|
1.
|
|
25 p, 6.3 MB |
Principles of 3D chromosome folding and evolutionary genome reshuffling in mammals
/
Álvarez-González, Lucía (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Arias-Sardá, Cristina (University of Kent. School of Biosciences) ;
Montes-Espuña, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Marin Gual, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Lister, Nicholas C. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Deakin, Janine (University of Canberra. Institute for Applied Ecology) ;
Renfree, Marilyn B. (The University of Melbourne. School of Biosciences) ;
Robinson, Terence J. (Stellenbosch University. Department of Botany and Zoology) ;
Martí-Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ;
Farré, Marta (University of Kent. School of Biosciences) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Studying the similarities and differences in genomic interactions between species provides fertile grounds for determining the evolutionary dynamics underpinning genome function and speciation. Here, we describe the principles of 3D genome folding in vertebrates and show how lineage-specific patterns of genome reshuffling can result in different chromatin configurations. [...]
2022 -  10.1016/j.celrep.2022.111839
Cell reports, Vol. 41, Issue 12 (December 2022) , art. 111839
|
|
|
2.
|
|
17 p, 7.4 MB |
The impact of chromosomal fusions on 3D genome folding and recombination in the germ line
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Álvarez-González, Lucía (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Marin Gual, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Florit-Sabater, Beatriu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Capilla, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Sanchéz-Guillén, Rosa Ana (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Sarrate Navas, Zaida (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ;
Searle, Jeremy B. (Cornell University. Department of Ecology and Evolutionary Biology) ;
Ventura Queija, Jacinto (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Animal, de Biologia Vegetal i d'Ecologia) ;
Marti-Renom, Marc A. (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
The spatial folding of chromosomes inside the nucleus has regulatory effects on gene expression, yet the impact of genome reshuffling on this organization remains unclear. Here, we take advantage of chromosome conformation capture in combination with single-nucleotide polymorphism (SNP) genotyping and analysis of crossover events to study how the higher-order chromatin organization and recombination landscapes are affected by chromosomal fusions in the mammalian germ line. [...]
2021 - 10.1038/s41467-021-23270-1
Nature communications, Vol. 12 (May 2021) , art. 2981
|
|
|
3.
|
|
13 p, 942.2 KB |
New Metrics to Assess Type 2 Diabetes after Bariatric Surgery : the "Time-Within-Remission Range"
/
de Hollanda, Ana (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Sánchez, Enric (Hospital Arnau de Vilanova (Lleida, Catalunya)) ;
Vilarrasa, Nuria (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Gregorio Oliva, José (Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (Santa Cruz de Tenerife)) ;
Fernández-Soto, María Luisa (Hospital Universitario San Cecilio (Granada)) ;
Salas-Salvadó, Jordi (Institut d'Investigació Sanitària Pere Virgili) ;
Ballesteros-Pomar, María D. (Hospital Universitario de León) ;
Ciudin, Andreea (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Torres, Ferran (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Pediatria, Obstetrícia i Ginecologia i Medicina Preventiva i Salut Pública) ;
Vidal, Concepción (Hospital Royo Villanova) ;
Morales, María José (Complexo Hospitalario Universitario de Vigo) ;
Valdés, Sergio (Instituto de Salud Carlos III) ;
Pellitero, Silvia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Miñambres, Inka (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Masmiquel, Lluís (Hospital Universitari Son Llàtzer (Palma de Mallorca, Balears)) ;
Goday Arnó, Albert (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Suarez, Lorena (Hospital Universitario Central de Asturias) ;
Flores, Lilliam (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Bueno, Marta (Hospital Arnau de Vilanova (Lleida, Catalunya)) ;
Caixàs i Pedragós, Assumpta (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)) ;
Bretón, Irene (Hospital General Universitario Gregorio Marañón) ;
Cámara, Rosa (Hospital Universitari i Politècnic La Fe (València)) ;
Olbeyra, Romina (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Penso, Rona (Hospital Central de la Defensa Gómez Ulla) ;
de la Cruz, María José (Hospital Universitario Fundación Jiménez Díaz) ;
Simó-Servat, Andreu (Hospital Universitari MútuaTerrassa (Terrassa, Catalunya)) ;
Pereyra-García, Francisca María (Hospital Universitario Nuestra Señora de Candelaria (Santa Cruz de Tenerife)) ;
López-Mezquita, Elena Teresa (Hospital Universitario San Cecilio (Granada)) ;
Gils, Anna (Hospital Universitari Sant Joan de Reus (Tarragona)) ;
Fidilio, Enzamaria (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Bandrés, Orosia (Hospital Royo Villanova) ;
Martínez, Ángel (Complexo Hospitalario Universitario de Vigo) ;
Abuín, José Manuel (Hospital Regional Universitario de Málaga) ;
Marques-Pamies, Montserrat (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Tuneu, Laura (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Arteaga, Magdalena (Hospital Universitari Son Llàtzer (Palma de Mallorca, Balears)) ;
Castañer, Olga (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Goñi, Fernando (Hospital de Basurto (Bilbao, Biscaia)) ;
Arrizabalaga, Cristina (Hospital de Basurto (Bilbao, Biscaia)) ;
Antonio Botana, Manuel (Hospital Universitario Lucus Augusti (Lugo)) ;
Calañas, Alfonso (Hospital Universitario Reina Sofía (Còrdova, Espanya)) ;
Rebollo, Ángel (Hospital Universitario Reina Sofía (Còrdova, Espanya)) ;
Lecube, Albert (Hospital Arnau de Vilanova (Lleida, Catalunya)) ;
Rubio, Miguel Angel (Hospital Clínico San Carlos (Madrid))
Almost one third of patients do not achieve type 2 diabetes remission after bariatric surgery or are unable to sustain this effect long term. Our objective was to delve further into the dynamic responses of diabetes after bariatric surgery and to evaluate the "time-within-remission range" as a variable of metabolic control. [...]
2020 - 10.3390/jcm9041070
Journal of clinical medicine, Vol. 9 Núm. 4 (2020) , p. 1070
|
|
|
4.
|
|
13 p, 1.3 MB |
Chromosomal differentiation in genetically isolated populations of the marsh-specialist crocidura suaveolens (Mammalia : Soricidae)
/
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Biedma, Luis (Universidad de Huelva. Departamento de Ciencias Integradas) ;
Calzada, Javier (Universidad de Huelva. Departamento de Ciencias Integradas) ;
Román, Jacinto (Estación Biológica de Doñana) ;
Lozano, Alberto, 1966- (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cortés, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Godoy, José A. (Estación Biológica de Doñana) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
The genus Crocidura represents a remarkable model for the study of chromosome evolution. This is the case of the lesser white-toothed shrew (Crocidura suaveolens), a representative of the Palearctic group. [...]
2020 - 10.3390/genes11030270
Genes, Vol. 11, issue 3 (March 2020) , art. 270
|
|
|
5.
|
|
19 p, 6.2 MB |
Extreme genomic erosion after recurrent demographic bottlenecks in the highly endangered Iberian lynx
/
Abascal, Federico (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Corvelo, André (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Cruz, Fernando (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Villanueva-Cañas, J. L. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marcet-Houben, Marina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martínez-Cruz, B. (Estación Biológica de Doñana) ;
Cheng, J. Y. (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Prieto, P. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Quesada, V. (Universidad de Oviedo. Instituto Universitario de Oncología) ;
Quilez, J. (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Li, G. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Rubio-Camarillo, M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Frias, Leonor (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Ribeca, Paolo (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Capella-Gutiérrez, Salvador (Centre de Regulació Genòmica) ;
Rodríguez, J. M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Câmara, F. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lowy, Ernesto (Centre de Regulació Genòmica) ;
Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica) ;
Erb, I. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Tress, M. L. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Rodriguez-Ales, J. L. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Orera, J. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Reverter, F. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Casas-Marce, M. (Estación Biológica de Doñana) ;
Soriano, L. (Estación Biológica de Doñana) ;
Arango, Javier R (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ;
Derdak, Sophia (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Galán, Beatriz (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ;
Blanc, Julie (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Gut, Marta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Lorente-Galdos, Belen (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ;
Andrés Nieto, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
López-Otín, C. (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ;
Valencia, A. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Gut, I. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
García, J. L. (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ;
Guigó, R. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Murphy, W. J. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
Marques-Bonet, Tomas. 1975- (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Roma, Guglielmo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Notredame, C. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mailund, Thomas (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ;
Albà, M. Mar (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica) ;
Alioto, Tyler Scott (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ;
Godoy, J. A. (Estación Biológica de Doñana)
Background: Genomic studies of endangered species provide insights into their evolution and demographic history, reveal patterns of genomic erosion that might limit their viability, and offer tools for their effective conservation. [...]
2016 - 10.1186/s13059-016-1090-1
Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 251
|
|
|
6.
|
|
26 p, 7.4 MB |
Three-dimensional genomic structure and cohesin occupancy correlate with transcriptional activity during spermatogenesis
/
Vara González, Covadonga (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Paytuví-Gallart, Andreu (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Cuartero, Yasmina (Centre de Regulació Genòmica) ;
Le Dily, François (Centre de Regulació Genòmica) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ;
Salvà Castro, Judith (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Gomez Hernández, Laura (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech) ;
Fornas, Òscar (Centre de Regulació Genòmica) ;
Martín Pendas, Alberto (Centro de Investigación del Cáncer) ;
Heyn, Holger (Centre de Regulació Genòmica) ;
Waters, Paul D. (University of New South Wales. School of Biotechnology and Biomolecular Sciences) ;
Martí Renom, Marc A. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Mammalian gametogenesis involves dramatic and tightly regulated chromatin remodeling, whose regulatory pathways remain largely unexplored. Here, we generate a comprehensive high-resolution structural and functional atlas of mouse spermatogenesis by combining in situ chromosome conformation capture sequencing (Hi-C), RNA sequencing (RNA-seq), and chromatin immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq) of CCCTC-binding factor (CTCF) and meiotic cohesins, coupled with confocal and super-resolution microscopy. [...]
2019 - 10.1016/j.celrep.2019.06.037
Cell reports, Vol. 28, issue 2 (Jul. 2019) , p. 352-367
|
|
|
7.
|
|
24 p, 287.2 KB |
Radiobiology and Reproduction : What Can We Learn from Mammalian Females?
/
Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ;
García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Garcia-Caldés, Montserrat (Montserrat) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Ionizing radiation damages DNA and induces mutations as well as chromosomal reorganizations. Although radiotherapy increases survival among cancer patients, this treatment does not come without secondary effects, among which the most problematic is gonadal dysfunction, especially in women. [...]
2012 - 10.3390/genes3030521
Genes, Vol. 3 (2012) , p. 521-544
|
|
visitant ::
identificació
alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al 
canal RSS.
