Web of Science: 47 cites, Scopus: 49 cites, Google Scholar: cites,
Extreme genomic erosion after recurrent demographic bottlenecks in the highly endangered Iberian lynx
Abascal, Federico (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas-CNIO (Madrid, Espanya))
Corvelo, Andre. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Cruz, Fernando (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Villanueva-Cañas, J.L. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Vlasova, A. (Centre de Regulació Genòmica)
Marcet-Houben, M. (Centre de Regulació Genòmica)
Martínez-Cruz, B. (Estación Biológica de Doñana)
Cheng, J.Y. (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre)
Prieto, P. (Centre de Regulació Genòmica)
Quesada, V. (Universidad de Oviedo. Instituto Universitario de Oncología)
Quilez, J. (Universitat Pompeu Fabra. Institut de Biologia Evolutiva)
Li, G. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences)
Garcia, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria)
Rubio-Camarillo, M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas-CNIO (Madrid, Espanya))
Frias, L. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Ribeca, P. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Capella-Gutiérrez, S. (Centre de Regulació Genòmica)
Rodríguez, J.M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas-CNIO (Madrid, Espanya))
Câmara, F. (Centre de Regulació Genòmica)
Lowy, E. (Centre de Regulació Genòmica)
Cozzuto, L. (Centre de Regulació Genòmica)
Erb, I. (Centre de Regulació Genòmica)
Tress, M.L. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas-CNIO (Madrid, Espanya))
Rodriguez-Ales, J.L. (Centre de Regulació Genòmica)
Ruiz-Orera, J. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Reverter, F. (Centre de Regulació Genòmica)
Casas-Marce, M. (Estación Biológica de Doñana)
Soriano, L. (Estación Biológica de Doñana)
Arango, J.R. (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular)
Derdak, S. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Galán, B. (Centro de Investigaciones Biológicas Margarita Salas)
Blanc, J. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Gut, M. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Lorente-Galdos, B. (Universitat Pompeu Fabra. Institut de Biologia Evolutiva)
Andrés-Nieto, Marta (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
López-Otín, C. (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular)
Valencia, A. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas-CNIO (Madrid, Espanya))
Gut, I. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
García, J.L. (Centro de Investigaciones Biológicas Margarita Salas)
Guigó, R. (Centre de Regulació Genòmica)
Murphy, W.J. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences)
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Marques-Bonet, Tomas. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Roma, G. (Centre de Regulació Genòmica)
Notredame, C. (Centre de Regulació Genòmica)
Mailund, T. (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre)
Albà, M.M. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Gabaldón, T. (Centre de Regulació Genòmica)
Alioto, T. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Godoy, J.A. (Estación Biológica de Doñana)

Data: 2016
Resum: Background: Genomic studies of endangered species provide insights into their evolution and demographic history, reveal patterns of genomic erosion that might limit their viability, and offer tools for their effective conservation. The Iberian lynx (Lynx pardinus) is the most endangered felid and a unique example of a species on the brink of extinction. - Results: ce generate the first annotated draft of the Iberian lynx genome and carry out genome-based analyses of lynx demography, evolution, and population genetics. We identify a series of severe population bottlenecks in the history of the Iberian lynx that predate its known demographic decline during the 20th century and have greatly impacted its genome evolution. We observe drastically reduced rates of weak-to-strong substitutions associated with GC-biased gene conversion and increased rates of fixation of transposable elements. We also find multiple signatures of genetic erosion in the two remnant Iberian lynx populations, including a high frequency of potentially deleterious variants and substitutions, as well as the lowest genome-wide genetic diversity reported so far in any species. -Conclusions: the genomic features observed in the Iberian lynx genome may hamper short- and long-term viability through reduced fitness and adaptive potential. The knowledge and resources developed in this study will boost the research on felid evolution and conservation genomics and will benefit the ongoing conservation and management of this emblematic species.
Nota: Número d'acord de subvenció EC/FP7/264125
Nota: Número d'acord de subvenció ISCIII/PT13/0001/0021
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/SEV-2012-0208
Nota: Número d'acord de subvenció MINECO/SEV-2012-0262
Drets: Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original. Creative Commons
Llengua: Anglès
Document: article ; recerca ; publishedVersion
Matèria: Conservation genomics ; Genetic diversity ; Inbreeding ; Genetic drift ; Lynx
Publicat a: Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 251, ISSN 1474-760X

DOI: 10.1186/s13059-016-1090-1
PMID: 27964752


19 p, 6.2 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut de Biotecnologia i de Biomedicina (IBB)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats

 Registre creat el 2020-06-22, darrera modificació el 2021-05-12



   Favorit i Compartir