Results overview: Found 5 records in 0.02 seconds.
Articles, 5 records found
Articles 5 records found  
1.
3 p, 240.8 KB PCIG : a web-based application to explore immune-genomics interactions across cancer types / Pedrola, Anna (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ; Franch-Expósito, Sebastià (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ; Lahoz, Sara (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Esteban-Fabró, Roger (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Dienstmann, Rodrigo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ; Bassaganyas, Laia (University of Cambridge. Department of Medical Genetics) ; Camps, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Genomic alterations can modulate the tumor immunophenotype depending on their nature and tissue of origin. Although this immune-genomic interaction may shape disease progression and response to immunotherapy, the factors governing such dynamics and the influence of each tissue-specific context remain poorly understood. [...]
2022 - 10.1093/bioinformatics/btac111
Bioinformatics, Vol. 38, Issue 8 (March 2022) , p. 2374-2376  
2.
4 p, 972.8 KB Molecular portrait of high alpha-fetoprotein in hepatocellular carcinoma : implications for biomarker-driven clinical trials / Montal, Robert (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Andreu-Oller, Carmen (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Bassaganyas, Laia (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Esteban-Fabró, Roger (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Moran, S (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ; Montironi, Carla (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Moeini, Agrin (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Pinyol, Roser (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Peix, Judit (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Cabellos, Laia (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Villanueva, Augusto (Icahn School of Medicine at Mount Sinai) ; Sia, Daniela (Icahn School of Medicine at Mount Sinai) ; Mazzaferro, Vincenzo (University of Milan and Gastrointestinal Surgery and Liver Transplantation Unit. Fondazione IRCCS. Istituto Nazionale dei Tumori) ; Esteller, M (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ; Llovet, Josep M. (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ; Universitat Autònoma de Barcelona
The clinical utility of serum alpha-fetoprotein (AFP) in patients with hepatocellular carcinoma (HCC) is widely recognised. However, a clear understanding of the mechanisms of AFP overexpression and the molecular traits of patients with AFP-high tumours are not known. [...]
2019 - 10.1038/s41416-019-0513-7
British Journal of Cancer, Vol. 121 Núm. 4 (13 2019) , p. 340-343  
3.
22 p, 4.5 MB CNApp, a tool for the quantification of copy number alterations and integrative analysis revealing clinical implications / Franch-Expósito, Sebastià (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Bassaganyas, Laia (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Vila-Casadesús, Maria (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Hernández-Illán, Eva (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Esteban-Fabró, Roger (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Díaz-Gay, Marcos (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Lozano, Juan José (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Castells, Antoni (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Llovet, Josep Maria (Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Nova York, Estats Units d'Amèrica). Tisch Cancer Institute) ; Castellví-Bel, Sergi (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ; Camps, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Somatic copy number alterations (CNAs) are a hallmark of cancer, but their role in tumorigenesis and clinical relevance remain largely unclear. Here, we developed CNApp, a web-based tool that allows a comprehensive exploration of CNAs by using purity-corrected segmented data from multiple genomic platforms. [...]
2020 - 10.7554/eLife.50267
eLife, Vol. 9 (january 2020)  
4.
11 p, 754.8 KB Worldwide population distribution of the common LCE3C-LCE3B deletion associated with psoriasis and other autoimmune disorders / Bassaganyas, Laia (Centre de Regulació Genòmica) ; Riveira Muñoz, Eva (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ; García Aragonés, Manel (Centre de Regulació Genòmica) ; González, Juan Ramón (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Armengol, Lluís (Centre de Regulació Genòmica) ; Estivill, Xavier (Centre de Regulació Genòmica)
Background: there is increasing evidence of the importance of copy number variants (CNV) in genetic diversity among individuals and populations, as well as in some common genetic diseases. We previously characterized a common 32-kb insertion/deletion variant of the PSORS4 locus at chromosome 1q21 that harbours the LCE3C and LCE3B genes. [...]
2013 - 10.1186/1471-2164-14-261
BMC genomics, Vol. 14 (2013) , art. 261  
5.
10 p, 596.5 KB PeSV-fisher : identification of somatic and non-somatic structural variants using next generation sequencing data / Escaramís, Georgina (Centre de Regulació Genòmica) ; Tornador, Cristian (Centre de Regulació Genòmica) ; Bassaganyas, Laia (Centre de Regulació Genòmica) ; Rabionet, Raquel (Centre de Regulació Genòmica) ; Tubio, Jose M. C. (Centre de Regulació Genòmica) ; Martínez-Fundichely, Alexander (Centre de Regulació Genòmica) ; Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Gut, Marta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Ossowski, Stephan (Centre de Regulació Genòmica) ; Estivill, Xavier (Centre de Regulació Genòmica)
Next-generation sequencing technologies expedited research to develop efficient computational tools for the identification of structural variants (SVs) and their use to study human diseases. As deeper data is obtained, the existence of higher complexity SVs in some genomes becomes more evident, but the detection and definition of most of these complex rearrangements is still in its infancy. [...]
2013 - 10.1371/journal.pone.0063377
PloS one, Vol. 8 issue 5 (2013) , art. e63377  

See also: similar author names
5 Bassaganyas, Laia
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.