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14 p, 1.6 MB Exploration of the Drosophila buzzatii transposable element content suggests underestimation of repeats in Drosophila genomes / Rius Camps, Nuria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Guillén Montalbán, Yolanda (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Delprat Obeaga, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Kapusta, Aurélie (University of Utah School of Medicine. Department of Human Genetics) ; Feschotte, Cédric (University of Utah School of Medicine. Department of Human Genetics) ; Ruiz, Alfredo, (Ruiz Panadero) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Many new Drosophila genomes have been sequenced in recent years using new-generation sequencing platforms and assembly methods. Transposable elements (TEs), being repetitive sequences, are often misassembled, especially in the genomes sequenced with short reads. [...]
2016 - 10.1186/s12864-016-2648-8
BMC genomics, Vol. 17 (2016) , art. 344  

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