Results overview: Found 5 records in 0.01 seconds.
Articles, 4 records found
Research literature, 1 records found
Articles 4 records found  
1.
39 p, 1.2 MB Transcriptome analysis of non-ochratoxigenic Aspergillus carbonarius strains and interactions with other ochratoxigenic black aspergilli / Castellà Gómez, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Bragulat, M. Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ; Cabañes Sáenz, Francisco Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals)
Aspergillus carbonarius consistently produces large amounts of ochratoxin A (OTA), a mycotoxin with nephrotoxic effects on animals and humans. In the present study, we analyzed the transcriptional changes associated to OTA production in three atypical non-ochratoxigenic strains of A. [...]
2020 - 10.1016/j.ijfoodmicro.2019.108498
International Journal of Food Microbiology, Núm. 317 (January 2020)  
2.
7 p, 990.3 KB Rapid genome resequencing of an atoxigenic strain of Aspergillus carbonarius / Cabañes Sáenz, Francisco Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech SL) ; Castellà Gómez, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Bragulat, M. Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ; Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
In microorganisms, Ion Torrent sequencing technology has been proved to be useful in whole-genome sequencing of bacterial genomes (5 Mbp). In our study, for the first time we used this technology to perform a resequencing approach in a whole fungal genome (36 Mbp), a non-ochratoxin A producing strain of Aspergillus carbonarius. [...]
2015 - 10.1038/srep09086
Scientific reports, Vol. 5 (2015) , art. 9086  
3.
9 p, 1.8 MB An improved assembly and annotation of the melon (Cucumis melo L.) reference genome / Ruggieri, Valentino (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Argyris, Jason (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pujol, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Yano, Ryoichi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Nonaka, Satoko (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Ezura, Hiroshi (University of Tsukuba. Faculty of Life and Environmental Sciences) ; Latrasse, David (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Boualem, Adnane (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Benhamed, Moussa (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Bendahmane, Abdelhafid (University of Evry. Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2)) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ; Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech SL) ; Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We report an improved assembly (v3. 6. 1) of the melon (Cucumis melo L. ) genome and a new genome annotation (v4. 0). The optical mapping approach allowed correcting the order and the orientation of 21 previous scaffolds and permitted to correctly define the gap-size extension along the 12 pseudomolecules. [...]
2018 - 10.1038/s41598-018-26416-2
Scientific reports, Vol. 8 (May 2018) , art. 8088  
4.
7 p, 976.0 KB Rapid genome resequencing of an atoxigenic strain of Aspergillus carbonarius / Cabañes Sáenz, Francisco Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Castellà Gómez, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Bragulat, M. Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ; Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Sánchez, Armand (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei Veterinari de Genètica Molecular) ; Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL)
In microorganisms, Ion Torrent sequencing technology has been proved to be useful in whole-genome sequencing of bacterial genomes (5 Mbp). In our study, for the first time we used this technology to perform a resequencing approach in a whole fungal genome (36 Mbp), a non-ochratoxin A producing strain of Aspergillus carbonarius. [...]
2015
Scientific reports, Març 2015, p. 1-7  

Research literature 1 records found  
1.
192 p, 7.0 MB Development and application of integrative tools for the functional and structural analyses of genomes / Paytuví Gallart, Andreu, autor ; Ruiz-Herrera Moreno, Aurora, supervisor acadèmic ; Aiese Cigliano, Riccardo, supervisor acadèmic ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia.
Des del desenvolupament de la seqüenciació de Sanger l'any 1977, els avenços tecnològics han revolucionat el camp dels òmiques. Els projectes de seqüenciació a gran escala han generat una enorme quantitat de dades que han motivat el desenvolupament d'eines bioinformàtiques per a la integració, organització i interpretació d'aquestes dades. [...]
Since the development of the Sanger sequencing in 1977, technological advances have revolutionized the -omics field. Large-scale sequencing projects have resulted in the generation of an enormous amount of data that have motivated the development of bioinformatics tools for its integration, organization and interpretation. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2019  

Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.