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1.
8 p, 2.4 MB Cancer Genome Interpreter annotates the biological and clinical relevance of tumor alterations / Tamborero, David (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Rubio-Perez, Carlota (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Deu-Pons, Jordi (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Schroeder, Michael P. (Charité-Universitätsmedizin (Germany)) ; Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ; Rovira, Ana (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Tusquets, Ignasi (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Albanell, Joan (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Rodón Ahnert, Jordi (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ; Tabernero, Josep (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ; de Torres, Carmen (Institut de Recerca Sant Joan de Déu) ; Dienstmann, Rodrigo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ; Gonzalez-Perez, Abel (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Lopez-Bigas, Nuria (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA)) ; Universitat Autònoma de Barcelona
While tumor genome sequencing has become widely available in clinical and research settings, the interpretation of tumor somatic variants remains an important bottleneck. Here we present the Cancer Genome Interpreter, a versatile platform that automates the interpretation of newly sequenced cancer genomes, annotating the potential of alterations detected in tumors to act as drivers and their possible effect on treatment response. [...]
2018 - 10.1186/s13073-018-0531-8
Genome Medicine, Vol. 10 (March 2018) , art. 25  
2.
9 p, 3.4 MB Snail1 expression is required for sarcomagenesis / Alba-Castellón, Lorena (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Batlle, Raquel (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Francí, Clara (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Fernández-Aceñero, María J. (Hospital Universitario Fundación Jiménez Díaz) ; Mazzolini, Rocco (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Peña, Raúl (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Loubat, Jordina (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Alameda, Francesc (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Rodríguez, Rufo (Hospital Virgen de la Salud. Departamento de Patología) ; Curto Navarro, Josué (Universitat Autònoma de Barcelona. Centre d'Estudis en Biofísica) ; Albanell, Joan (Hospital del Mar. Servei d'Oncologia Mèdica) ; Munoz, Alberto (nstituto de Investigaciones Biomédicas "Alberto Sols") ; Bonilla, Félix (Hospital Universitario Puerta de Hierro de Majadahonda) ; Ignacio Casal, J. (Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Centro de Investigaciones Biológicas) ; Rojo, Federico (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; García de Herreros, Antonio (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut)
Snail1 transcriptional repressor is a major inducer of epithelial-to mesenchymal transition but is very limitedly expressed in adult animals. We have previously demonstrated that Snail1 is required for the maintenance of mesenchymal stem cells (MSCs), preventing their premature differentiation. [...]
2014 - 10.1016/j.neo.2014.05.002
Neoplasia (New York, N.Y.), Vol. 16, Issue 5 (May 2014) , p. 413-421  
3.
12 p, 2.4 MB MET expression and copy number heterogeneity in nonsquamous non-small cell lung cancer (nsNSCLC) / Casadevall Aguilar, David (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Gimeno, Javier (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Clavé, Sergi (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Taus, Álvaro (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Pijuan, Lara (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Arumí, Miriam (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Lorenzo, Marta (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Menéndez, Silvia (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Cañadas, Israel (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Albanell, Joan (Universitat Pompeu Fabra) ; Serrano, Sergio (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Espinet i Solà, Blanca (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Salido, Marta (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Arriola, Edurne (University of Southampton)
We aimed to assess MET intratumoral heterogeneity and its potential impact on biomarker-based patient selection as well as potential surrogate biomarkers of MET activation. Our study included 120 patients with non-squamous Non-small-cell Lung Cancer (nsNSCLC), of which 47 were incorporated in tissue microarrays (TMA). [...]
2015 - 10.18632/oncotarget.3976
Oncotarget, Vol. 6, Núm. 18 (June 2015) , p. 16215-16226  
4.
10 p, 889.8 KB Predicting response and survival in chemotherapy-treated triple-negative breast cancer / Prat, A (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Lluch, A (Hospital Clínic Universitari (València)) ; Albanell, Joan (Universitat Pompeu Fabra) ; Barry, W T (Department of Biostatistics and Computational Biology, Dana-Farber Cancer Institute) ; Fan, C (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ; Chacón, J I (Hospital Virgen de la Salud) ; Parker, J S (University of North Carolina. Department of Genetics) ; Calvo, L (Complejo Hospitalario Universitario de A Coruña) ; Plazaola, A (Department of Medical Oncology, Onkologikoa) ; Arcusa, A (Consorci Sanitari de Terrassa. Departament d'Oncologia Mèdica) ; Seguí-Palmer, M A (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)) ; Burgues, O (Hospital Clínic Universitari (València)) ; Ribelles, N (Hospital Universitario Virgen de la Victoria (Màlaga, Andalusia)) ; Rodriguez-Lescure, A (Hospital General de Elche) ; Guerrero, A (Fundació Institut Valencià d'Oncologia) ; Ruiz-Borrego, M (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ; Munarriz, B (Hospital Universitari i Politècnic La Fe de Valencia) ; López, J A (Hospital San Camilo) ; Adamo, Barbara (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Cheang, M C U (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ; Li, Y (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ; Hu, Z (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ; Gulley, M L (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ; Vidal, M J (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Pitcher, B N (Alliance Statistical and Data Center, Duke University) ; Liu, M C (Mayo Clinic. Department of Oncology) ; Citron, M L (ProHEALTH Care Associates, LLP) ; Ellis, M J (Washington University. Department of Oncology) ; Mardis, E (Washington University. Department of Oncology) ; Vickery, T (Washington University. Department of Oncology) ; Hudis, C A (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ; Winer, E P (Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute) ; Carey, L A (University of North Carolina. Lineberger Comprehensive Cancer Center) ; Caballero, R (Grupo Español de Investigación en Cáncer de Mama) ; Carrasco, E (Grupo Español de Investigación en Cáncer de Mama) ; Martín, M (Hospital General Universitario Gregorio Marañón. Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón (IiSGM)) ; Perou, C M (University of North Carolina. Department of Pathology and Laboratory Medicine) ; Alba, Emilio (Hospital Universitario Virgen de la Victoria (Màlaga, Andalusia))
In this study, we evaluated the ability of gene expression profiles to predict chemotherapy response and survival in triple-negative breast cancer (TNBC). Gene expression and clinical-pathological data were evaluated in five independent cohorts, including three randomised clinical trials for a total of 1055 patients with TNBC, basal-like disease (BLBC) or both. [...]
2014 - 10.1038/bjc.2014.444
British Journal of Cancer, Vol. 111 (08 2014) , p. 1532-1541  
5.
9 p, 234.9 KB Trastuzumab or lapatinib with standard chemotherapy for HER2-positive breast cancer : results from the GEICAM/2006-14 trial / Alba, Emilio (Hospital Universitario Virgen de la Victoria (Màlaga, Andalusia)) ; Albanell, Joan (Parc de Salut MAR de Barcelona) ; de la Haba, J (Hospital Universitario Reina Sofía (Córdoba, Espanya)) ; Barnadas i Molins, Agustí (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ; Calvo, L (Complejo Hospitalario Universitario de A Coruña) ; Sánchez-Rovira, P (Hospital General de Jaén) ; Ramos, M (Centro Oncológico de Galicia) ; Rojo, F (Hospital Universitario Fundación Jiménez Díaz) ; Burgués, O (Hospital Clínic Universitari (València)) ; Carrasco, E (Grupo GEICAM de Investigación en Cáncer de Mama) ; Caballero, R (Grupo GEICAM de Investigación en Cáncer de Mama) ; Porras, I (Hospital Universitario Reina Sofía (Córdoba, Espanya)) ; Tibau, A (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ; Cámara, M C (Grupo GEICAM de Investigación en Cáncer de Mama) ; Lluch, A (Hospital Clínic Universitari (València)) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina
The addition of trastuzumab (T) and lapatinib (L) to neoadjuvant chemotherapy increases the pathological complete response (pCR) rate in patients with human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)-positive early breast cancer. [...]
2014 - 10.1038/bjc.2013.831
British Journal of Cancer, Vol. 110 (01 2014) , p. 1139-1147  
6.
12 p, 436.1 KB Biomarkers characterization of circulating tumour cells in breast cancer patients / Nadal Rios, Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Fernandez, Ana (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ; Sanchez-Rovira, Pedro (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ; Salido, Marta (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Rodríguez, María (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; García-Puche, José Luis (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ; Macià, Marta (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Corominas, Josep Maria (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Delgado-Rodriguez, Miguel (Universidad de Jaén (Jaén, Andalusia)) ; Gonzalez, Lucas (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ; Albanell, Joan (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Fernández, Mónica (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ; Solé, Francesc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Lorente, José Antonio (Universidad de Granada (Granada, Andalusia)) ; Serrano, María José (Universidad de Granada (Granada, Andalusia))
Introduction: Increasing evidence supports the view that the detection of circulating tumor cells (CTCs) predicts outcomes of nonmetastatic breast cancer patients. CTCs differ genetically from the primary tumor and may contribute to variations in prognosis and response to therapy. [...]
2012 - 10.1186/bcr3180
Breast cancer research, Vol. 14, N. R71 (May 2012) , p. 1-12  

Research literature 7 records found  
1.
87 p, 1.2 MB Estudio de mutaciones de EGFR y KRAS en ADN circulante en pacientes afectos de cáncer de pulmón de célula no pequeña / Taus García, Álvaro ; Arriola Aperribay, Edurne, dir. ; Albanell Mestres, Joan, dir. ; Benaiges Boix, David, dir.
L'anàlisi molecular de l'tumor s'ha convertit en un procediment fonamental per a definir el maneig dels pacients amb càncer de pulmó. Encara que l'anàlisi de el teixit tumoral es considera la tècnica d'elecció per a l'estudi molecular, aquesta aproximació té una sèrie de limitacions, com l'absència de material tumoral suficient o la impossibilitat per capturar l'heterogeneïtat tumoral. [...]
El análisis molecular del tumor se ha convertido en un procedimiento fundamental para definir el manejo de los pacientes con cáncer de pulmón. Aunque el análisis del tejido tumoral se considera la técnica de elección para el estudio molecular, esta aproximación tiene una serie de limitaciones, como la ausencia de material tumoral suficiente o la imposibilidad para capturar la heterogeneidad tumoral. [...]
Molecular profiling of the tumor has become a crucial procedure in the management of patients with lung cancer. Although the analysis of the tumor tissue is considered the gold standard for the molecular profiling, this approach has some limitations, such as the absence of the required amount of tissue or the inability to capture the tumor heterogeneity. [...]
Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Medicina.

2021  
2.
119 p, 4.1 MB Heterogeneity of biomarker expression in non-small cell lung cancer / Casadevall Aguilar, David ; Arriola, Edurne, dir. ; Albanell, Joan, dir. ; Díez Pérez, Adolfo, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina
L'èxit de de la medicina de precisió en oncologia depèn, en gran mesura, d'una adequada selecció dels pacients que rebran teràpies dirigides contra dianes específiques del seu tumor. Per poder seleccionar els pacients, és indispensable disposar de biomarcadors amb valor predictiu que informin les decisions terapèutiques. [...]
The success of precision medicine in oncology is dependent to a large extent on an adequate selection of patients who will receive targeted therapies aimed at specific molecular traits of their tumor. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2017  
3.
284 p, 2.4 MB Fenotipos intrínsecos y resultados clínico-patológicos del tratamiento neoadyuvante en pacientes con cáncer de mama / Sabadell Mercadal, Mª Dolores ; Carreras Collado, Ramón, dir. ; Albanell, Joan, dir. ; Rojo Todo, Federico, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, d'Obstetrícia i Ginecologia i de Medicina Preventiva
Introducción : La quimioterapia neoadyuvante (QTN) ofrece una oportunidad única para evaluar la respuesta al tratamiento en estadios iniciales de cáncer de mama (CM). La valoración de marcadores inmunohistoquímicos define unos fenotipos intrínsecos clínicos (FIC) para el establecimiento de un plan terapéutico, con impacto en la respuesta patológica completa (RPC) y la supervivencia libre de enfermedad (SLE) y global (SG). [...]
INTRODUCCIÓN: La quimioterapia neoadyuvante (QTN) ofrece una oportunidad única para evaluar la respuesta al tratamiento en estadios iniciales de cáncer de mama (CM). La valoración de marcadores inmunohistoquímicos define unos fenotipos intrínsecos clínicos (FIC) para el establecimiento de un plan terapéutico, con impacto en la respuesta patológica completa (RPC) y la supervivencia libre de enfermedad (SLE) y global (SG). [...]
INTRODUCTION: Neoadjuvant chemotherapy (NCT) offers a unique opportunity to evaluate the response to treatment of patients diagnosed with early-stage breast cancer (BC). Evaluation of immunohistochemistry markers define a variety of clinical intrinsic phenotypes (CIP) in order to establish a therapeutic plan with an impact on complete pathologic response (CPR), free-disease survival (DFS) and global survival (GS). [...]

[Bellaterra] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2017  
4.
250 p, 2.9 MB Factores de riesgo para la adquisición de Bacteriemia por Enterococcus faecalis y Enterococcus faecium / Conde Estévez, David ; Saballs Radresa, Pere, dir. ; Grau Cerrato, Santiago, dir. ; Albanell, Joan, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina
Las infecciones nosocomiales son una causa frecuente de incremento de estancia hospitalaria, costos sanitarios y mortalidad. En la actualidad, el enterococo es uno de los microorganismos implicados con mayor frecuencia en infecciones nosocomiales. [...]
Los resultados de ambos estudios son de vital importancia a la hora de elegir que antibiótico utilizar en primera línea y de manera empírica en pacientes ingresados en nuestro hospital y han dado lugar a la modificación de los protocolos actuales de tratamiento empírico de pacientes con infección nosocomial en nuestro hospital. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2014  
5.
27 p, 945.8 KB Phenotypic and molecular characterization of the intrinsic molecular subtypes of breast cancer / Prat Aparicio, Aleix ; Albanell, Joan, dir. (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina
La implementación de programas de cribaje y/o de prevención junto a terapias innovadoras está disminuyendo la mortalidad por cáncer de mama. Ahora bien, más de 120. 000 muertes anuales ocurren en Estados Unidos y en Europa por esta causa. [...]
Implementation of screening/prevention programs and novel treatment strategies is decreasing breast cancer mortality. However, more than 120,000 estimated deaths due to breast cancer are expected annually in the US and Europe combined. [...]

Bellaterra : Universitat Autònoma de Barcelona, 2014  
6.
190 p, 3.5 MB Efecto de la doxorubicina sobre MKP-1 en el cáncer de mama humano y asociación entre la expresión de MKP-1 y la evolución de las pacientes / Rojo Todo, Federico ; Serrano Figueras, S., (Sergio), dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciències Morfològiques) ; Albanell, Joan, dir. (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciències Morfològiques
Objetivos: La fosfatasa 1 de las protein-quinasas activadas por mitógenos (Mitogen-activated protein kinase (MAPK) phosphatase-1, MKP-1) regula por defosforilación la actividad de las vías de señalización de las protein-quinasas activadas por mitógenos, la quinasa regulada por señales extracelulares (extracellular signal-regulated kinase, ERK), la quinasa terminal c-Jun (c-Jun NH2-terminal kinase, JNK) y p38. [...]
Purpose: Mitogen-activated protein kinase (MAPK) phosphatase-1 (MKP-1) regulates by dephosphorylation the activity of the major intracellular signaling pathways mediated by mitogen-activated protein kinase [extracellular signalregulated kinase (ERK), c-Jun NH2-terminal kinase (JNK), and p38]. [...]

Bellaterra : Universitat Autònoma de Barcelona, 2013  
7.
80 p, 310.3 KB Telomerasa : : regulación, diana terapéutica y significado clínico en neoplasias humanas / Albanell, Joan ; Baselga Torres, Josep, 1959-2021, dir. (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Moore, Malcolm A. S., dir.
Las células malignas deben adquirir un potencial de replicación ilimitado (inmortalidad celular) para la formación de tumores avanzados. La adquisición de inmortalidad celular depende de la reactivación de la telomerasa, una enzima que permite compensar el problema de replicación terminal del ADN asociado a cada división celular. [...]
Malignant cells have to acquire a limitless replicative potential (immortality) to be able to form an advanced tumor. The acquisition of cellular imortality is linked to the reactivation of telomerase, an enzyme that has the potential to overcome the DNA end replication problem that occurs during each round of cell división. [...]

Bellaterra : Universitat Autònoma de Barcelona, 2002
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See also: similar author names
1 Albanell, J.
5 Albanell, Joan,
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