The landscape of long noncoding RNA expression in the goat brain
Varela-Martínez, Endika (Universidad del País Vasco)
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
López Béjar, Manel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
Casas Díaz, Encarna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
Olvera-Maneu, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
Gardela Santacruz, Jaume (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
Palomo Peiró, María Jesús (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals)
Osuagwuh, Uchebuchi Ike (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals)
Ohaneje, Uchechi Linda (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals)
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments

Data:	2024
Descripció:	17 pàg.
Resum:	The brain regulates multiple metabolic processes, such as food intake, energy expenditure, insulin secretion, hepatic glucose production, and glucose and fatty acid metabolism in adipose tissue, which are fundamental for the maintenance of energy and glucose homeostasis during lactation and pregnancy. In addition, brain expression has a fundamental impact on the development of maternal behavior. Although brain functions are partly regulated by long noncoding RNAs (lncRNAs), their expression profiles have not been characterized in depth in any ruminant species. We have sequenced the transcriptome of 12 brain tissues from 3 goats that were 1 mo pregnant and 4 nonpregnant goats to investigate their lncRNA expression patterns. Between 4,363 (adenohypophysis) and 4,604 (olfactory bulb) lncRNAs were expressed in brain tissues, leading us to establish a set of 794 already annotated lncRNAs and 5,098 novel lncRNA candidates. The detected lncRNAs shared features with those of other mammals, and tissue-specific lncRNAs were enriched in brain development-related terms. Differential expression analyses between goats that were 1 mo pregnant and nonpregnant goats showed that the lncRNA expression profiles of certain brain regions experience substantial changes associated with early pregnancy (238 lncRNAs are differentially expressed in the olfactory bulb), but others do not. Enrichment analysis showed that differentially expressed lncRNAs from the olfactory bulb are co-expressed with genes previously linked to behavioral changes related to pregnancy. These findings provide a first characterization of the landscape of lncRNA expression in the goat brain and provides valuable clues to understand the molecular events triggered by early pregnancy in the central nervous system.
Ajuts:	Agencia Estatal de Investigación PID2019-105805RB-I00 Agencia Estatal de Investigación PID2022-136834OB-I00 Ministerio de Ciencia e Innovación CEX2019-000902-S Agencia Estatal de Investigación BES-2017-079709
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Encephalon ; Goat ; Lncrna ; Pregnant ; RNA-seq
Publicat a:	Journal of dairy science, Vol. 107 Núm. 6 (2024) , p. 4075-4091, ISSN 1525-3198

DOI: 10.3168/jds.2023-23966
PMID: 38278299

17 p, 2.7 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > CRAG (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats