Resultats globals: 7 registres trobats en 0.02 segons.
Articles, 6 registres trobats
Documents de recerca, 1 registres trobats
Articles 6 registres trobats  
1.
13 p, 1.7 MB Distribution, characteristics, and regulatory potential of long noncoding RNAs in brown-rot fungi / Borgognone, Alessandra (Sequentia Biotech) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ; Castanera, Raúl (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Long noncoding RNAs have been thoroughly studied in plants, animals, and yeasts, where they play important roles as regulators of transcription. Nevertheless, almost nothing is known about their presence and characteristics in filamentous fungi, especially in basidiomycetes. [...]
2019 - 10.1155/2019/9702342
International journal of genomics, Vol. 2019 (May 2019) , art. 9702342  
2.
26 p, 7.4 MB Three-dimensional genomic structure and cohesin occupancy correlate with transcriptional activity during spermatogenesis / Vara, Covadonga (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Paytuví-Gallart, Andreu (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ; Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ; Garcia, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ; Salvà Castro, Judith (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Gomez Hernández, Laura (Centro de Investigación del Cáncer) ; Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ; Fornas, Óscar (Centre de Regulació Genòmica) ; Martín Pendas, Alberto (Centro de Investigación del Cáncer) ; Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica) ; Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ; Martí Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica) ; Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cellular, Fisiologia i Immunologia)
Mammalian gametogenesis involves dramatic and tightly regulated chromatin remodeling, whose regulatory pathways remain largely unexplored. Here, we generate a comprehensive high-resolution structural and functional atlas of mouse spermatogenesis by combining in situ chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), RNA sequencing (RNA-seq), and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) of CCCTC-binding factor (CTCF) and meiotic cohesins, coupled with confocal and super-resolution microscopy. [...]
2019 - 10.1016/j.celrep.2019.06.037
Cell reports, Vol. 28, issue 2 (Jul. 2019) , p. 352-367  
3.
39 p, 1.2 MB Transcriptome analysis of non-ochratoxigenic Aspergillus carbonarius strains and interactions with other ochratoxigenic black aspergilli / Castellà Gómez, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Bragulat, M. Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ; Cabañes Sáenz, Francisco Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
Aspergillus carbonarius consistently produces large amounts of ochratoxin A (OTA), a mycotoxin with nephrotoxic effects on animals and humans. In the present study, we analyzed the transcriptional changes associated to OTA production in three atypical non-ochratoxigenic strains of A. [...]
2020 - 10.1016/j.ijfoodmicro.2019.108498
International Journal of Food Microbiology, Núm. 317 (January 2020)  
4.
7 p, 990.3 KB Rapid genome resequencing of an atoxigenic strain of Aspergillus carbonarius / Cabañes Sáenz, Francisco Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech SL) ; Castellà Gómez, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Bragulat, M. Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ; Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
In microorganisms, Ion Torrent sequencing technology has been proved to be useful in whole-genome sequencing of bacterial genomes (5 Mbp). In our study, for the first time we used this technology to perform a resequencing approach in a whole fungal genome (36 Mbp), a non-ochratoxin A producing strain of Aspergillus carbonarius. [...]
2015 - 10.1038/srep09086
Scientific reports, Vol. 5 (2015) , art. 9086  
5.
9 p, 1.8 MB An improved assembly and annotation of the melon (Cucumis melo L.) reference genome / Ruggieri, Valentino (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Argyris, Jason (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pujol, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Yano, Ryoichi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Nonaka, Satoko (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Ezura, Hiroshi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Latrasse, David (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Boualem, Adnane (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Benhamed, Moussa (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Bendahmane, Abdelhafid (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech SL) ; Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We report an improved assembly (v3. 6. 1) of the melon (Cucumis melo L. ) genome and a new genome annotation (v4. 0). The optical mapping approach allowed correcting the order and the orientation of 21 previous scaffolds and permitted to correctly define the gap-size extension along the 12 pseudomolecules. [...]
2018 - 10.1038/s41598-018-26416-2
Scientific reports, Vol. 8 (May 2018) , art. 8088  
6.
7 p, 976.0 KB Rapid genome resequencing of an atoxigenic strain of Aspergillus carbonarius / Cabañes Sáenz, Francisco Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Castellà Gómez, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Bragulat, M. Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Sánchez, Armand (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL)
In microorganisms, Ion Torrent sequencing technology has been proved to be useful in whole-genome sequencing of bacterial genomes (5 Mbp). In our study, for the first time we used this technology to perform a resequencing approach in a whole fungal genome (36 Mbp), a non-ochratoxin A producing strain of Aspergillus carbonarius. [...]
2015
Scientific reports, Març 2015, p. 1-7  

Documents de recerca 1 registres trobats  
1.
192 p, 7.0 MB Development and application of integrative tools for the functional and structural analyses of genomes / Paytuví Gallart, Andreu, autor ; Ruiz-Herrera Moreno, Aurora, supervisor acadèmic ; Aiese Cigliano, Riccardo, supervisor acadèmic ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia.
Des del desenvolupament de la seqüenciació de Sanger l'any 1977, els avenços tecnològics han revolucionat el camp dels òmiques. Els projectes de seqüenciació a gran escala han generat una enorme quantitat de dades que han motivat el desenvolupament d'eines bioinformàtiques per a la integració, organització i interpretació d'aquestes dades. [...]
Since the development of the Sanger sequencing in 1977, technological advances have revolutionized the -omics field. Large-scale sequencing projects have resulted in the generation of an enormous amount of data that have motivated the development of bioinformatics tools for its integration, organization and interpretation. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2019  

Us interessa rebre alertes sobre nous resultats d'aquesta cerca?
Definiu una alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al canal RSS.