Bioinformatics pipeline development for integrative transcriptomic analysis across cell lines exposed to NPLs
Egea, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Gutiérrez-García, Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Marcos Dauder, Ricardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Hernández Bonilla, Alba (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)

Data:	2024
Resum:	Humans are exposed to Nanoplastics (NPLs), although there is evidence about NPLs internalization, there is limited information on the potential impact on human health. Transcriptomic analyses allow to measure the biological response of NPLs exposure through the comparison of gene expression levels between different samples under different conditions. Several analyses evaluating different types of nanoparticles, exposure times and coexposures have been performed. As NPLs inhalation and ingestion are a mayor way of human exposure, the analyses have been performed on cells lines related to gastrointestinal and respiratory tract barriers. A bioinformatic pipeline has been developed to analyze the transcriptomic results enabling the identification of Differentially Expressed Genes (DEGs) or Overrepresented pathways for each analysis. The molecular mechanisms altered during the biological response will be unveiled, allowing data-driven selection of the most appropriate functional analysis for their validation. The combination of all these results into an integrative analysis will provide a list of common genes or pathways from the NPLs exposure response. Therefore, it will be possible to select potential biomarkers to facilitate decision-makers to evaluate the risk of NPLs for humans or to biomonitoring.
Ajuts:	European Commission 965196 Agencia Estatal de Investigación PID2020-116789RB-C43 Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2021/SGR-00731
Nota:	Els autors formen part del Grup de Mutagènesi Projecte Plasticheal.
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Pòster de congrés ; recerca
Matèria:	Nanoplastic particle ; Bioinformatics ; Transcriptomics
Publicat a:	XI Jornada científica del Departament de Genètica i de Microbiologia. Bellaterra, Catalunya, : 2024

1 p, 2.7 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Contribucions a jornades i congressos > Pòsters