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Articles, 19 registres trobats
Documents de recerca, 3 registres trobats
Materials acadèmics, 2 registres trobats
Articles 19 registres trobats  1 - 10següent  anar al registre:
1.
38 p, 1.7 MB Transposon insertions, structural variations, and SNPs contribute to the evolution of the melon genome / Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Hénaff, Elizabeth (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Vives, Cristina (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pinosio, Sara (Universita degli studi di Udine. Dipartimento di szience agrarie e ambientali) ; Burgos-Paz, William (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Morgante, Michele (Universita degli studi di Udine. Dipartimento di szience agrarie e ambientali) ; Ramos Onsins, Sebastián E. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casacuberta, Josep Maria (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The availability of extensive databases of crop genome sequences should allow analysis of crop variability at an unprecedented scale, which should have an important impact in plant breeding. However, up to now the analysis of genetic variability at the whole-genome scale has been mainly restricted to single nucleotide polymorphisms (SNPs). [...]
2015 - 10.1093/molbev/msv152
Molecular biology and evolution, Vol. 32, issue 10 (Oct. 2015) , p. 2760-74  
2.
18 p, 3.4 MB Genome and transcriptome analysis of the Mesoamerican common bean and the role of gene duplications in establishing tissue and temporal specialization of genes / Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ; Capella-Gutiérrez, Salvador (Centre de Regulació Genòmica) ; Rendón-Anaya, Martha (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ; Hernández-Oñate, Miguel (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ; Minoche, André E. (Garvan Institute of Medical Research) ; Erb, Ionas (Centre de Regulació Genòmica) ; Câmara, Francisco (Centre de Regulació Genòmica) ; Prieto-Barja, Pablo (Centre de Regulació Genòmica) ; Corvelo, André (New York Genome Center) ; Sanseverino, Walter (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Westergaard, Gastón (Instituto de Agrobiotecnología Rosario) ; Dohm, Juliane C. (Universität für Bodenkultur) ; Pappas, Georgios J. (Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular) ; Saburido-Alvarez, Soledad (Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ; Kedra, Darek (Centre de Regulació Genòmica) ; Gonzalez, Irene (Universitat Pompeu Fabra) ; Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica) ; Gómez-Garrido, Jessica (Universitat Pompeu Fabra) ; Aguilar-Morón, María A. (Universitat Pompeu Fabra) ; Andreu, Nuria (Universitat Pompeu Fabra) ; Aguilar, O. Mario (Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Zehnsdorf, Maik (Universitat Pompeu Fabra) ; Vázquez, Martín P. (Instituto de Agrobiotecnología Rosario) ; Delgado-Salinas, Alfonso (Universidad Nacional Autónoma de México. Departamento de Botánica) ; Delaye, Luis (Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del I.P.N. Unidad Irapuato. Departamento de Ingeniería Genética) ; Lowy, Ernesto (European Bioinformatics Institute) ; Mentaberry, Alejandro (Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales) ; Vianello-Brondani, Rosana P. (Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária) ; García, José Luís (Centro Superior de Investigaciones Científicas. Departamento de Biología Ambiental) ; Alioto, Tyler (Centre de Regulació Genòmica) ; Sánchez, Federico (Universidad Nacional Autónoma de México. Departamento de Biología Molecular de Plantas) ; Himmelbauer, Heinz (Universität für Bodenkultur) ; Santalla, Marta (Centro Superior de Investigaciones Científicas. Mision Biológica de Galicia) ; Notredame, Cedric (Universitat Pompeu Fabra) ; Gabaldón, Toni (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ; Herrera-Estrella, Alfredo (centro de Investigación y de Estudios Avanzados del I.P.N. Unidad Irapuato. Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad) ; Guigó, Roderic (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques)
Legumes are the third largest family of angiosperms and the second most important crop class. Legume genomes have been shaped by extensive large-scale gene duplications, including an approximately 58 million year old whole genome duplication shared by most crop legumes. [...]
2016 - 10.1186/s13059-016-0883-6
Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 32  
3.
20 p, 2.1 MB QTL analyses in multiple populations employed for the fine mapping and identification of candidate genes at a locus affecting sugar accumulation in melon (Cucumis melo L.) / Argyris, Jason (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Díaz, Aurora (Universitat Politècnica de València. Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Ruggieri, Valentino (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Fernández, Marta (Semillas Fitó, S.L.) ; Jahrmann, Torben (Semillas Fitó, S.L.) ; Gibon, Yves (Institut national de la recherche agronomique (França)) ; Picó, Belén (Universitat Politècnica de València. Instituto de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Martín-Hernández, Ana Montserrat (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Monforte, Antonio J. (Universitat Politècnica de València. Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Sugar content is the major determinant of both fruit quality and consumer acceptance in melon (Cucumis melo L), and is a primary target for crop improvement. Near-isogenic lines (NILs) derived from the intraspecific cross between a "Piel de Sapo" (PS) type and the exotic cultivar "Songwhan Charmi" (SC), and several populations generated from the cross of PS × Ames 24294 ("Trigonus"), a wild melon, were used to identify QTL related to sugar and organic acid composition. [...]
2017 - 10.3389/fpls.2017.01679
Frontiers in plant sciences, Vol. 8 (Sep. 2017) art. 1679  
4.
9 p, 839.2 KB EcoTILLING for the identification of allelic variants of melon eIF4E, a factor that controls virus susceptibility / Nieto, Cristina (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Piron, Florence (Institut national de la recherche agronomique) ; Dalmais, Marion (Institut national de la recherche agronomique) ; Marco, Cristina F. (Estación Experimental "La Mayora") ; Moriones, Enrique (Estación Experimental "La Mayora") ; Gómez-Guillamón, Ma Luisa (Estación Experimental "La Mayora") ; Truniger, Veronica (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Gómez, Pedro (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Aranda, Miguel A. (Centro de Edafología y Biología Aplicada del Segura) ; Bendahmane, Abdelhafid (Institut national de la recherche agronomique)
Background: translation initiation factors of the 4E and 4G protein families mediate resistance to several RNA plant viruses in the natural diversity of crops. Particularly, a single point mutation in melon eukaryotic translation initiation factor 4E (eIF4E) controls resistance to Melon necrotic spot virus (MNSV) in melon. [...]
Results: a collection of Cucumis spp. was characterised for susceptibility to MNSV and Cucumber vein yellowing virus (CVYV) and used for the implementation of EcoTILLING to identify new allelic variants of eIF4E. [...]

2007 - 10.1186/1471-2229-7-34
BMC plant biology, Vol. 7 (2007) , art. 34  
5.
14 p, 471.5 KB A 1,681-locus consensus genetic map of cultivated cucumber including 67 NB-LRR resistance gene homolog and ten gene loci / Luming Yang, Lunig (University of Wisconsin. Horticulture Department) ; Li, Dawei (University of Wisconsin. Horticulture Department) ; Li, Yuhong (University of Wisconsin. Horticulture Department) ; Gu, Xingfang (Zhongguo nong ye ke xue yuan. Institute of Vegetables and Flowers) ; Huang, Sanwen (Zhongguo nong ye ke xue yuan. Institute of Vegetables and Flowers) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Weng, Yiqun (University of Wisconsin. Horticulture Department)
BACKGROUND: cucumber is an important vegetable crop that is susceptible to many pathogens, but no disease resistance (R) genes have been cloned. The availability of whole genome sequences provides an excellent opportunity for systematic identification and characterization of the nucleotide binding and leucine-rich repeat (NB-LRR) type R gene homolog (RGH) sequences in the genome. [...]
2013 - 10.1186/1471-2229-13-53
BMC plant biology, Vol. 13 (2013) , art. 53  
6.
18 p, 591.0 KB Genomics of ecological adaptation in cactophilic Drosophila / Guillén Montalbán, Yolanda (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Rius Camps, Nuria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Delprat Obeaga, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Williford, Anna (University of Texas. Department of Biology) ; Muyas Remolar, Francesc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Puig Font, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Ràmia Jesús, Miquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Egea Sánchez, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Negre de Bofarull, Bárbara (Centre de Regulació Genòmica (Barcelona)) ; Mir, Gisela (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Camps, Jordi (Centro Nacional de Análisis Genómico) ; Moncunill, Valentí (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ; Ruiz-Ruano, Francisco J. (Universidad de Granada. Departamento de Genética) ; Cabrero, Josefa (Universidad de Granada. Departamento de Genética) ; De Lima, Leonardo G. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ; Dias, Guilherme B. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ; Ruiz, Jeronimo C. (Centro de Pesquisa René Rachou) ; Kapusta, Aurélie (University of Utah. Department of Human Genetics) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gut, Marta (Centro Nacional de Análisis Genómico) ; Gut, Ivo G. (Centro Nacional de Análisis Genómico) ; Torrents, David (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ; Camacho, Juan P. (Universidad de Granada. Departamento de Genética) ; Kuhn, Gustavo C.S. G. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ; Feschotte, Cédric (University of Utah. Department of Human Genetics) ; Clark, Andrew G. (Cornell University. Department of Molecular Biology and Genetics) ; Betrán, Esther (University of Texas. Department of Biology) ; Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Ruiz, Alfredo, (Ruiz Panadero) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Cactophilic Drosophila species provide a valuable model to study gene-environment interactions and ecological adaptation. Drosophila buzzatii and Drosophila mojavensis are two cactophilic species that belong to the repleta group, but have very different geographical distributions and primary host plants. [...]
2014 - 10.1093/gbe/evu291
Genome biology and evolution, Vol. 7, no. 1 (Jan. 2015) , p. 349-366  
7.
11 p, 3.1 MB Towards a TILLING platform for functional genomics in piel de sapo melons / González, Mireia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Xu, Meihong (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Esteras, Cristina (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Roig, Cristina (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Monforte, Antonio J. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Troadec, Christelle (Institut National de Recherche Agronomique. Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Pujol, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Nuez, Fernando (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Bendahmane, Abdelhafid (Institut National de Recherche Agronomique. Unité de Recherche en Génomique Végétale) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Picó, Belén (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana)
BACKGROUND: the availability of genetic and genomic resources for melon has increased significantly, but functional genomics resources are still limited for this crop. TILLING is a powerful reverse genetics approach that can be utilized to generate novel mutations in candidate genes. [...]
2011 - 10.1186/1756-0500-4-289
BMC research notes, Vol. 11 (Aug. 2011) , art. 289  
8.
15 p, 788.7 KB Sequencing of 6.7 Mb of the melon genome using a BAC pooling strategy / González Miguel, Víctor Manuel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Benjak, Andrej (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Hénaff, Elizabeth (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Mir, Gisela (Centre de Recerca en AgriGenòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Background: Cucumis melo (melon) belongs to the Cucurbitaceae family, whose economic importance among horticulture crops is second only to Solanaceae. Melon has a high intra-specific genetic variation, morphologic diversity and a small genome size (454 Mb), which make it suitable for a great variety of molecular and genetic studies. [...]
2010 - 10.1186/1471-2229-10-246
BMC plant biology, Vol. 10 Núm. 246 (novembre 2010) , p. 1-15  
9.
12 p, 1.8 MB A mutation in the melon vacuolar protein sorting 41prevents systemic infection of cucumber mosaic virus / Giner, Ana (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pascual, Laura (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Bourgeois, Michael (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gyetvai, Gabor (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ríos Rodríguez, Pablo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Picó, Belén (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana) ; Troadec,Christelle (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay) ; Bendahmane, Abdel (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Martín-Hernández, Ana Montserrat (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
In the melon exotic accession PI 161375, the gene cmv1, confers recessive resistance to Cucumber mosaic virus (CMV) strains of subgroup II. cmv1 prevents the systemic infection by restricting the virus to the bundle sheath cells and impeding viral loading to the phloem. [...]
2017 - 10.1038/s41598-017-10783-3
Scientific reports, Vol. 7 (Sep. 2017) , art. 10471  
10.
15 p, 7.0 MB Genome-Wide Differentiation of Various Melon Horticultural Groups for Use in GWAS for Fruit Firmness and Construction of a High Resolution Genetic Map / Nimmakaya, Padma (West Virginia University. Department of Biology) ; Tomason, Yan R. (West Virginia University. Department of Biology) ; Abburi, Venkata L. (West Virginia University. Department of Biology) ; Alvarado, Alejandra (West Virginia University. Department of Biology) ; Saminathan, Thangasamy (West Virginia University. Department of Biology) ; Vajja, Venkata G. (West Virginia University. Department of Biology) ; Salazar, Germania (Alcorn State University. Department of Agriculture) ; Panicker, Girish K. (Alcorn State University. Department of Agriculture) ; Levi, Amnon (United States Department of Agriculture. U. S. Vegetable Laboratory) ; Wechter, William P. (United States Department of Agriculture. U. S. Vegetable Laboratory) ; McCreight, James D. (United States Department of Agriculture. U.S. Agricultural Research Station) ; Korol, Abraham B. (Universiṭat Ḥefah. Department of Evolutionary and Environmental Biology) ; Ronin, Yefim (Universiṭat Ḥefah. Department of Evolutionary and Environmental Biology) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Reddy, Umesh K. (West Virginia University. Department of Biology)
Melon (Cucumis melo L. ) is a phenotypically diverse eudicot diploid (2n = 2x = 24) has climacteric and non-climacteric morphotypes and show wide variation for fruit firmness, an important trait for transportation and shelf life. [...]
2016 - 10.3389/fpls.2016.01437
Frontiers in plant science, Vol. 7 (Sep. 2016) , art. 1437  

Articles : 19 registres trobats   1 - 10següent  anar al registre:
Documents de recerca 3 registres trobats  
1.
250 p, 5.5 MB Clonaje posicional y validación de un gen candidato para eth6.3, un QTL implicado en la maduración climatérica del fruto del melón / Ríos Rodríguez, Pablo ; Garcia Mas, Jordi, dir. ; Poschenrieder, Charlotte ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia
La maduración del fruto es un proceso metabólico y fisiológico complejo, está altamente regulado e influye directamente sobre la calidad organoléptica y su valor económico. Un compuesto importante es el etileno, y en función de su patrón de síntesis los frutos pueden ser divididos en climatéricos y no climatéricos. [...]
Fruit ripening is a complex and highly regulated metabolic and physiological process that has a great influence in the organoleptic quality and economical value of the fruit. Ethylene is the main plant hormone involved in ripening regulation and, depending on its expression pattern, fruits can be classified as climacteric and non-climacteric. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2016  
2.
188 p, 5.8 MB Estudio genético de la maduración del fruto en melón en la línea isogénica SC3-5-1 / Vegas Renedo, Juan ; Garcia-Mas, Jordi, dir. ; Marcos, Ricard ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia
La maduración de los frutos es un proceso fisiológico complejo y altamente regulado en el que se producen una serie de cambios bioquímiccos en el fruto: color, aroma, estructura del mismo; hasta el completo desarrollo del fruto maduro. [...]
Fruit ripening is a highly and complex physiological process, with a set of biochemical changes, including the conversion of starch to sugars, fruit softening, accumulation of pigments such as carotenoids, and synthesis of aroma volatiles. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2014  
3.
282 p, 8.5 MB Desarrollo de una plataforma de tilling en melón (Cucumis melo L.) / González To, Mireia ; Garcia Mas, Jordi, dir. ; Espunya, Mª Carme ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
El trabajo descrito en esta tesis doctoral se enmarca dentro del proyecto MELOGEN (GEN2013‑ 20237, 2004‑2007) uno de cuyos objetivos era la construcción de una plataforma de TILLING en melón. La disponibilidad de recursos genéticos y genómicos para el melón se ha incrementado a lo largo de los últimos años e incluso la secuencia del genoma está disponible. [...]
The work described in this thesis is part of the MELOGEN project (GEN2013‑20237, 2004‑2007) one of whose goals was to build a melon TILLING platform. The availability of genetic and genomic resources in melon has increased over recent years, and even the sequence of the genome is available. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2014  

Materials acadèmics 2 registres trobats  
1.
4 p, 77.0 KB Problem-Based Learning in Plant Biology [43872] / Caparros Ruíz, David ; García Mas, Jordi ; Galbany Casals, Merce ; Coca, Maria ; Sánchez Coll, Núria ; Rubio Somoza, Ignacio ; Gómez Ariza, Jorge ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
With the help of a course tutor, each student will design a methodological approach to a problem on plant biology raised by the teacher. At the end of the semester, the students will present their work as a written report and orally in a seminar.
2018-19
Màster Universitari en Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology [1370]  
2.
4 p, 76.8 KB Problem-Based Learning in Plant Biology [43872] / Caparros Ruíz, David ; García Mas, Jordi ; Galbany Casals, Mercè (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ; Coca, Maria ; Sánchez Coll, Núria ; Rubio Somoza, Ignacio ; Gómez Ariza, Jorge ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
With the help of a course tutor, each student will design a methodological approach to a problem on plant biology raised by the teacher. At the end of the semester, the students will present their work as a written report and orally in a seminar.
2017-18
Màster Universitari en Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology [1370]  

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