Agent-based model for tumor-analysis using Python+Mesa
Tashakor, Ghazal (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius)
Suppi, Remo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius)

Publicació:	Rende: CAL-TEK, 2018
Descripció:	7 pàg.
Resum:	The potential power provided and possibilities presented by computation graphs has steered most of the available modeling techniques to re-implementing, utilization and including the complex nature of System Biology (SB). To model the dynamics of cellular population, we need to study a plethora of scenarios ranging from cell differentiation to tumor growth and etcetera. Test and verification of a model in research means running the model multiple times with different or in some cases identical parameters, to see how the model interacts and if some of the outputs would change regarding different parameters. In this paper, we will describe the development and implementation of a new agent-based model using Python. The model can be executed using a development environment (based on Mesa, and extremely simplified for convenience) with different parameters. The result is collecting large sets of data, which will allow an in-depth analysis in the microenvironment of the tumor by the means of network analysis.
Ajuts:	Agencia Estatal de Investigación TIN2017-84875-P Ministerio de Economía y Competitividad TIN2014-53172-P
Drets:	Aquest material està protegit per drets d'autor i/o drets afins. Podeu utilitzar aquest material en funció del que permet la legislació de drets d'autor i drets afins d'aplicació al vostre cas. Per a d'altres usos heu d'obtenir permís del(s) titular(s) de drets.
Llengua:	Anglès
Document:	Capítol de llibre ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Agent-based models ; Graph ; Python ; Simulation modeling ; System Biology
Publicat a:	30th European Modeling and Simulation Symposium (EMSS), 2018, p. 248-254, ISBN 9781510872240

7 p, 250.7 KB

Disponible a partir de: 2100-01-01

El registre apareix a les col·leccions:
Llibres i col·leccions > Capítols de llibres