1.
|
11 p, 2.7 MB |
Design of negative and positive allosteric modulators of the cannabinoid CB2 Receptor derived from the natural product cannabidiol
/
Navarro Brugal, Gemma (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Fisiologia) ;
Gonzalez, Angel (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Sánchez-Morales, Adrià (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química) ;
Casajuana-Martin, Nil (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Gómez-Ventura, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Busqué Sánchez, Félix (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química) ;
Alibes, Ramón (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química) ;
Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Franco, Rafael (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular)
Cannabidiol (CBD), the second most abundant of the active compounds found in the Cannabis sativa plant, is of increasing interest because it is approved for human use and is neither euphorizing nor addictive. [...]
2021 - 10.1021/acs.jmedchem.1c00561
Journal of Medicinal Chemistry, Vol. 64, Issue 13 (July 2021) , p. 9354-9364
|
|
2.
|
14 p, 1.4 MB |
Reduction of stress responses in honey bees by synthetic ligands targeting an allatostatin receptor
/
Sánchez-Morales, Adrià (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química) ;
Gigoux, Véronique (Toulouse Cancer Research Center (CRT)) ;
Matsoukas, Minos Timotheos (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Pérez-Benito, Laura (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Fourmy, Daniel (Toulouse Cancer Research Center (CRT)) ;
Alibes, Ramón (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química) ;
Busqué Sánchez, Félix (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Devaud, Jean Marc (Université de Toulouse. Centre de Recherches Sur La Cognition Animale)
Honey bees are of great economic and ecological importance, but are facing multiple stressors that can jeopardize their pollination efficiency and survival. Therefore, understanding the physiological bases of their stress response may help defining treatments to improve their resilience. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-20978-y
Scientific reports, Vol. 12 Núm. 1 (2022) , p. 16760
|
|
3.
|
12 p, 2.5 MB |
Evidence for functional pre-coupled complexes of receptor heteromers and adenylyl cyclase
/
Navarro Brugal, Gemma (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetricía i Ginecologia i de Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Casadó-Anguera, Verònica (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Moreno, Estefanía (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Cai, Ning-Sheng (National Institutes of Health. Integrative Neurobiology Section, National Institute on Drug Abuse, USA) ;
Cortés, Antoni (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Canela, Enric I. (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Dessauer, Carmen W. (University of Texas Health Science Center, USA) ;
Casadó, Vicent (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i de Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Lluís, Carme (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Ferré, Sergi (National Institutes of Health. Integrative Neurobiology Section, National Institute on Drug Abuse)
G protein-coupled receptors (GPCRs), G proteins and adenylyl cyclase (AC) comprise one of the most studied transmembrane cell signaling pathways. However, it is unknown whether the ligand-dependent interactions between these signaling molecules are based on random collisions or the rearrangement of pre-coupled elements in a macromolecular complex. [...]
2018 - 10.1038/s41467-018-03522-3
Nature communications, Vol. 9 (march 2018)
|
|
4.
|
10 p, 2.0 MB |
Experimental and computational analysis of biased agonism on full-length and a C-terminally truncated adenosine A receptor
/
Navarro Brugal, Gemma (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Fisiologia) ;
Gonzalez, Angel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Campanacci, Stefano (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Rivas-Santisteban, Rafael (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Reyes-Resina, Irene (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Casajuana-Martin, Nil (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Franco, Rafael (Universitat de Barcelona. Facultat de Química)
Biased agonism, the ability of agonists to differentially activate downstream signaling pathways by stabilizing specific receptor conformations, is a key issue for G protein-coupled receptor (GPCR) signaling. [...]
2020 - 10.1016/j.csbj.2020.09.028
Computational and Structural Biotechnology Journal, Vol. 18 (september 2020) , p. 2723-2732
|
|
5.
|
4 p, 1.7 MB |
Discovery of Homobivalent Bitopic Ligands of the Cannabinoid CB Receptor
/
Morales, Paula (Spanish Research Council) ;
Navarro Brugal, Gemma (Universitat de Barcelona) ;
Gómez-Autet, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Redondo, Laura (Spanish Research Council) ;
Fernández-Ruiz, Javier (Universidad Complutense de Madrid) ;
Pérez-Benito, Laura (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Franco, Rafael (Universitat de Barcelona) ;
Jagerovic, Nadine (Spanish Research Council)
Single chemical entities with potential to simultaneously interact with two binding sites are emerging strategies in medicinal chemistry. We have designed, synthesized and functionally characterized the first bitopic ligands for the CB receptor. [...]
2020 - 10.1002/chem.202003389
Chemistry, Vol. 26 (november 2020) , p. 15839-15842
|
|
6.
|
6 p, 167.4 KB |
TMSNP : a web server to predict pathogenesis of missense mutations in the transmembrane region of membrane proteins
/
García Recio, Ädrian (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Gómez-Tamayo, José Carlos (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Reina, Iker (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Campillo Grau, María Mercedes (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Olivella, Mireia (Universitat de Vic. Facultat de Ciències i Tecnologia)
The massive amount of data generated from genome sequencing brings tons of newly identified mutations, whose pathogenic/non-pathogenic effects need to be evaluated. This has given rise to several mutation predictor tools that, in general, do not consider the specificities of the various protein groups. [...]
2021 - 10.1093/nargab/lqab008
NAR Genomics and Bioinformatics, Vol. 3 (february 2021)
|
|
7.
|
7 p, 551.5 KB |
The size matters? A computational tool to design bivalent ligands
/
Pérez-Benito, Laura (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Henry, Andrew (St John's Innovation Centre Cowley Road. Chemical Computing Group) ;
Matsoukas, Minos-Timotheos (University of Patras. Department of Pharmacy) ;
Lopez, Laura (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Pulido, Daniel (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ;
Royo, Miriam (Centro de Investigación Biomédica en Red de Bioingeniería, Biomateriales y Nanomedicina) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Tresadern, Gary (Janssen Research and Development (Beerse)) ;
Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional)
Bivalent ligands are increasingly important such as for targeting G protein-coupled receptor (GPCR) dimers or proteolysis targeting chimeras (PROTACs). They contain two pharmacophoric units that simultaneously bind in their corresponding binding sites, connected with a spacer chain. [...]
2018 - 10.1093/bioinformatics/bty422
Bioinformatics, Vol. 34 Núm. 22 (may 2018) , p. 3857-3863
|
|
8.
|
6 p, 1.6 MB |
HomolWat : a web server tool to incorporate 'homologous' water molecules into GPCR structures
/
Mayol, Eduardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
García Recio, Ädrian (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Tiemann, Johanna K. S. (Medical University Leipzig. Institute of Medical Physics and Biophysics) ;
Hildebrand, Peter W. (Medical University Leipzig. Institute of Medical Physics and Biophysics) ;
Guixà González, Ramon (Paul Scherrer Institute. Laboratory of Biomolecular Research) ;
Olivella, Mireia (Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya. Departament de Biociències) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública)
Internal water molecules play an essential role in the structure and function of membrane proteins including G protein-coupled receptors (GPCRs). However, technical limitations severely influence the number and certainty of observed water molecules in 3D structures. [...]
2020 - 10.1093/nar/gkaa440
Nucleic acids research, Vol. 48 (june 2020) , p. W54-W59
|
|
9.
|
21 p, 4.1 MB |
Control of glutamate release by complexes of adenosine and cannabinoid receptors
/
Köfalvi, Attila (University of Coimbra. CNC-Center for Neuroscience and Cell Biology) ;
Moreno, Estefanía (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Cai, Ning-Sheng (National Institute on Drug Abuse (Baltimore, Estats Units d'Amèrica)) ;
Fernández-Dueñas, Víctor (Universitat de Barcelona. Institut de Neurociències) ;
Ferreira, Samira G. (University of Coimbra. CNC-Center for Neuroscience and Cell Biology) ;
Guixà González, Ramon (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Sánchez Soto, Marta (National Institute on Drug Abuse (Baltimore, Estats Units d'Amèrica)) ;
Yano, Hideaki (National Institute on Drug Abuse (Baltimore, Estats Units d'Amèrica)) ;
Casadó-Anguera, Verònica (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ;
Cunha, Rodrigo A. (University of Coimbra. Faculty of Medicine) ;
Sebastião, Ana Maria (Universidade de Lisboa. Instituto de Medicina Molecular, Faculdade de Medicina) ;
Ciruela, Francisco (Universitat de Barcelona. Institut de Neurociències) ;
Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ;
Casadó, Vicent (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ;
Ferré, Sergi (National Institute on Drug Abuse (Baltimore, Estats Units d'Amèrica))
It has been hypothesized that heteromers of adenosine A receptors (A2AR) and cannabinoid CB receptors (CB1R) localized in glutamatergic nerve terminals mediate the integration of adenosine and endocannabinoid signaling involved in the modulation of striatal excitatory neurotransmission. [...]
2020 - 10.1186/s12915-020-0739-0
BMC biology, Vol. 18 (january 2020)
|
|
10.
|
12 p, 2.1 MB |
Quaternary structure of a G-protein-coupled receptor heterotetramer in complex with G and G
/
Navarro Brugal, Gemma (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Cordomí Montoya, Arnau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Zelman-Femiak, Monika (German Cancer Research Center, Bioquant, Im Neuenheimer Feld 267, 69120 Heidelberg, Germany) ;
Brugarolas, Marc (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Moreno, Estefania (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Aguinaga Andrés, David (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Pérez-Benito, Laura (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Cortés, Antoni (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Casadó, Vicent (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Mallol, Josefa (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Canela, Enric I. (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Lluís, Carme (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular) ;
Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
García-Sáez, Ana J. (Interfaculty Institute of Biochemistry, Hoppe-Seyler-Strasse 4, 72076 Tübingen, Germany) ;
McCormick, Peter J. (School of Pharmacy, University of East Anglia, Norwich, NR4 7TJ UK) ;
Franco, Rafael (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biomedicina Molecular)
G-protein-coupled receptors (GPCRs), in the form of monomers or homodimers that bind heterotrimeric G proteins, are fundamental in the transfer of extracellular stimuli to intracellular signaling pathways. [...]
2016 - 10.1186/s12915-016-0247-4
BMC biology, Vol. 14 (april 2016)
|
|