Articles

Articles 22 records found  previous11 - 20next  jump to record: Search took 0.01 seconds. 
11.
16 p, 1.8 MB Increased dosage of AOX1 promoter-regulated expression cassettes leads to transcription attenuation of the methanol metabolism in Pichia pastoris / Cámara, Elena (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Landes, Nils (University of Natural Resources and Life Sciences Vienna) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Gasser, Brigitte (Universität für Bodenkultur Wien) ; Mattanovich, Diethard (Universität für Bodenkultur Wien) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
The methanol-regulated alcohol oxidase promoter (PAOX1) of Pichia pastoris is one of the strongest promoters for heterologous gene expression in this methylotrophic yeast. Although increasing gene dosage is one of the most common strategies to increase recombinant protein productivities, the increase of gene dosage of Rhizopus oryzae lipase (ROL) in P. [...]
2017 - 10.1038/srep44302
Scientific reports, Vol. 7 (2017) , art. 44302  
12.
13 p, 1.7 MB Metabolic flux analysis and the NAD(P)H/NAD(P) + ratios in chemostat cultures of Azotobacter vinelandii / García, Andres (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Castillo, Tania (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia) ; Segura, Daniel (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia) ; Peña, Carlos (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia)
Azotobacter vinelandii is a bacterium that produces alginate and polyhydroxybutyrate (P3HB); however, the role of NAD(P)H/NAD(P) + ratios on the metabolic fluxes through biosynthesis pathways of these biopolymers remains unknown. [...]
2018 - 10.1186/s12934-018-0860-8
Microbial cell factories, Vol. 17 (January 2018) , art. 10  
13.
14 p, 611.6 KB Fine-tuning the P. pastoris iMT1026 genome-scale metabolic model for improved prediction of growth on methanol or glycerol as sole carbon sources / Tomàs Gamisans, Màrius (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
The methylotrophic yeast Pichia pastoris (Komagataella spp. ) is widely used as cell factory for recombinant protein production. In the past recent years, important breakthroughs in the systems-level quantitative analysis of its physiology have been achieved. [...]
2018 - 10.1111/1751-7915.12871
Microbial biotechnology, Vol. 11, Issue 1 (January 2018) , p. 224-237  
14.
13 p, 1.5 MB Use of chemostat cultures mimicking different phases of wine fermentations as a tool for quantitative physiological analysis / Vázquez Lima, Felícitas (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Silva, Paulina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Barreiro Vázquez, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Martínez Moreno, Rubén (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ; Morales, Pilar (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ; Quirós, Manuel (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ; González, Ramón (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
Saccharomyces cerevisiae is the most relevant yeast species conducting the alcoholic fermentation that takes place during winemaking. Although the physiology of this model organism has been extensively studied, systematic quantitative physiology studies of this yeast under winemaking conditions are still scarce, thus limiting the understanding of fermentative metabolism of wine yeast strains and the systematic description, modelling and prediction of fermentation processes. [...]
2014 - 10.1186/1475-2859-13-85
Microbial cell factories, Vol. 13 (June 2014) , art. 85  
15.
24 p, 1.7 MB Integration and Validation of the GenomeScale Metabolic Models of Pichia pastoris : a Comprehensive Update of Protein Glycosylation Pathways, Lipid and Energy Metabolism / Tomàs Gamisans, Màrius (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
Motivation: Genome-scale metabolic models (GEMs) are tools that allow predicting a phenotype from a genotype under certain environmental conditions. GEMs have been developed in the last ten years for a broad range of organisms, and are used for multiple purposes such as discovering new properties of metabolic networks, predicting new targets for metabolic engineering, as well as optimizing the cultivation conditions for biochemicals or recombinant protein production. [...]
2016 - 10.1371/journal.pone.0148031
PloS one, Vol. 11 Núm. 1 (January 2016) , p. 1-24  
16.
19 p, 492.8 KB Quantitative Metabolomics and Instationary 13C-Metabolic Flux Analysis Reveals Impact of Recombinant Protein Production on Trehalose and Energy Metabolism in Pichia pastoris / Jordà Murria, Joel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Cueto Rojas, Hugo (Delft University of Technology. Department of Biotechnology) ; Carnicer Heras, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Wahl, Aljoscha (Delft University of Technology. Department of Biotechnology) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
Pichia pastoris has been recognized as an effective host for recombinant protein production. In this work, we combine metabolomics and instationary 13C metabolic flux analysis (INST 13C-MFA) using GC-MS and LC-MS/MS to evaluate the potential impact of the production of a Rhizopus oryzae lipase (Rol) on P. [...]
2014 - 10.3390/metabo4020281
Metabolites, Vol. 4 (2014) , p. 281-299  
17.
14 p, 1.5 MB Metabolic Flux Analysis during the Exponential Growth Phase of Saccharomyces cerevisiae in Wine Fermentations / Quirós, Manuel (Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ; Martínez Moreno, Rubén (Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Morales, Pilar (Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ; Vázquez Lima, Felícitas (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Barreiro Vázquez, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; González, Ramón (Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino)
As a consequence of the increase in global average temperature, grapes with the adequate phenolic and aromatic maturity tend to be overripe by the time of harvest, resulting in increased sugar concentrations and imbalanced C/N ratios in fermenting musts. [...]
2013 - 10.1371/journal.pone.0071909
PloS one, Vol. 8 Issue 8 (August 2013) , p. e71909  
18.
16 p, 760.8 KB Glucose-methanol co-utilization in Pichia pastoris studied by metabolomics and instationary ¹³C flux analysis / Jordà Murria, Joel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Suárez, Camilo (Delft University of Technology. Department of Biotechnology) ; Carnicer Heras, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; ten Pierick, Angela (Delft University of Technology. Department of Biotechnology) ; Heijnen, Joseph J. (Delft University of Technology. Department of Biotechnology) ; van Gulik, Walter (Delft University of Technology. Department of Biotechnology) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Wahl, Aljoscha (Delft University of Technology. Department of Biotechnology)
Background: Several studies have shown that the utilization of mixed carbon feeds instead of methanol as sole carbon source is beneficial for protein production with the methylotrophic yeast Pichia pastoris. [...]
2013 - 10.1186/1752-0509-7-17
BMC systems biology, Vol. 7, Num. 17 (2013) , p. 1-16
7 documents
19.
10 p, 638.7 KB Quantitative metabolomics analysis of amino acid metabolism in recombinant Pichia pastoris under different oxygen availability conditions / Carnicer Heras, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Ten Pierick, Angela (Delft University of Technology. Department of Biotechnology (Delft, Països Baixos)) ; van Dam, Jan (Delft University of Technology. Department of Biotechnology (Delft, Països Baixos)) ; Heijnen, Joseph J. (Delft University of Technology. Department of Biotechnology (Delft, Països Baixos)) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; van Gulik, Walter (Delft University of Technology. Department of Biotechnology (Delft, Països Baixos)) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
Background: Environmental and intrinsic stress factors can result in the global alteration of yeast physiology, as evidenced by several transcriptional studies. Hypoxia has been shown to have a beneficial effect on the expression of recombinant proteins in Pichia pastoris growing on glucose. [...]
2012 - 10.1186/1475-2859-11-83
Microbial cell factories, Vol. 11, N. 83 (June 2012) , p. 1-10
4 documents
20.
14 p, 772.5 KB Metabolic flux profiling of recombinant protein secreting Pichia pastoris growing on glucose : methanol mixtures / Jordà Murria, Joel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Jouhten, Paula (VTT Technical Research Centre of Finland (Espoo, Finlàndia)) ; Cámara, Elena (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Maaheimo, Hannu (VTT Technical Research Centre of Finland (Espoo, Finlàndia)) ; Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ; Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
Background: The methylotrophic yeast Pichia pastoris has emerged as one of the most promising yeast hosts for the production of heterologous proteins. Mixed feeds of methanol and a multicarbon source instead of methanol as sole carbon source have been shown to improve product productivities and alleviate metabolic burden derived from protein production. [...]
2012 - 10.1186/1475-2859-11-57
Microbial cell factories, Vol. 11, N. 57 (May 2012) , p. 1-14
5 documents

Articles : 22 records found   previous11 - 20next  jump to record:
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.