1.
|
8 p, 2.4 MB |
Cancer Genome Interpreter annotates the biological and clinical relevance of tumor alterations
/
Tamborero, David (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)) ;
Rubio-Perez, Carlota (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)) ;
Deu-Pons, Jordi (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)) ;
Schroeder, Michael P. (Charité-Universitätsmedizin (Germany)) ;
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Rovira, Ana (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)- CIBERONC) ;
Tusquets, Ignasi (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)) ;
Albanell, Joan (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)) ;
Rodón Ahnert, Jordi (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Taberneroo, J (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
de Torres, Carmen (Institut de Recerca Pediàtrica. Hospital Sant Joan de Déu) ;
Dienstmann, Rodrigo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Gonzalez-Perez, Abel (Institut d'Investigació Mèdica Hospital del Mar (IMIM)) ;
Lopez-Bigas, Nuria (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA)) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
While tumor genome sequencing has become widely available in clinical and research settings, the interpretation of tumor somatic variants remains an important bottleneck. Here we present the Cancer Genome Interpreter, a versatile platform that automates the interpretation of newly sequenced cancer genomes, annotating the potential of alterations detected in tumors to act as drivers and their possible effect on treatment response. [...]
2018 - 10.1186/s13073-018-0531-8
Genome Medicine, Vol. 10 (March 2018) , art. 25
|
|
2.
|
9 p, 3.4 MB |
Snail1 expression is required for sarcomagenesis
/
Alba-Castellón, Lorena (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques. Programa de Recerca en Càncer) ;
Batlle, Raquel (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques. Programa de Recerca en Càncer) ;
Francí, Clara (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques. Programa de Recerca en Càncer) ;
Fernández-Aceñero, María J. (Fundación Jiménez Díaz. Servicio de Anatomía Patológica) ;
Mazzolini, Rocco (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques. Programa de Recerca en Càncer) ;
Peña, Raúl (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques. Programa de Recerca en Càncer) ;
Loubat, Jordina (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques. Programa de Recerca en Càncer) ;
Alameda, Francesc (Hospital del Mar. Servei d'Anatomia Patològica) ;
Rodríguez, Rufo (Hospital Virgen de la Salud. Departamento de Patología) ;
Curto Navarro, Josué (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular. Centre d'Estudis en Biofísica) ;
Albanell, Joan (Hospital del Mar. Servei d'Oncologia Mèdica) ;
Muñoz Terol, Alberto (Universidad Autónoma de Madrid. Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Instituto de Investigacioanes Biomédicas) ;
Bonilla, Félix (Hospital Puerta de Hierro. Servicio de Oncología) ;
Ignacio Casal, J. (Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones Biológicas) ;
Rojo, Federico (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques. Programa de Recerca en Càncer) ;
García de Herreros, Antonio (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut)
Snail1 transcriptional repressor is a major inducer of epithelial-to mesenchymal transition but is very limitedly expressed in adult animals. We have previously demonstrated that Snail1 is required for the maintenance of mesenchymal stem cells (MSCs), preventing their premature differentiation. [...]
2014 - 10.1016/j.neo.2014.05.002
Neoplasia (New York, N.Y.), Vol. 16, Issue 5 (May 2014) , p. 413-421
|
|
3.
|
12 p, 2.4 MB |
MET expression and copy number heterogeneity in nonsquamous non-small cell lung cancer (nsNSCLC)
/
Casadevall Aguilar, David (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Gimeno, Javier (Hospital del Mar) ;
Clavé, Sergi (Hospital del Mar) ;
Taus, Álvaro (Hospital del Mar) ;
Pijuan, Lara (Hospital del Mar) ;
Arumí, Miriam (Hospital del Mar) ;
Lorenzo, Marta (Hospital del Mar) ;
Menéndez, Silvia (Hospital del Mar) ;
Cañadas, Israel (Hospital del Mar) ;
Albanell, Joan (Universitat Pompeu Fabra) ;
Serrano, Sergio (Hospital del Mar) ;
Espinet i Solà, Blanca (Hospital del Mar) ;
Salido, Marta (Hospital del Mar) ;
Arriola, Edurne (University of Southampton)
We aimed to assess MET intratumoral heterogeneity and its potential impact on biomarker-based patient selection as well as potential surrogate biomarkers of MET activation. Our study included 120 patients with non-squamous Non-small-cell Lung Cancer (nsNSCLC), of which 47 were incorporated in tissue microarrays (TMA). [...]
2015 - 10.18632/oncotarget.3976
Oncotarget, Vol. 6, Núm. 18 (June 2015) , p. 16215-16226
|
|
4.
|
10 p, 889.8 KB |
Predicting response and survival in chemotherapy-treated triple-negative breast cancer
/
Prat, A (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Lluch, A (Hospital Clínico Universitario de Valencia. Department d'Oncologia Mèdica) ;
Albanell, Joan (Universitat Pompeu Fabra) ;
Barry, W T (Department of Biostatistics and Computational Biology, Dana-Farber Cancer Institute) ;
Fan, C (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ;
Chacón, J I (Hospital Virgen de la Salud) ;
Parker, J S (University of North Carolina. Department of Genetics) ;
Calvo, L (Complexo Hospitalario Universitario de A Coruña) ;
Plazaola, A (Department of Medical Oncology, Onkologikoa) ;
Arcusa, A (Consorci Sanitari de Terrassa. Departament d'Oncologia Mèdica) ;
Seguí-Palmer, M A (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)) ;
Burgues, O (Hospital Clínico Universitario de Valencia) ;
Ribelles, N (Hospital Universitario Virgen de la Victoria) ;
Rodriguez-Lescure, A (Hospital General de Elche) ;
Guerrero, A (Institut Valencià de'Oncologia (IVO)) ;
Ruiz-Borrego, M (Hospital Universitario Virgen del Rocío) ;
Munarriz, B (Hospital Universitario La Fe) ;
López, J A (Hospital San Camilo) ;
Adamo, B (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Cheang, M C U (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ;
Li, Y (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ;
Hu, Z (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ;
Gulley, M L (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ;
Vidal, M J (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pitcher, B N (Alliance Statistical and Data Center, Duke University) ;
Liu, M C (Mayo Clinic. Department of Oncology) ;
Citron, M L (ProHEALTH Care Associates, LLP) ;
Ellis, M J (Washington University. Department of Oncology) ;
Mardis, E (Washington University. Department of Oncology) ;
Vickery, T (Washington University. Department of Oncology) ;
Hudis, C A (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Winer, E P (Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute) ;
Carey, L A (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center,) ;
Caballero, R (Grupo Español de Investigación en Cáncer de Mama) ;
Carrasco, E (Grupo Español de Investigación en Cáncer de Mama) ;
Martín, M (Hospital Universitario Gregorio Marañón. Instituto de Investigación Sanitaria) ;
Perou, C M (University of North Carolina. Department of Pathology and Laboratory Medicine) ;
Alba, Emilio (Hospital Universitario Virgen de la Victoria (Màlaga, Andalusia))
In this study, we evaluated the ability of gene expression profiles to predict chemotherapy response and survival in triple-negative breast cancer (TNBC). Gene expression and clinical-pathological data were evaluated in five independent cohorts, including three randomised clinical trials for a total of 1055 patients with TNBC, basal-like disease (BLBC) or both. [...]
2014 - 10.1038/bjc.2014.444
British Journal of Cancer, Vol. 111 (08 2014) , p. 1532-1541
|
|
5.
|
9 p, 234.9 KB |
Trastuzumab or lapatinib with standard chemotherapy for HER2-positive breast cancer : results from the GEICAM/2006-14 trial
/
Alba, E. (Hospital Universitario Virgen de la Victoria (Màlaga, Andalusia)) ;
Albanell, Joan (Hospital Parc de Salut Mar) ;
de la Haba, J (Hospital Universitario Reina Sofía) ;
Barnadas i Molins, Agustí (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Calvo, L (Complejo Hospitalario Universitario de A Coruña) ;
Sánchez-Rovira, P (Hospital General de Jaén) ;
Ramos, M (Centro Oncológico de Galicia) ;
Rojo, F (Fundación Jiménez Díaz) ;
Burgués, O (Hospital Clínico Universitario de Valencia) ;
Carrasco, E (Grupo GEICAM de Investigación en Cáncer de Mama) ;
Caballero, R (Grupo GEICAM de Investigación en Cáncer de Mama) ;
Porras, I (Hospital Universitario Reina Sofía) ;
Tibau, A (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Cámara, M C (Grupo GEICAM de Investigación en Cáncer de Mama) ;
Lluch, A (Hospital Clínico Universitario de Valencia) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Medicina
The addition of trastuzumab (T) and lapatinib (L) to neoadjuvant chemotherapy increases the pathological complete response (pCR) rate in patients with human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)-positive early breast cancer. [...]
2014 - 10.1038/bjc.2013.831
British Journal of Cancer, Vol. 110 (01 2014) , p. 1139-1147
|
|
6.
|
12 p, 436.1 KB |
Biomarkers characterization of circulating tumour cells in breast cancer patients
/
Nadal Rios, Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Fernandez, Ana (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ;
Sanchez-Rovira, Pedro (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ;
Salido, Marta (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Rodríguez, María (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
García-Puche, José Luis (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ;
Macià, Marta (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Corominas, Josep Maria (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Delgado-Rodriguez, Miguel (Universidad de Jaén (Jaén, Andalusia)) ;
Gonzalez, Lucas (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ;
Albanell, Joan (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Fernández, Mónica (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ;
Solé, Francesc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Lorente, José Antonio (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ;
Serrano, María José (Universidad de Granada (Granada, Andalusia))
Introduction: Increasing evidence supports the view that the detection of circulating tumor cells (CTCs) predicts outcomes of nonmetastatic breast cancer patients. CTCs differ genetically from the primary tumor and may contribute to variations in prognosis and response to therapy. [...]
2012 - 10.1186/bcr3180
Breast cancer research, Vol. 14, N. R71 (May 2012) , p. 1-12
|
|