ± 1 post-stroke (subacute phase, n = 14). In the Infarct Evolution Classifier, spectral features contributed by lactate + mobile lipids (1. 33 ppm), total creatine (3. 05 ppm) and mobile lipids (0. 85 ppm) distinguished among non-infarcted parenchyma (100% sensitivity and 100% specificity), acute phase of infarct (100% sensitivity and 95% specificity) and subacute phase of infarct (78% sensitivity and 100% specificity). In the Brain Regions Classifier, spectral features contributed by myoinositol (3. 62 ppm) and total creatine (3. 04/3. 05 ppm) distinguished among infarcted parenchyma (100% sensitivity and 98% specificity), non-infarcted parenchyma (84% sensitivity and 84% specificity) and subventricular zones (76% sensitivity and 93% specificity). SpectraClassifier identified candidate biomarkers for infarct evolution (mobile lipids accumulation) and different brain regions (myoinositol content). The online version of this article (doi:10. 1186/s12868-016-0328-x) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Ajuts:	Ministerio de Ciencia e Innovación SAF2011-23870 Ministerio de Economía y Competitividad SAF2014-52332-R
Nota:	Ajuts: EU FEDER funds Redes Temáticas de Investigación Cooperativa Sanitaria RETICS-INVICTUS-RD12/014/0002
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Magnetic resonance spectroscopy ; Metabolomics ; Pattern recognition ; Stroke ; Animal model
Publicat a:	BMC neuroscience, Vol. 18, issue 1 (Jan. 2017) , art. 13, ISSN 1471-2202

Dades de recerca relacionades amb l'article: https://ddd.uab.cat/record/166606
DOI: 10.1186/s12868-016-0328-x
PMID: 28086802

10 p, 1.4 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut de Biotecnologia i de Biomedicina (IBB)
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut de Recerca Sant Pau
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats