BCL3 rearrangements in B-cell lymphoid neoplasms occur in two breakpoint clusters associated with different diseases
Carbo-Meix, Anna (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Guijarro, Francesca (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Wang, Luojun (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Grau, Marta (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Royo, Romina (Barcelona Supercomputing Center)
Frigola, Gerard (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Playa-Albinyana, Heribert (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Buhler, Marco M. (University Hospital Zurich (Suïssa))
Clot, Guillem (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Duran-Ferrer, Marti (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Lu, Junyan (European Molecular Biology Laboratory, Heidelberg)
Granada, Isabel (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Baptista, Maria Joao (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Navarro, Jose Tomas (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Espinet, Blanca (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Puiggros, Anna (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Tapia, Gustavo (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol)
Bandiera, Laura (Niguarda Cancer Center)
De Canal, Gabriella (Niguarda Cancer Center)
Bonoldi, Emanuela (Niguarda Cancer Center)
Climent, Fina (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Ribera-Cortada, Inmaculada (Hospital Nostra Senyora de Meritxell (Principat d'Andorra))
Fernandez-Caballero, Mariana (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
De la Banda, Esmeralda (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge)
Do Nascimento, Janilson (Hospital Universitari Joan XXIII de Tarragona)
Pineda, Alberto (Fundació Hospital de l'Esperit Sant)
Vela, Dolors (Hematologia Clínica. Hospital General de Granollers)
Rozman, Maria (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Aymerich, Marta (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Syrykh, Charlotte (Cancer Institute University of Toulouse-Oncopole, France)
Brousset, Pierre (Cancer Institute University of Toulouse-Oncopole, France)
Perera, Miguel (Hospital Universitario de Gran Canaria Dr. Negrín)
Yáñez, Lucrecia (Instituto de Investigación Marqués de Valdecilla)
Ortin, Jesus Xavier (Hematology Department. Hospital Verge de la Cinta)
Tuset, Esperanza (Institut d'Investigació Biomèdica de Girona)
Zenz, Thorsten (University Hospital and University of Zürich)
Cook, James R. (Pathology and Laboratory Medicine Institute. Cleveland Clinic)
Swerdlow, Steven H. (University of Pittsburgh School of Medicine)
Martin-Subero, Jose I. (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Colomer, Dolors (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Matutes, Estella (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona)
Bea, Silvia (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Costa, Dolors (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Nadeu, Ferran (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Campo, Elias (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Medicina
Data: |
2024 |
Resum: |
The t(14;19)(q32;q13) often juxtaposes BCL3 with immunoglobulin heavy chain (IGH) resulting in overexpression of the gene. In contrast to other oncogenic translocations, BCL3 rearrangement (BCL3-R) has been associated with a broad spectrum of lymphoid neoplasms. Here we report an integrative whole-genome sequence, transcriptomic, and DNA methylation analysis of 13 lymphoid neoplasms with BCL3-R. The resolution of the breakpoints at single base-pair revealed that they occur in two clusters at 5' (n=9) and 3' (n=4) regions of BCL3 associated with two different biological and clinical entities. Both breakpoints were mediated by aberrant class switch recombination of the IGH locus. However, the 5' breakpoints (upstream) juxtaposed BCL3 next to an IGH enhancer leading to overexpression of the gene whereas the 3' breakpoints (downstream) positioned BCL3 outside the influence of the IGH and were not associated with its expression. Upstream BCL3-R tumors had unmutated IGHV, trisomy 12, and mutated genes frequently seen in chronic lymphocytic leukemia (CLL) but had an atypical CLL morphology, immunophenotype, DNA methylome, and expression profile that differ from conventional CLL. In contrast, downstream BCL3-R neoplasms were atypical splenic or nodal marginal zone lymphomas (MZL) with mutated IGHV, complex karyotypes and mutated genes typical of MZL. Two of the latter four tumors transformed to a large B-cell lymphoma. We designed a novel fluorescence in situ hybridization assay that recognizes the two different breakpoints and validated these findings in 17 independent tumors. Overall, upstream or downstream breakpoints of BCL3-R are mainly associated with two subtypes of lymphoid neoplasms with different (epi)genomic, expression, and clinicopathological features resembling atypical CLL and MZL, respectively. |
Ajuts: |
"la Caixa" Foundation LCF/PR/HR17/52150017 "la Caixa" Foundation LCF/PR/HR22/52420015 European Commission. Horizon 2020 810287 Agencia Estatal de Investigación PID2021-123054OB-I00 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2021-SGR01172 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2021-SGR-01293
|
Drets: |
Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. |
Llengua: |
Anglès |
Document: |
Article ; recerca ; Versió publicada |
Publicat a: |
Haematologica, Vol. 109 Núm. 2 (february 2024) , p. 493-508, ISSN 1592-8721 |
DOI: 10.3324/haematol.2023.283209
PMID: 37560801
El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca >
Documents dels grups de recerca de la UAB >
Centres i grups de recerca (producció científica) >
Ciències de la salut i biociències >
Institut d'Investigació en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP) >
Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras Articles >
Articles de recercaArticles >
Articles publicats
Registre creat el 2024-03-01, darrera modificació el 2024-11-13