Whole genomes of Amazonian uakari monkeys reveal complex connectivity and fast differentiation driven by high environmental dynamism
Hermosilla-Albala, Núria (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Silva, Felipe E. (Mamirauá Institute for Sustainable Development)
Cuadros-Espinoza, Sebastián (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Fontsere, Claudia (University of Copenhagen)
Valenzuela-Seba, Alejandro (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Pawar, Harvinder (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Gut, Marta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Kelley, Joanna (University of California. Department of Ecology and Evolutionary Biology)
Ruibal-Puertas, Sandra (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Alentorn-Moron, Pol (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))
Faella, Armida (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))
Lizano, Esther (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont)
Pires Farias, Izeni (Universidade Federal do Amazonas. Departamento de Genética)
Hrbek, Tomas (Trinity University. Department of Biology)
Valsecchi, João (Comunidad de Manejo de Fauna Silvestre en la Amazonía y en Latinoamérica-ComFauna)
Gut, Ivo (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Rogers, Jeffrey (Baylor College of Medicine (Houston, Estats Units d'Amèrica). Department of Molecular and Human Genetics)
Farh, Kyle (Illumina Artificial Intelligence Laboratory (San Diego, USA))
Kuderna, Lukas (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))
Marquès i Bonet, Tomàs 1975- (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont)
Boubli, Jean (University of Salford)

Data:	2024
Resum:	Despite showing the greatest primate diversity on the planet, genomic studies on Amazonian primates show very little representation in the literature. With 48 geolocalized high coverage whole genomes from wild uakari monkeys, we present the first population-level study on platyrrhines using whole genome data. In a very restricted range of the Amazon rainforest, eight uakari species (Cacajao genus) have been described and categorized into the bald and black uakari groups, based on phenotypic and ecological differences. Despite a slight habitat overlap, we show that posterior to their split 0. 92 Mya, bald and black uakaris have remained independent, without gene flow. Nowadays, these two groups present distinct genetic diversity and group-specific variation linked to pathogens. We propose differing hydrology patterns and effectiveness of geographic barriers have modulated the intra-group connectivity and structure of bald and black uakari populations. With this work we have explored the effects of the Amazon rainforest's dynamism on wild primates' genetics and increased the representation of platyrrhine genomes, thus opening the door to future research on the complexity and diversity of primate genomics.
Ajuts:	European Commission 864203 Agencia Estatal de Investigación PID2021-126004NB-I00 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2021/SGR-00177 European Commission 801505 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca FI_00040
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a:	Communications Biology, Vol. 7 (October 2024) , art. 1283, ISSN 2399-3642

DOI: 10.1038/s42003-024-06901-3
PMID: 39379612

14 p, 1.9 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont (ICP)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats