Identification of circular RNAs in porcine sperm and evaluation of their relation to sperm motility
Gòdia, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Rocco, Martina (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Rodríguez Gil, Joan Enric (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals)
Balasch, Sam (Grup Gepork S.A.)
Lewis, Craig (PIC Europe)
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals

Data:	2020
Resum:	Circular RNAs (circRNAs) are emerging as a novel class of noncoding RNAs which potential role as gene regulators is quickly gaining interest. circRNAs have been studied in different tissues and cell types across several animal species. However, a thorough characterization of the circRNAome in ejaculated sperm remains unexplored. In this study, we profiled the sperm circRNA catalogue using 40 porcine ejaculates. A complex population of 1,598 circRNAs was shared in at least 30 of the 40 samples. Generally speaking, the predicted circRNAs presented low abundances and were tissue-specific. Around 80% of the circRNAs identified in the boar sperm were reported as novel. Results from abundance correlation between circRNAs and miRNAs together with the prediction of microRNA (miRNA) target sites in circRNAs suggested that circRNAs may act as miRNA sponges. Moreover, we found significant correlations between the abundance of 148 exonic circRNAs and sperm motility parameters. Two of these correlations, involving ssc_circ_1458 and ssc_circ_1321, were confirmed by RT-qPCR using 36 additional samples with extreme and opposite sperm motility values. Our study provides a thorough characterization of circRNAs in sperm and suggests that circRNAs hold potential as noninvasive biomarkers for sperm quality and male fertility.
Ajuts:	Ministerio de Economía y Competitividad AGL2013-44978-R Ministerio de Economía y Competitividad AGL2017-86946-R Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2014/SGR-1528 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017/SGR-1060 Ministerio de Economía y Competitividad SEV-2015-0533 Ministerio de Economía y Competitividad BES-2014-070560
Nota:	Altres ajuts: CERCA Programme/Generalitat de Catalunya
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a:	Scientific reports, Vol. 10 (May 2020) , art. 7985, ISSN 2045-2322

DOI: 10.1038/s41598-020-64711-z
PMID: 32409652

11 p, 2.2 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > CRAG (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats