|
1.
|
|
10 p, 1.9 MB |
Contextualized genome-scale model unveils high-order metabolic effects of the specific growth rate and oxygenation level in recombinant Pichia pastoris
/
Torres, Paulina (Pontificia Universidad Católica de Chile, Department of Chemical and Bioprocess Engineering) ;
Saa, Pedro A. (Pontificia Universidad Católica de Chile, Department of Chemical and Bioprocess Engineering) ;
Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Agosin, Eduardo (Pontificia Universidad Católica de Chile, Department of Chemical and Bioprocess Engineering)
Pichia pastoris is recognized as a biotechnological workhorse for recombinant protein expression. The metabolic performance of this microorganism depends on genetic makeup and culture conditions, amongst which the specific growth rate and oxygenation level are critical. [...]
2019 -  10.1016/j.mec.2019.e00103
Metabolic Engineering Communications, Vol. 9 (December 2019) , art. e00103
|
|
|
2.
|
|
15 p, 1.7 MB |
ZmXTH1, a new xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase in maize, affects cell wall structure and composition in Arabidopsis thaliana
/
Genovesi, Valeria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA)) ;
Fornalé, Silvia (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA)) ;
Fry, Stephen C. (University of Edinburgh. Institute of Molecular Plant Sciences) ;
Ruel, Katia (Centre National de la Recherche Scientifique (França)) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Encina, Antonio (Universidad de León. Área de Fisiología Vegetal) ;
Sonbol, Fathi-Mohamed (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA)) ;
Bosch, Josep (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA)) ;
Puigdomènech, Pere, 1948- (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA)) ;
Rigau, Joan (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA)) ;
Caparros Ruíz, David (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA))
Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolases (XTHs; EC 2. 4. 1. 207 and/or EC 3. 2. 1. 151) are enzymes involved in the modification of cell wall structure by cleaving and, often, also re-joining xyloglucan molecules in primary plant cell walls. [...]
2008 - 10.1093/jxb/ern013
Journal of experimental botany, Vol. 59, Issue 4 (March 2008) , p. 875-889
|
|
|
3.
|
|
13 p, 5.3 MB |
Biotechnological production of the cell penetrating antifungal PAF102 peptide in pichia pastoris
/
Popa, Crina (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Shi, Xiaoqing (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Ruiz Medina, Tarik (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Coca López, María (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Antimicrobial peptides (AMPs) have potent and durable antimicrobial activity to a wide range of fungi and bacteria. The growing problem of drug-resistant pathogenic microorganisms, together with the lack of new effective compounds, has stimulated interest in developing AMPs as anti-infective molecules. [...]
2019 - 10.3389/fmicb.2019.01472
Frontiers in microbiology, Vol. 10 (June 2019) , art. 1472
|
|
|
4.
|
|
16 p, 1.8 MB |
Increased dosage of AOX1 promoter-regulated expression cassettes leads to transcription attenuation of the methanol metabolism in Pichia pastoris
/
Cámara, Elena (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Landes, Nils (University of Natural Resources and Life Sciences Vienna) ;
Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Gasser, Brigitte (Universität für Bodenkultur Wien) ;
Mattanovich, Diethard (Universität für Bodenkultur Wien) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
The methanol-regulated alcohol oxidase promoter (PAOX1) of Pichia pastoris is one of the strongest promoters for heterologous gene expression in this methylotrophic yeast. Although increasing gene dosage is one of the most common strategies to increase recombinant protein productivities, the increase of gene dosage of Rhizopus oryzae lipase (ROL) in P. [...]
2017 - 10.1038/srep44302
Scientific reports (Nature Publishing Group), Vol. 7 (2017) , art. 44302
|
|
|
5.
|
|
13 p, 1.4 MB |
An improved secretion signal enhances the secretion of model proteins from Pichia pastoris
/
Barrero, Juan J. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Casler, Jason C. (University of Chicago. Department of Molecular Genetics and Cell Biology) ;
Valero Barranco, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Glick, Benjamin S. (University of Chicago. Department of Molecular Genetics and Cell Biology)
Background: proteins can be secreted from a host organism with the aid of N-terminal secretion signals. The budding yeast Pichia pastoris (Komagataella sp. ) is widely employed to secrete proteins of academic and industrial interest. [...]
2018 - 10.1186/s12934-018-1009-5
Microbial cell factories, Vol. 17 (2018) , art. 161
|
|
|
6.
|
|
13 p, 1.7 MB |
Metabolic flux analysis and the NAD(P)H/NAD(P) + ratios in chemostat cultures of Azotobacter vinelandii
/
García, Andres (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Castillo, Tania (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia) ;
Segura, Daniel (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia) ;
Peña, Carlos (Universidad Nacional Autònoma de México. Instituto de Biotecnologia)
Azotobacter vinelandii is a bacterium that produces alginate and polyhydroxybutyrate (P3HB); however, the role of NAD(P)H/NAD(P) + ratios on the metabolic fluxes through biosynthesis pathways of these biopolymers remains unknown. [...]
2018 - 10.1186/s12934-018-0860-8
Microbial cell factories, Vol. 17 (January 2018) , art. 10
|
|
|
7.
|
|
14 p, 611.6 KB |
Fine-tuning the P. pastoris iMT1026 genome-scale metabolic model for improved prediction of growth on methanol or glycerol as sole carbon sources
/
Tomàs Gamisans, Màrius (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
The methylotrophic yeast Pichia pastoris (Komagataella spp. ) is widely used as cell factory for recombinant protein production. In the past recent years, important breakthroughs in the systems-level quantitative analysis of its physiology have been achieved. [...]
2018 - 10.1111/1751-7915.12871
Microbial biotechnology, Vol. 11, Issue 1 (January 2018) , p. 224-237
|
|
|
8.
|
|
15 p, 2.0 MB |
The effect of hypoxia on the lipidome of recombinant Pichia pastoris
/
Adelantado Vallvé, Núria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Tarazona, Pablo (Georg-August University. Albrecht-von-Haller-Institute for Plant Sciences) ;
Grillitsch, Karlheinz (Austrian Centre of Industrial Biotechnology (ACIB)) ;
Garcia-Ortega, Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Monforte, Sergi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Valero Barranco, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Feussner, Ivo (Georg-August University. Albrecht-von-Haller-Institute for Plant Sciences) ;
Daum, Günther (Graz University of Technology. Institute of Biochemistry) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental)
Cultivation of recombinant Pichia pastoris (Komagataella sp. ) under hypoxic conditions has a strong positive effect on specific productivity when the glycolytic GAP promoter is used for recombinant protein expression, mainly due to upregulation of glycolytic conditions. [...]
2017 - 10.1186/s12934-017-0699-4
Microbial cell factories, Vol. 16 (May 2017) , art. 86
|
|
|
9.
|
|
10 p, 763.1 KB |
Engineering new mycobacterial vaccine design for HIV-TB pediatric vaccine vectored by lysine auxotroph of BCG
/
Saubi, Narcis (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Gea-Mallorquí, Ester (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Ferrer, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Hurtado, Carmen (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Sánchez-Úbeda, Sara (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Eto, Yoshiki (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Gatell, Josep M (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Hanke, Tomáš (University of Oxford. Weatherall Institute of Molecular Medicine) ;
Joseph, Joan (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer)
In this study, we have engineered a new mycobacterial vaccine design by using an antibiotic-free plasmid selection system. We assembled a novel Escherichia coli (E. coli)-mycobacterial shuttle plasmid p2auxo. [...]
2014 - 10.1038/mtm.2014.17
Molecular Therapy. Methods & Clinical Development, Vol. 1 (May 2014) , art. 14017
|
|
|
10.
|
|
13 p, 1.5 MB |
Use of chemostat cultures mimicking different phases of wine fermentations as a tool for quantitative physiological analysis
/
Vázquez Lima, Felícitas (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química, Biològica i Ambiental) ;
Silva, Paulina (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química) ;
Barreiro Vázquez, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química) ;
Martínez Moreno, Rubén (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ;
Morales, Pilar (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ;
Quirós, Manuel (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ;
González, Ramón (Universidad de La Rioja. Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino) ;
Albiol i Sala, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química) ;
Ferrer i Alegre, Pau (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria Química)
Saccharomyces cerevisiae is the most relevant yeast species conducting the alcoholic fermentation that takes place during winemaking. Although the physiology of this model organism has been extensively studied, systematic quantitative physiology studies of this yeast under winemaking conditions are still scarce, thus limiting the understanding of fermentative metabolism of wine yeast strains and the systematic description, modelling and prediction of fermentation processes. [...]
2014 - 10.1186/1475-2859-13-85
Microbial cell factories, Vol. 13 (June 2014) , art. 85
|
|
visitant ::
identificació
alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al 
canal RSS.
