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Artículos Encontrados 4 registros  
1.
17 p, 2.4 MB Quasispecies Fitness Partition to Characterize the Molecular Status of a Viral Population. Negative Effect of Early Ribavirin Discontinuation in a Chronically Infected HEV Patient / Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ibañez-Lligoña, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Adombie, Caroline Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pintó, Rosa (Universitat de Barcelona) ; Guix, Susana (Universitat de Barcelona) ; Bosch, Albert (Universitat de Barcelona) ; Domingo, Esteban (Instituto de Salud Carlos III) ; Gallego, Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Perales Viejo, Celia (Universidad Autónoma de Madrid) ; Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Quer, Josep 1963- (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Universitat Autònoma de Barcelona
The changes occurring in viral quasispecies populations during infection have been monitored using diversity indices, nucleotide diversity, and several other indices to summarize the quasispecies structure in a single value. [...]
2022 - 10.3390/ijms232314654
International journal of molecular sciences, Vol. 23 (november 2022)  
Registro completo - Creative Commons
2.
15 p, 348.7 KB Bioinformatic Tools for NGS-Based Metagenomics to Improve the Clinical Diagnosis of Emerging, Re-Emerging and New Viruses / Ibañez-Lligoña, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Colomer-Castell, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Campos, Carolina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Garcia-Cehic, D (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Internacional de Catalunya) ; Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Epidemics and pandemics have occurred since the beginning of time, resulting in millions of deaths. Many such disease outbreaks are caused by viruses. Some viruses, particularly RNA viruses, are characterized by their high genetic variability, and this can affect certain phenotypic features: tropism, antigenicity, and susceptibility to antiviral drugs, vaccines, and the host immune response. [...]
2023 - 10.3390/v15020587
Viruses, Vol. 15, Issue 2 (February 2023) , art. 587  
Registro completo - Creative Commons
3.
11 p, 1.5 MB The frequency of defective genomes in Omicron differs from that of the Alpha, Beta and Delta variants / Campos, Carolina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Borras Bermejo, Blanca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Parés-Badell, Oleguer (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Adombi, Caroline Melanie (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ibañez-Lligoña, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esperalba, Juliana (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Codina, María Gema (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Saubí, Narcis (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
The SARS-CoV-2 Omicron variant emerged showing higher transmissibility and possibly higher resistance to current COVID-19 vaccines than other variants dominating the global pandemic. In March 2020 we performed a study in clinical samples, where we found that a portion of genomes in the SARS-CoV-2 viral population accumulated deletions immediately before the S1/S2 cleavage site (furin-like cleavage site, PRRAR/S) of the spike gene, generating a frameshift and appearance of a premature stop codon. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-24918-8
Scientific reports, Vol. 12 (december 2022)  
Registro completo - Creative Commons
4.
23 p, 2.1 MB Next-Generation Sequencing for Confronting Virus Pandemics / Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Ibáñez, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron)
Virus pandemics have happened, are happening and will happen again. In recent decades, the rate of zoonotic viral spillover into humans has accelerated, mirroring the expansion of our global footprint and travel network, including the expansion of viral vectors and the destruction of natural spaces, bringing humans closer to wild animals. [...]
2022 - 10.3390/v14030600
Viruses, Vol. 14 (march 2022)  
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