|
11.
|
|
|
12.
|
|
11 p, 1.8 MB |
Chromosomal evolution in Raphicerus antelope suggests divergent X chromosomes may drive speciation through females, rather than males, contrary to Haldane's rule
/
Robinson, Terence J. (Stellenbosch University. Department of Botany and Zoology) ;
Cernohorska, Halina (Veterinary Research Institute) ;
Kubickova, Svatava (Veterinary Research Institute) ;
Vozdova, Miluse (Veterinary Research Institute) ;
Musilova, Petra (Veterinary Research Institute) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí"
Chromosome structural change has long been considered important in the evolution of post-zygotic reproductive isolation. The premise that karyotypic variation can serve as a possible barrier to gene flow is founded on the expectation that heterozygotes for structurally distinct chromosomal forms would be partially sterile (negatively heterotic) or show reduced recombination. [...]
2021 -  10.1038/s41598-021-82859-0
Scientific reports, Vol. 11 (February 2021) , art. 3152
|
|
|
13.
|
|
9 p, 319.1 KB |
Whole genome sequencing identifies allelic ratio distortion in sperm involving genes related to spermatogenesis in a swine model
/
Gòdia, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Rodríguez Gil, Joan Enric (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Castelló Farré, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia
Transmission Ratio Distortion (TRD), the uneven transmission of an allele from a parent to its offspring, can be caused by allelic differences affecting gametogenesis, fertilization or embryogenesis. [...]
2020 - 10.1093/dnares/dsaa019
DNA research, Vol. 27, Issue 5 (October 2020) , art. dsaa019
|
|
|
14.
|
|
13 p, 1.3 MB |
Chromosomal differentiation in genetically isolated populations of the marsh-specialist crocidura suaveolens (Mammalia : Soricidae)
/
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Biedma, Luis (Universidad de Huelva. Departamento de Ciencias Integradas) ;
Calzada, Javier (Universidad de Huelva. Departamento de Ciencias Integradas) ;
Román, Jacinto (Estación Biológica de Doñana) ;
Lozano, Alberto, 1966- (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cortés, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Godoy, José A. (Estación Biológica de Doñana) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
The genus Crocidura represents a remarkable model for the study of chromosome evolution. This is the case of the lesser white-toothed shrew (Crocidura suaveolens), a representative of the Palearctic group. [...]
2020 - 10.3390/genes11030270
Genes, Vol. 11, issue 3 (March 2020) , art. 270
|
|
|
15.
|
|
19 p, 6.2 MB |
Extreme genomic erosion after recurrent demographic bottlenecks in the highly endangered Iberian lynx
/
Abascal, Federico (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Corvelo, André (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Cruz, Fernando (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Villanueva-Cañas, J. L. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marcet-Houben, Marina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martínez-Cruz, B. (Estación Biológica de Doñana) ;
Cheng, J. Y. (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Prieto, P. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Quesada, V. (Universidad de Oviedo. Instituto Universitario de Oncología) ;
Quilez, J. (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Li, G. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Rubio-Camarillo, M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Frias, Leonor (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Ribeca, Paolo (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Capella-Gutiérrez, Salvador (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rodríguez, J. M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Câmara, F. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lowy, Ernesto (Centre de Regulació Genòmica) ;
Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica) ;
Erb, I. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Tress, M. L. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Rodriguez-Ales, J. L. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Orera, J. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Reverter, F. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Casas-Marce, M. (Estación Biológica de Doñana) ;
Soriano, L. (Estación Biológica de Doñana) ;
Arango, Javier R (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ;
Derdak, Sophia (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Galán, Beatriz (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ;
Blanc, Julie (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Gut, Marta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Lorente-Galdos, Belen (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Andrés Nieto, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
López-Otín, C. (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ;
Valencia, A. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Gut, I. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
García, J. L. (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ;
Guigó, R. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Murphy, W. J. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Marques-Bonet, Tomas. 1975- (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Roma, Guglielmo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Notredame, C. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mailund, Thomas (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Albà, M. Mar (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica) ;
Alioto, Tyler Scott (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Godoy, J. A. (Estación Biológica de Doñana)
Background: Genomic studies of endangered species provide insights into their evolution and demographic history, reveal patterns of genomic erosion that might limit their viability, and offer tools for their effective conservation. [...]
2016 - 10.1186/s13059-016-1090-1
Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 251
|
|
|
16.
|
|
5 p, 788.2 KB |
Great ape genetic diversity and population history
/
Prado-Martinez, Javier (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Sudmant, Peter H. (Department of Genome Sciences. University of Washington) ;
Kidd, Jeffrey (Department of Genetics. Stanford University) ;
Li, Heng (Department of Genetics. Harvard Medical School, Boston) ;
Kelley, Joanna (Department of Genetics. Stanford University) ;
Lorente-Galdos, Belen (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Veeramah, Krishna (Arizona Research Laboratories. Division of Biotechnology. University of Arizona) ;
Woerner, August (Arizona Research Laboratories. Division of Biotechnology. University of Arizona) ;
O'Connor, Timothy (Department of Genome Sciences. University of Washington) ;
Santpere, Gabriel (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Cagan, Alexander (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology. Department of Evolutionary Genetics) ;
Theunert, Christoph (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology. Department of Evolutionary Genetics) ;
Casals, Ferran (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Laayouni, Hafid (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Munch Terkelsen, Kasper (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Hobolth, Asger (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Halager, Anders E. (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Malig, Maika (Department of Genome Sciences. University of Washington) ;
Hernandez-Rodriguez, Jessica (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Hernando-Herraez, Irene (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Prüfer, Kay (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology. Department of Evolutionary Genetics) ;
Pybus, Marc (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Johnstone, Laurel (Arizona Research Laboratories. Division of Biotechnology. University of Arizona) ;
Lachmann, Michael (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology. Department of Evolutionary Genetics) ;
Alkan, Can (Bilkent University. Faculty of Engineering) ;
Twigg, Dorina (Department of Human Genetics. University of Michigan) ;
Petit Marty, Natalia (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Baker, Carl (Department of Genome Sciences. University of Washington) ;
Hormozdiari, Fereydoun (University of Washington. Department of Genome Sciences) ;
Fernández, Marcos (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Dabad, Marc (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Wilson, Michael L. (Department of Anthropology. University of Minnesota) ;
Stevison, Laurie (Institute for Human Genetics. University of California San Francisco) ;
Camprubí Sánchez, Cristina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Carvalho, Tiago (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Vives, Laura T. (Department of Genome Sciences. University of Washington) ;
Mele, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Abelló, María Teresa. (Zoo de Barcelona) ;
Kondova, Ivanela (Biomedical Primate Research Centre) ;
Bontrop, Ronald (Biomedical Primate Research Centre) ;
Pusey, Anne E (Duke University. Department of Evolutionary Anthropology) ;
Lankester, Felix (Washington State University. Paul G. Allen School for Global Animal Health) ;
Kiyang, John A. (Limbe Wildlife Centre) ;
Bergl, Richard A. (North Carolina Zoological Park) ;
Lonsdorf, E. (Franklin and Marshall College. Department of Psychology) ;
Myers, S. (Oxford University. Department of Statistics) ;
Ventura, M. (University of Bari. Department of Genetics and Microbiology) ;
Gagneux, Pascal (University of California San Diego. Department of Cellular and Molecular Medicine) ;
Comas, D. (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Siegismund, H. (University of Copenhagen Department of Biology, Bioinformatics) ;
Blanc, Julie (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG). PCB) ;
Agueda Calpena, Lidia (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG). PCB) ;
Gut, Marta (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG). PCB) ;
Fulton, L. A (Washington University School of Medicine. Genome Sequencing Center) ;
Tishkoff, S. A. (University of Pennsylvania. Department of Biology and Genetics) ;
Mullikin, J. C. (National Institutes of Health Intramural Sequencing Center (Bethesda, Estats Units d'Amèrica)) ;
Wilson, R. K. (Washington University School of Medicine. Genome Sequencing Center) ;
Gut, I. G. (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG). PCB) ;
Gonder, M. K. (University at Albany) ;
Ryder, O. A. (Genetics Division. San Diego Zoo's Institute for Conservation Research) ;
Hahn, B. H. (University of Pennsylvania. Departments of Medicine and Microbiology) ;
Navarro, Arcadi, 1969- (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Akey, J. M. (University of Washington. Department of Genome Sciences) ;
Bertranpetit, Jaume (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Reich, D. (Harvard Medical School. Department of Genetics) ;
Mailund, Thomas (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Schierup, Mikkel Heide (Aarhus University. Department of Bioscience) ;
Hvilsom, Christina (Copenhagen Zoo) ;
Andrés, A. M. (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology. Department of Evolutionary Genetics) ;
Wall, J. D. (University of California San Francisco. Institute for Human Genetics) ;
Bustamante, Carlos D (Stanford University. Department of Genetics) ;
Hammer, M. F. (University of Arizona. Arizona Research Laboratories. Division of Biotechnology) ;
Eichler, Evan E (Howard Hughes Medical Institute) ;
Marques-Bonet, Tomas 1975- (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Most great ape genetic variation remains uncharacterized; however, its study is critical for understanding population history, recombination, selection and susceptibility to disease. Here we sequence to high coverage a total of 79 wild- and captive-born individuals representing all six great ape species and seven subspecies and report 88. [...]
2013 - 10.1038/nature12228
Nature, Vol. 499, issue 7459 (July 2013) , p. 471-475
|
|
|
17.
|
|
10 p, 3.0 MB |
CENP-A binding domains and recombination patterns in horse spermatocytes
/
Cappelletti, Eleonora (Università degli Studi di Pavia. Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "L. Spallanzani") ;
Piras, Francesca M. (Università degli Studi di Pavia. Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "L. Spallanzani") ;
Badiale, Claudia (Università degli Studi di Pavia. Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "L. Spallanzani") ;
Bambi, Marina (Università degli Studi di Pavia. Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "L. Spallanzani") ;
Santagostino, Marco (Università degli Studi di Pavia. Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "L. Spallanzani") ;
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Masterson, Teri A. (National University of Ireland. Centre for Chromosome Biology) ;
Sullivan, Kevin F. (National University of Ireland. Centre for Chromosome Biology) ;
Nergadze, Solomon G. (Università degli Studi di Pavia. Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "L. Spallanzani") ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Giulotto, Elena (Università degli Studi di Pavia. Dipartimento di Biologia e Biotecnologie "L. Spallanzani")
Centromeres exert an inhibitory effect on meiotic recombination, but the possible contribution of satellite DNA to this "centromere effect" is under debate. In the horse, satellite DNA is present at all centromeres with the exception of the one from chromosome 11. [...]
2019 - 10.1038/s41598-019-52153-1
Scientific reports, Vol. 9, issue 1 (Jan. 2019) , art. 15800
|
|
|
18.
|
|
26 p, 7.4 MB |
Three-dimensional genomic structure and cohesin occupancy correlate with transcriptional activity during spermatogenesis
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Salvà Castro, Judith (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gomez Hernández, Laura (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martín Pendas, Alberto (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica) ;
Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ;
Martí Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Mammalian gametogenesis involves dramatic and tightly regulated chromatin remodeling, whose regulatory pathways remain largely unexplored. Here, we generate a comprehensive high-resolution structural and functional atlas of mouse spermatogenesis by combining in situ chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), RNA sequencing (RNA-seq), and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) of CCCTC-binding factor (CTCF) and meiotic cohesins, coupled with confocal and super-resolution microscopy. [...]
2019 - 10.1016/j.celrep.2019.06.037
Cell reports, Vol. 28, issue 2 (Jul. 2019) , p. 352-367
|
|
|
19.
|
|
15 p, 1.3 MB |
PRDM9 diversity at fine geographical scale reveals contrasting evolutionary patterns and functional constraints in natural populations of house mice
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Capilla Pérez, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Ferretti, Luca (University of Oxford. Big Data Institute) ;
Ledda, Alice (Imperial College London. Department for Infectious Disease Epidemiology) ;
Sánchez Guillén, Rosa Ana (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gabriel, Sofia I. (Universidade de Lisboa. Centro de Estudos do Ambiente e do Mar) ;
Albert Lizandra, Guillermo (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Florit-Sabater, Beatriu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Bello Rodríguez, Judith (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Ventura Queija, Jacinto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Searle, Jeremy B. (Cornell University. Department of Ecology and Evolutionary Biology) ;
Mathias, Maria L. (Universidade de Lisboa. Centro de Estudos do Ambiente e do Mar) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
One of the major challenges in evolutionary biology is the identification of the genetic basis of postzygotic reproductive isolation. Given its pivotal role in this process, here we explore the drivers that may account for the evolutionary dynamics of the PRDM9 gene between continental and island systems of chromosomal variation in house mice. [...]
2019 - 10.1093/molbev/msz091
Molecular biology and evolution, Vol. 36 Núm. 8 (january 2019) , p. 1686-1700
|
|
|
20.
|
|
17 p, 933.8 KB |
Chromosomics : bridging the gap between genomes and chromosomes
/
E. Deakin, Janine (University of Canberra. Institute for Applied Ecology) ;
Potter, Sally (Australian National University) ;
O'Neill, Rachel (University of Connecticut. Institute for Systems Genomics and Department of Molecular and Cell Biology) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
B. Ciof, Marcelo (Universidade Federal de São Carlos) ;
D. B. Eldridge, Mark (Australian Museum Research Institute) ;
Fukui, Kichi (Osaka University. Graduate School of Pharmaceutical Sciences) ;
Marshall Graves, Jennifer A. (University of Canberra. Institute for Applied Ecology) ;
Griffin, Darren (University of Kent. School of Biosciences) ;
Grutzner, Frank (The University of Adelaide. School of Biological Sciences) ;
Kratochvíl, Lukáš (Charles University. Department of Ecology) ;
Miura, Ikuo (Hiroshima University. Amphibian Research Center) ;
Rovatsos, Michail (The University of Adelaide. School of Biological Sciences) ;
Srikulnath, Kornsorn (Kasetsart University. Department of Genetics, Faculty of Science) ;
Wapstra, Erik (University of Tasmania. School of Natural Sciences) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí"
The recent advances in DNA sequencing technology are enabling a rapid increase in the number of genomes being sequenced. However, many fundamental questions in genome biology remain unanswered, because sequence data alone is unable to provide insight into how the genome is organised into chromosomes, the position and interaction of those chromosomes in the cell, and how chromosomes and their interactions with each other change in response to environmental stimuli or over time. [...]
2019 - 10.3390/genes10080627
Genes, Vol. 10 (2019) , p. 1-17
|
|
visitant ::
identificació
alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al 
canal RSS.
