1.
|
2 p, 614.7 KB |
PopHumanVar : una finestra al nostre passat
/
Colomer, Aina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Al llarg de la nostra història evolutiva hem estat sotmesos a persistents desafiaments adaptatius que han deixat empremtes al nostre genoma. El grup de recerca Bioinformàtica de la Diversitat Genòmica de la UAB va identificar el 2019 nombroses regions del nostre genoma que podrien ser rellevants per entendre l'evolució humana. [...] A lo largo de nuestra historia evolutiva hemos estado sometidos a persistentes retos adaptativos que han dejado huella en nuestro genoma. El grupo de investigación Bioinformática de la Diversidad Genómica de la UAB identificó en el 2019 numerosas regiones de nuestro genoma que podrían ser relevantes para entender la evolución humana. [...] Throughout our evolutionary history we have been subjected to persistent adaptive challenges that have left footprints on our genome. The UAB Bioinformatics of Genomic Diversity research group identified in 2019 multiple genomic regions that might be relevant to understanding human evolution. [...]
2022
UAB divulga, Març 2022
3 documents
|
|
2.
|
|
3.
|
8 p, 990.0 KB |
The genome sequencing of an albino Western lowland gorilla reveals inbreeding in the wild
/
Prado Martinez, Javier (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Hernando Herraez, Irene (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Lorente-Galdos, Belen (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Dabad, Marc (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Ramírez, Óscar (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Baeza Delgado, Carlos (Universitat de València. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ;
Morcillo-Suarez, Carlos (Universitat Pompeu Fabra. Instituto Nacional de Bioinformatica) ;
Alkan, Can (Bilkent University. Department of Computer Engineering) ;
Hormozdiari, Fereydoun. (University of Washington. Department of Genome Sciences) ;
Raineri, Emanuele (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Estellé, Jordi (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Fernández, Marcos (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Valles, Mònica (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Ritscher, Lars (University of Leipzig. Institute of Biochemistry) ;
Schöneberg, Torsten (University of Leipzig. Institute of Biochemistry) ;
De la Calle-Mustienes, Elisa (Centro Andaluz de Biología del Desarrollo) ;
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Rubio Acero, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Melé, M. (Universitat Pompeu Fabra. Centre de Regulació Genòmica (CRG-UPF)) ;
Engelken, Johannes (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gomez-Skarmeta, José Luis (Centro Andaluz de Biología del Desarrollo) ;
Gut, Marta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Bertranpetit, Jaume (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Gut, Ivo (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Abello, Teresa (Zoo de Barcelona) ;
Eichler, Evan E. (Howard Hugues Medical Institute) ;
Mingarro, Ismael (Universitat de València. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ;
Lalueza-Fox, Carles (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Navarro i Cuartiellas, Arcadi, 1969- (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Marques-Bonet, Tomas 1975- (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Background: the only known albino gorilla, named Snowflake, was a male wild born individual from Equatorial Guinea who lived at the Barcelona Zoo for almost 40 years. He was diagnosed with non-syndromic oculocutaneous albinism, i. [...]
2013 - 10.1186/1471-2164-14-363
BMC genomics, Vol. 14 (2013) , art. 363
|
|
4.
|
|
5.
|
6 p, 807.2 KB |
The Drosophila melanogaster Genetic Reference Panel
/
MacKay, Trudy F. C. (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Richards, Stephen (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Stone, Eric A. (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Ayroles, Julien F. (Harvard University) ;
Zhu, Dianhui (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Han, Yi (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Magwire, Michael M. (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Cridland, Julie M. (Department of Ecology and Evolutionary Biology. University of California-Irvine) ;
Richardson, Mark F. (Faculty of Life Sciences. University of Manchester) ;
Anholt, Robert R. H. (Department of Biology. North Carolina State University) ;
Barrón Aduriz, Maite Garazi (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Bess, Crystal (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Blankenburg, Kerstin Petra (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Carbone, Mary Anna (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Castellano Esteve, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Chaboub, Lesley (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Duncan, Laura (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Harris, Zeke (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Javaid, Mehwish (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Jayaseelan, Joy Christina (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Jhangiani, Shalini N. (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Jordan, Katherine W. (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Lara, Fremiet (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Lawrence, Faye (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Lee, Sandra L. (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Librado, Pablo (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica) ;
Linheiro, Raquel S. (Faculty of Life Sciences. University of Manchester) ;
Lyman, Richard F. (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
MacKey, Aaron J. (Center for Public Health Genomics. University of Virginia) ;
Munidasa, Mala (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Muzny, Donna Marie (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Nazareth, Lynne (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Newsham, Irene (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Perales, Lora (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Pu, Ling-Ling (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Qu, Carson (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Ràmia Jesús, Miquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Reid, Jeffrey G. (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Rollmann, Stephanie M. (Department of Biological Sciences. University of Cincinnati) ;
Rozas, Julio (Universitat de Barcelona. Departament de Genètica) ;
Saada, Nehad (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Turlapati, Lavanya (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Worley, Kim C. (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Wu, Yuan-Qing (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Yamamoto, Akihiko (Department of Genetics. North Carolina State University) ;
Zhu, Yiming (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine) ;
Bergman, Casey M. (Faculty of Life Sciences. University of Manchester) ;
Thornton, Kevin R. (Department of Ecology and Evolutionary Biology. University of California-Irvine) ;
Mittelman, David (Virginia Bioinformatics Institute. Department of Biological Sciences. Virginia Tech) ;
Gibbs, Richard A. (Human Genome Sequencing Center. Baylor College of Medicine)
A major challenge of biology is understanding the relationship between molecular genetic variation and variation in quantitative traits, including fitness. This relationship determines our ability to predict phenotypes from genotypes and to understand how evolutionary forces shape variation within and between species. [...]
2012 - 10.1038/nature10811
Nature, Vol. 482, issue 7384 (Feb. 2012) , p. 173-178
|
|
6.
|
6 p, 700.6 KB |
IMKT : the integrative McDonald and Kreitman test
/
Murga-Moreno, Jesus (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Coronado-Zamora, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Hervás Fernández, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
The McDonald and Kreitman test (MKT) is one of the most powerful and widely used methods to detect and quantify recurrent natural selection using DNA sequence data. Here we present iMKT (acronym for integrative McDonald and Kreitman test), a novel web-based service performing four distinct MKT types. [...]
2019 - 10.1093/nar/gkz372
Nucleic acids research, Vol. 47, issue W1 (Jan. 2019) , p. W283-W288
|
|
7.
|
10 p, 3.7 MB |
PopHumanScan : the online catalog of human genome adaptation
/
Murga-Moreno, Jesus (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Coronado-Zamora, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Bodelon de Frutos, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Since the migrations that led humans to colonize Earth, our species has faced frequent adaptive challenges that have left signatures in the landscape of genetic variation and that we can identify in our today-s genomes. [...]
2019 - 10.1093/nar/gky959
Nucleic acids research, Vol. 47, issue D1 (Jan 2019) , p. D1080-D1089
|
|
8.
|
3 p, 539.7 KB |
Identifiquen més de 800 noves regions del genoma que podrien ser rellevants en l'evolució humana
/
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Murga-Moreno, Jesus (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Coronado-Zamora, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Un estudi del grup de recerca Bioinformàtica de la Diversitat Genòmica de la UAB, publicat a la revista Nucleic Acids Research, incrementa en un 40% el total dels senyals de selecció natural en el genoma humà detectades fins ara. [...] Un estudio del grupo de investigación Bioinformática de la Diversidad Genómica de la UAB, publicado en la revista Nucleic Acids Research, incrementa en un 40% el total de las señales de selección natural en el genoma humano detectadas hasta la fecha. [...] A study by the research group Bioinformatics of Genome Diversity at the Universitat Autònoma de Barcelona (UAB), published in the journal Nucleic Acids Research, increases by 40% the total number of signals of natural selection detected in the human genome to date. [...]
2019
UAB divulga, Juny 2019, p. 1-3
3 documents
|
|
9.
|
3 p, 769.6 KB |
PopHuman : navegador de referència de la variació genètica humana
/
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
La variació genètica humana és el conjunt de diferències genètiques que distingeixen els nostres genomes, ja sigui entre els individus dins d'una població o entre poblacions. El seu estudi té aplicacions evolutives i mèdiques significatives. [...] La variación genética humana es el conjunto de diferencias genéticas que distinguen nuestros genomas, ya sea entre los individuos dentro de una población o entre poblaciones. Su estudio tiene aplicaciones evolutivas y médicas significativas. [...] Human genetic variation is the set of genetic differences that distinguish our genomes, either among individuals within a population or between populations. Its study has significant evolutionary and medical applications. [...]
2018
UAB divulga, Març 2018, p. 1-3
3 documents
|
|
10.
|
8 p, 532.3 KB |
PopHuman : the human population genomics browser
/
Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Mulet, Roger (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Villegas-Mirón, Pablo (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Hervás Fernández, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Sanz, Esteve (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Genòmica) ;
Velasco, Daniel (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Bertranpetit, Jaume (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Laayouni, Hafid (Universitat Pompeu Fabra. Escola Superior de Comerç Internacional (ESCI-UPF)) ;
Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Genòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Genètica i de Microbiologia
2017 - 10.1093/nar/gkx943
Nucleic acids research, Vol. 46 (October 2017) , p. D1003-D1010
|
|