1.
|
21 p, 1.6 MB |
Using genome wide association studies to identify common QTL regions in three different genetic backgrounds based on Iberian pig breed
/
Martínez-Montes, Ángel M. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Fernández, Almudena (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Muñoz, María (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Noguera, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ;
Folch, Josep M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Fernández, Ana I. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
One of the major limitation for the application of QTL results in pig breeding and QTN identification has been the limited number of QTL effects validated in different animal material. The aim of the current work was to validate QTL regions through joint and specific genome wide association and haplotype analyses for growth, fatness and premier cut weights in three different genetic backgrounds, backcrosses based on Iberian pigs, which has a major role in the analysis due to its high productive relevance. [...]
2018 - 10.1371/journal.pone.0190184
PloS one, Vol. 13, Num. 3 (March 2018) , art. e0190184
|
|
2.
|
16 p, 2.4 MB |
Breeding farm, level of feeding and presence of antibiotics in the feed influence rabbit cecal microbiota
/
Velasco-Galilea, María (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Guivernau, Miriam (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Piles, Miriam (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Viñas, Marc (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Rafel Guarro, Oriol (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
González-Rodríguez, Olga (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Sánchez, Juan P. (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
The effect of the production environment and different management practices in rabbit cecal microbiota remains poorly understood. While previous studies have proved the impact of the age or the feed composition, research in the breeding farm and other animal management aspects, such as the presence of antibiotics in the feed or the level of feeding, is still needed. [...]
2020 - 10.1186/s42523-020-00059-z
Animal Microbiome, Vol. 2 (November 2020) , art. 40
|
|
3.
|
17 p, 2.7 MB |
Identification of strong candidate genes for backfat and intramuscular fatty acid composition in three crosses based on the Iberian pig
/
Crespo-Piazuelo, Daniel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Criado Mesas, Lourdes (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Revilla Sánchez, Manuel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Noguera, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ;
Fernández, Ana I. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ;
Folch, Josep M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Meat quality has an important genetic component and can be modified by the fatty acid (FA) composition and the amount of fat contained in adipose tissue and muscle. The present study aimed to find genomic regions associated with the FA composition in backfat and muscle (longissimus dorsi) in 439 pigs with three different genetic backgrounds but having the Iberian breed in common. [...]
2020 - 10.1038/s41598-020-70894-2
Scientific reports, Vol. 10 (August 2020) , art. 13962
|
|
4.
|
|
5.
|
10 p, 1.3 MB |
A genome-wide analysis of copy number variation in Murciano-Granadina goats
/
Guan, Dailu (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Martinez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Landi, Vincenzo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Luigi Sierra, Maria Gracia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Fernández Álvarez, Javier (Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina) ;
Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Such i Martí, Francesc Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Grup de Recerca en Remugants (G2R)) ;
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Background: In this work, our aim was to generate a map of the copy number variations (CNV) segregating in a population of Murciano-Granadina goats, the most important dairy breed in Spain, and to ascertain the main biological functions of the genes that map to copy number variable regions. [...]
2020 - 10.1186/s12711-020-00564-4
Genetics, selection, evolution, Vol. 52 (August 2020) , art. 44
|
|
6.
|
35 p, 524.5 KB |
Characterisation of sperm piRNAs and their correlation with semen quality traits in swine
/
Ablondi, Michela (University of Parma. Department of Veterinary Science (Italy)) ;
Gòdia, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Rodríguez Gil, Joan Enric (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Piwi-interacting RNAs (piRNAs) are a class of non-coding RNAs that are essential in the transcriptional silencing of transposable elements and warrant genome stability in the mammalian germline. In this study, we have identified piRNAs in porcine sperm using male germline and zygote datasets from human, mice, cow and pig, and evaluated the relation between their abundances and sperm quality traits. [...]
2021 - 10.1111/age.13022
Animal Genetics, Vol. 52, Issue 1 (February 2021) , p. 114-120
3 documents
|
|
7.
|
11 p, 2.2 MB |
Identification of circular RNAs in porcine sperm and evaluation of their relation to sperm motility
/
Gòdia, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Rocco, Martina (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Rodríguez Gil, Joan Enric (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Balasch, Sam (Grup Gepork S.A.) ;
Lewis, Craig (PIC Europe) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Medicina i Cirurgia Animals
Circular RNAs (circRNAs) are emerging as a novel class of noncoding RNAs which potential role as gene regulators is quickly gaining interest. circRNAs have been studied in different tissues and cell types across several animal species. [...]
2020 - 10.1038/s41598-020-64711-z
Scientific reports, Vol. 10 (May 2020) , art. 7985
|
|
8.
|
18 p, 2.1 MB |
Comparing the mRNA expression profile and the genetic determinism of intramuscular fat traits in the porcine gluteus medius and longissimus dorsi muscles
/
González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Pena i Subirà, Ramona Natacha (Universitat de Lleida. Departament de Ciència Animal) ;
Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Cánovas, Angela (University of Guelph. Centre for Genetic Improvement of Livestock. Department of Animal Biosciences (Canada)) ;
Díaz, Isabel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Noguera, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Programa de cria i genètica d'animals) ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Mercadé Carceller, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Background: Intramuscular fat (IMF) content and composition have a strong impact on the nutritional and organoleptic properties of porcine meat. The goal of the current work was to compare the patterns of gene expression and the genetic determinism of IMF traits in the porcine gluteus medius (GM) and longissimus dorsi (LD) muscles. [...]
2019 - 10.1186/s12864-019-5557-9
BMC genomics, Vol. 20 (March 2019) , art. 170
|
|
9.
|
18 p, 1.9 MB |
Analysis of porcine IGF2 gene expression in adipose tissue and its effect on fatty acid composition
/
Criado Mesas, Lourdes (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Departament de Genètica i Millora Animal) ;
Crespo-Piazuelo, Daniel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Benítez, Rita (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Fernández, Ana I. (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (Espanya). Departamento de Mejora Genética Animal) ;
Folch, Josep M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
IGF2:g. 3072G>A polymorphism has been described as the causal mutation of a maternally imprinted QTL for muscle growth and fat deposition in pigs. The objective of the current work was to study the association between the IGF2:g. [...]
2019 - 10.1371/journal.pone.0220708
PloS one, Vol. 14, Issue 8 (August 2019) , p. e0220708
|
|
10.
|
14 p, 1.0 MB |
A RNA-seq analysis to describe the boar sperm transcriptome and its seasonal changes
/
Gòdia, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Estill, Molly (Wayne State University. Department of Obstetrics and Gynecology) ;
Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Balasch, Sam (Grup Gepork S.A.) ;
Rodríguez-Gil, Joan E. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Krawetz, Stephen A. (Wayne State University. Department of Obstetrics and Gynecology) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Understanding the molecular basis of cell function and ultimate phenotypes is crucial for the development of biological markers. With this aim, several RNA-seq studies have been devoted to the characterization of the transcriptome of ejaculated spermatozoa in relation to sperm quality and fertility. [...]
2019 - 10.3389/fgene.2019.00299
Frontiers in genetics, Vol. 10 (April 2019) , art. 299
|
|