1.
|
11 p, 1.7 MB |
In silico validation of RNA-Seq results can identify gene fusions with oncogenic potential in glioblastoma
/
Hernández, A. (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Muñoz-Mármol, A.M. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Esteve-Codina, A. (Universitat Pompeu Fabra) ;
Alameda, Francesc (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Carrato, C. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Pineda, E. (Institut de Recerca Bimèdica August Pi I Sunyer) ;
Arpí-Lluciá, O. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Martinez-García, M. (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Mallo, M. (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Gut, M. (Universitat Pompeu Fabra) ;
del Barco, S. (Hospital Universitari de Girona Doctor Josep Trueta) ;
Gallego, O. (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Dabad, M. (Universitat Pompeu Fabra) ;
Mesia, C. (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Bellosillo, B. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Domenech, Marta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Vidal, N. (Hospital Universitari de Bellvitge) ;
Aldecoa, I. (Universitat de Barcelona) ;
de la Iglesia, N. (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Balañá, Carmen (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
RNA-Sequencing (RNA-Seq) can identify gene fusions in tumors, but not all these fusions have functional consequences. Using multiple data bases, we have performed an in silico analysis of fusions detected by RNA-Seq in tumor samples from 139 newly diagnosed glioblastoma patients to identify in-frame fusions with predictable oncogenic potential. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-18608-8
Scientific reports (Nature Publishing Group), Vol. 12 Núm. 1 (december 2022) , p. 14439
|
|
2.
|
18 p, 2.0 MB |
A Comparison of RNA-Seq Results from Paired Formalin-Fixed Paraffin-Embedded and Fresh-Frozen Glioblastoma Tissue Samples
/
Esteve-Codina, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Arpi, Oriol (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Martinez-García, Maria (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Pineda, Estela (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Mallo, Mar (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Carrato, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Rovira, Anna (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Lopez, Raquel (Hospital Universitari de Girona Doctor Josep Trueta) ;
Tortosa, Avelina (Universitat de Barcelona, Departament d'Infermeria Fonamental) ;
Dabad, Marc (Centre de Regulació Genòmica) ;
Del Barco, Sonia (Institut Català d'Oncologia) ;
Heath, Simon (Centre de Regulació Genòmica) ;
Bagué Rosell, Sílvia (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Ribalta, Teresa (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Alameda, Francesc (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
de la Iglesia, Nuria (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Balañá, Carmen (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
on behalf of the GLIOCAT Group ;
Glioma Catalonia Group (GLIOCAT) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
The molecular classification of glioblastoma (GBM) based on gene expression might better explain outcome and response to treatment than clinical factors. Whole transcriptome sequencing using next-generation sequencing platforms is rapidly becoming accepted as a tool for measuring gene expression for both research and clinical use. [...]
2017 - 10.1371/journal.pone.0170632
PloS one, 2017, p. 1-18
|
|
3.
|
17 p, 4.8 MB |
ALCAM shedding at the invasive front of the tumor is a marker of myometrial infiltration and promotes invasion in endometrioid endometrial cancer
/
Devis Jauregui, Laura (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Martinez-Garcia, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Moiola, Cristian Pablo (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Quiles, Maria Teresa (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Arbós i Via, Maria Antònia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Stirbat, Tomita Vasilica (Institut Curie) ;
Brochard-Wyart, Françoise (Institut Curie) ;
García, Ángel (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Alonso-Alconada, Lorena (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Abal Posada, Miguel (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Díaz-Feijoo, Berta (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Thomas, William (Department of Natural Sciences, Colby-Sawyer College, New London, New Hampshire, United States of America) ;
Dufour, Sylvie (Present address: Université Paris Est, Faculté de Médecine, Créteil, France, INSERM, U955, Equipe 6, Créteil, France) ;
Mancebo, Gemma (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Alameda, Francesc (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Reventos, Jaume (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gil-Moreno, Antonio 1965- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Colás Ortega, Eva (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Endometrial cancer (EC) is the sixth deadliest cancer in women. The depth of myometrial invasion is one of the most important prognostic factors, being directly associated with tumor recurrence and mortality. [...]
2018 - 10.18632/oncotarget.24625
Oncotarget, Vol. 9 (march 2018) , p. 16648-16664
|
|
4.
|
9 p, 3.4 MB |
Snail1 expression is required for sarcomagenesis
/
Alba-Castellón, Lorena (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Batlle, Raquel (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Francí, Clara (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Fernández-Aceñero, María J. (Hospital Universitario Fundación Jiménez Díaz) ;
Mazzolini, Rocco (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Peña, Raúl (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Loubat, Jordina (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Alameda, Francesc (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Rodríguez, Rufo (Hospital Virgen de la Salud (Toledo)) ;
Curto Navarro, Josué (Universitat Autònoma de Barcelona. Centre d'Estudis en Biofísica) ;
Albanell, Joan (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Munoz, Alberto (Instituto de Investigaciones Biomédicas "Alberto Sols") ;
Bonilla, Félix (Hospital Universitario Puerta de Hierro Majadahonda (Madrid)) ;
Ignacio Casal, J. (Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones Biológicas) ;
Rojo, Federico (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Garcia de Herreros, Antonio (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut)
Snail1 transcriptional repressor is a major inducer of epithelial-to mesenchymal transition but is very limitedly expressed in adult animals. We have previously demonstrated that Snail1 is required for the maintenance of mesenchymal stem cells (MSCs), preventing their premature differentiation. [...]
2014 - 10.1016/j.neo.2014.05.002
Neoplasia (New York, N.Y.), Vol. 16, Issue 5 (May 2014) , p. 413-421
|
|
5.
|
3 p, 369.6 KB |
Confirmen la idoneïtat de la citologia per al cribratge de càncer anal en població d'alt risc
/
Alameda, Francesc (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Lloveras Rubio, Belén (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Iglesias, Mar (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Lloret, A. (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya))
Investigadors de l'Hospital del Mar i de la UAB han realitzat un estudi que constata l'eficàcia d'usar la tècnica de la citologia per detectar i diagnosticar lesions cancerígenes anals en persones d'alt risc. [...] investigadores del Hospital del Mar y de la UAB han realizado un estudio que constata la eficacia de usar la técnica de la citología para detectar y diagnosticar lesiones cancerígenas anales en personas de alto riesgo. [...]
2017
UAB divulga, Novembre 2017, p. 1-3
2 documents
|
|
6.
|
13 p, 5.0 MB |
Constitutive Cyclin O deficiency results in penetrant hydrocephalus, impaired growth and infertility
/
Núnez-Ollé, Marc (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Jung, Carole (Universitat Pompeu Fabra. Laboratori de Fisiologia Molecular) ;
Terré, Berta (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona)) ;
Balsiger, Norman A. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Plata, Cristina (Universitat Pompeu Fabra. Laboratori de Fisiologia Molecular) ;
Roset, Ramon (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Pardo-Pastor, Carlos (Universitat Pompeu Fabra. Laboratori de Fisiologia Molecular) ;
Garrido, Marta (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Rojas, Santiago (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciències Morfològiques) ;
Alameda, Francesc (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Lloreta, Josep 1958- (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Martín-Caballero, Juan (Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona (PRBB)) ;
Flores, Juana M. (Universidad Complutense de Madrid. Departamento de Medicina y Cirugía Animal) ;
Stracker, Travis H. (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona)) ;
Valverde, Miguel A. (Universitat Pompeu Fabra. Laboratori de Fisiologia Molecular) ;
Muñoz, Francisco J. (Universitat Pompeu Fabra. Laboratori de Fisiologia Molecular) ;
Gil-Gómez, Gabriel (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Cyclin O (encoded by CCNO) is a member of the cyclin family with regulatory functions in ciliogenesis and apoptosis. Homozygous CCNO mutations have been identified in human patients with Reduced Generation of Multiple Motile Cilia (RGMC) and conditional inactivation of Ccno in the mouse recapitulates some of the pathologies associated with the human disease. [...]
2017 - 10.18632/oncotarget.21818
Oncotarget, Vol. 8 (october 2017) , p. 99261-99273
|
|
7.
|
9 p, 341.1 KB |
L1CAM expression in endometrial carcinomas : an ENITEC collaboration study
/
van der Putten, Louis J. M. (Department of Obstetrics and Gynaecology, Radboud University Medical Center) ;
Visser, Nicole C. M. (Department of Pathology, Radboud University Medical Center) ;
van de Vijver, Koen (Department of Pathology, Anthoni van Leeuwenhoek Hospital) ;
Santacana, Maria (Institut de Recerca Biomèdica de Lleida) ;
Bronsert, Peter (Institute of Pathology, University Medical Center Freiburg) ;
Bulten, Johan (Department of Pathology, Radboud University Medical Center) ;
Hirschfeld, Marc (German Cancer Consortium (DKTK), German Cancer Research Center (DKFZ)) ;
Colás Ortega, Eva (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gil-Moreno, Antonio 1965- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Garcia, Angel (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Mancebo, Gemma (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Alameda, Francesc (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Trovik, Jone (Haukeland University Hospital (Bergen, Noruega)) ;
Kopperud, Reidun K. (Center for Cancer Biomarkers (CCBIO), University of Bergen) ;
Huvila, Jutta (Department of Pathology, University of Turku) ;
Schrauwen, Stefanie (University Hospitals Gasthuisberg (Leuven, Bélgica)) ;
Koskas, Martin (Department of Obstetrics and Gynecology, Bichat-Claude Bernard Hospital) ;
Walker, Francine (Department of Pathology, Bichat-Claude Bernard Hospital) ;
Weinberger, Vit (Department of Gynecology and Obstetrics, Faculty of Medicine, Masaryk University) ;
Minar, Lubos (Department of Gynecology and Obstetrics, Faculty of Medicine, Masaryk University) ;
Jandakova, Eva (Institute of Pathology, Faculty of Medicine, Masaryk University) ;
Snijders, Marc P. L. M. (Department of Obstetrics and Gynaecology, Canisius-Wilhelmina Hospital) ;
van den Berg-van Erp, Saskia (Department of Pathology, Canisius-Wilhelmina Hospital) ;
Matias-Guiu, Xavier (Institut de Recerca Biomèdica de Lleida) ;
Salvesen, Helga B. (Haukeland University Hospital (Bergen, Noruega)) ;
Amant, Frederic (University Hospitals Gasthuisberg (Leuven, Bélgica)) ;
Massuger, Leon FAG (Department of Obstetrics and Gynaecology, Radboud University Medical Center) ;
Pijnenborg, Johanna M. A. (Department of Obstetrics and Gynaecology, TweeSteden Hospital) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Identification of aggressive endometrioid endometrial carcinomas (EECs) and non-endometrioid carcinomas (NEECs) is essential to improve outcome. L1 cell adhesion molecule (L1CAM) expression is a strong prognostic marker in stage I EECs, but less is known about L1CAM expression in advanced-stage EECs and NEECs. [...]
2016 - 10.1038/bjc.2016.235
British Journal of Cancer, Vol. 115 (08 2016) , p. 716-724
|
|