Web of Science: 16 cites, Scopus: 17 cites, Google Scholar: cites,
Three-dimensional genomic structure and cohesin occupancy correlate with transcriptional activity during spermatogenesis
Vara, Covadonga (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Paytuví-Gallart, Andreu (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica)
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica)
Garcia, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria)
Salvà Castro, Judith (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Gomez Hernández, Laura (Centro de Investigación del Cáncer)
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica)
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech)
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech)
Fornas, Óscar (Centre de Regulació Genòmica)
Martín Pendas, Alberto (Centro de Investigación del Cáncer)
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica)
Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences)
Martí Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica)
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)

Data: 2019
Resum: Mammalian gametogenesis involves dramatic and tightly regulated chromatin remodeling, whose regulatory pathways remain largely unexplored. Here, we generate a comprehensive high-resolution structural and functional atlas of mouse spermatogenesis by combining in situ chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), RNA sequencing (RNA-seq), and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) of CCCTC-binding factor (CTCF) and meiotic cohesins, coupled with confocal and super-resolution microscopy. Spermatogonia presents well-defined compartment patterns and topological domains. However, chromosome occupancy and compartmentalization are highly re-arranged during prophase I, with cohesins bound to active promoters in DNA loops out of the chromosomal axes. Compartment patterns re-emerge in round spermatids, where cohesin occupancy correlates with transcriptional activity of key developmental genes. The compact sperm genome contains compartments with actively transcribed genes but no fine-scale topological domains, concomitant with the presence of protamines. Overall, we demonstrate how genome-wide cohesin occupancy and transcriptional activity is associated with three-dimensional (3D) remodeling during spermatogenesis, ultimately reprogramming the genome for the next generation.
Nota: Altres ajuts: Agaur SGR468 to M.A.M-R. A.P.-G. is supported by a 'Doctorats Industrials' predoctoral fellowship (AGAUR). H.H. is a Miguel Servet (CP14/00229) researcher funded by the Spanish Institute of Health Carlos III (ISCIII)
Nota: Número d'acord de subvenció EC/H2020/676556
Nota: Número d'acord de subvenció EC/FP7/609989
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/BFU2017-89408-R
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/BFU2017-85926-P
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/CGL2017-83802-P
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/SAF2017-89109-P
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/BES-2015-072924
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/BFU2015-71786-REDT
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/CGL2014-54317-P
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/BFU2013-47736-P
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/SEV-2012-0208
Nota: Número d'acord de subvenció AGAUR/DI2015
Drets: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Llengua: Anglès
Document: article ; recerca ; publishedVersion
Publicat a: Cell reports, Vol. 28, issue 2 (Jul. 2019) , p. 352-367, ISSN 2211-1247

DOI: 10.1016/j.celrep.2019.06.037
PMID: 31291573


26 p, 7.4 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut de Biotecnologia i de Biomedicina (IBB)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats

 Registre creat el 2020-06-03, darrera modificació el 2021-02-21



   Favorit i Compartir