Articles

Articles 21 registres trobats  anterior11 - 20següent  anar al registre: La cerca s'ha fet en 0.01 segons. 
11.
2 p, 152.1 KB MGDB : crossing the marker genes of a user microarray with a database of public-microarrays marker genes / Huerta Casado, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Munyi, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria) ; Expósito Pérez, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria) ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología)
Summary: The microarrays performed by scientific teams grow exponentially. These microarray data could be useful for researchers around the world, but unfortunately they are underused. To fully exploit these data, it is necessary (i) to extract these data from a repository of the high-throughput gene expression data like Gene Expression Omnibus (GEO) and (ii) to make the data from different microarrays comparable with tools easy to use for scientists. [...]
2013 - 10.1093/bioinformatics/btu109
Bioinformatics, Vol. 30, issue 12 (June 2014) , p. 1780-1781, p. 1780-1781  
12.
4 p, 2.6 MB MultitaskProtDB : a database of multitasking proteins / Hernández, Sergio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Ferragut, Gabriela (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Amela Abellan, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Pérez-Pons, Josep A (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Piñol Ribas, Jaume (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Mozo-Villarias, Angel (Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental) ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
We have compiled MultitaskProtDB, available online at , to provide a repository where the many multitasking proteins found in the literature can be stored. Multitasking or moonlighting is the capability of some proteins to execute two or more biological functions. [...]
2013 - 10.1093/nar/gkt1153
Nucleic acids research, Vol. 42, Database issue D517-D520 (2014)  
13.
12 p, 5.7 MB Intracellular CXCR4 + cell targeting with T22-empowered protein-only nanoparticles / Unzueta Elorza, Ugutz (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Céspedes, María Virtudes (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Ferrer-Miralles, Neus (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Casanova Rigat, Isolda (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Laboratory of Immunology, Regional Norte, Universidad de la Republica, Salto, Uruguay) ; Corchero Nieto, José Luis (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Domingo-Espin, Joan (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Villaverde Corrales, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Mangues, Ramon 1957- (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Vázquez Gómez, Esther (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia
Cell-targeting peptides or proteins are appealing tools in nanomedicine and innovative medicines because they increase the local drug concentration and reduce potential side effects. CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) is a cell surface marker associated with several severe human pathologies, including colorectal cancer, for which intracellular targeting agents are currently missing. [...]
2012 - 10.2147/IJN.S34450
International Journal of Nanomedicine, Vol. 7 (august 2012) , p. 4533-4544  
14.
5 p, 243.9 KB Biological activities of histidine-rich peptides; merging biotechnology and nanomedicine / Ferrer-Miralles, Neus (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Corchero Nieto, José Luis (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Kumar, Pradeep (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology) ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República (Uruguay).) ; Gupta, Kailash C.. (CSIR-Indian Institute of Toxicology Research) ; Villaverde Corrales, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Vázquez Gómez, Esther (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Histidine-rich peptides are commonly used in recombinant protein production as purification tags, allowing the one-step affinity separation of the His-tagged proteins from the extracellular media or cell extracts. [...]
2011 - 10.1186/1475-2859-10-101
Microbial cell factories, Vol. 10 (2011) , art. 101  
15.
11 p, 1.3 MB Gene ontology function prediction in Mollicutes using protein-protein association networks / Gómez, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Amela Abellan, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Planas, Antoni (Universitat Ramon Llull. Institut Químic de Sarrià-IQS) ; Piñol Ribas, Jaume (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Many complex systems can be represented and analysed as networks. The recent availability of large-scale datasets, has made it possible to elucidate some of the organisational principles and rules that govern their function, robustness and evolution. [...]
2011 - 10.1186/1752-0509-5-49
BMC systems biology, Vol. 5 (April 2011) , art. 49  
16.
8 p, 741.7 KB PCOPGene-Net : holistic characterisation of cellular states from microarray data based on continuous and non-continuous analysis of gene-expression relationships / Huerta Casado, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Peña, Dario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Rodriguez, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Microarray technology is so expensive and powerful that it is essential to extract maximum value from microarray data, specially from large-sample-series microarrays. Our web tools attempt to respond to these researchers' needs by facilitating the possibility to test and formulate from a hypothesis to entire models under a holistic point of view. [...]
2009 - 10.1186/1471-2105-10-138
BMC bioinformatics, Vol. 10 (2009) , art. 138  
17.
7 p, 953.8 KB NCR-PCOPGene : An Exploratory Tool for Analysis of Sample-Classes Effect on Gene-Expression Relationships / Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Huerta Casado, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular
Background. Microarray technology is so expensive and powerful that it is essential to extract maximum value from microarray data. Our tools allow researchers to test and formulate from a hypothesis to entire models. [...]
2008 - 10.1155/2008/789026
Advances in bioinformatics, Vol. 2008 (Desember 2008) , art. 789026  
18.
8 p, 354.0 KB Pathogen Proteins Eliciting Antibodies Do Not Share Epitopes with Host Proteins : A Bioinformatics Approach / Amela Abellan, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Querol Murillo, Enrique (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular
The best way to prevent diseases caused by pathogens is by the use of vaccines. The advent of genomics enables genome-wide searches of new vaccine candidates, called reverse vaccinology. The most common strategy to apply reverse vaccinology is by designing subunit recombinant vaccines, which usually generate an humoral immune response due to B-cell epitopes in proteins. [...]
2007 - 10.1371/journal.pone.0000512
PloS one, Vol. 2 (June 2007) , p. e512  
19.
22 p, 271.8 KB Sheltering DNA in self-organizing, protein-only nano-shells as artificial viruses for gene delivery / Unzueta Elorza, Ugutz (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Saccardo, Paolo (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Domingo-Espin, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República (Uruguai). Laboratorio de Inmunologia) ; Cuchillo-Solé, O. (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Garcia-Fruitos, Elena (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Céspedes, María Virtudes (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Corchero Nieto, José Luis (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Daura i Ribera, Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Mangues, Ramon 1957- (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Ferrer-Miralles, Neus (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Villaverde Corrales, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Vázquez Gómez, Esther (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
By recruiting functional domains supporting DNA condensation, cell binding, internalization, endosomal escape and nuclear transport, modular single-chain polypeptides can be tailored to associate with cargo DNA for cell-targeted gene therapy. [...]
2014 - 10.1016/j.nano.2013.11.006
Nanomedicine, Vol. 10, issue 3 (april 2014) , p. 535-541  
20.
30 p, 8.7 MB In vivo architectonic stability of fully de novo designed protein-only nanoparticles / Céspedes, María Virtudes (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Unzueta Elorza, Ugutz (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Tatkiewicz, Witold (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Sánchez Chardi, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Microscòpia) ; Conchillo-Solé, Oscar (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Álamo, Patricia (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Xu, Zhikun (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Casanova Rigat, Isolda (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Corchero Nieto, José Luis (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Pesarrodona Roches, Mireia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República (Uruguai). Laboratorio de Inmunologia) ; Daura i Ribera, Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Ratera Bastardas, Imma (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Veciana i Miró, Jaume (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ; Ferrer-Miralles, Neus (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Vázquez Gómez, Esther (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Villaverde Corrales, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Mangues, Ramon 1957- (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina)
The fully de novo design of protein building blocks for self-assembling as functional nanoparticles is a challenging task in emerging nanomedicines, which urgently demand novel, versatile, and biologically safe vehicles for imaging, drug delivery, and gene therapy. [...]
2014 - 10.1021/nn4055732
ACS nano, Vol. 8, Num. 5 (May 2014) , p. 4166-4176  

Articles : 21 registres trobats   anterior11 - 20següent  anar al registre:
Us interessa rebre alertes sobre nous resultats d'aquesta cerca?
Definiu una alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al canal RSS.