Results overview: Found 11 records in 0.04 seconds.
Articles, 10 records found
Research literature, 1 records found
Articles 10 records found  
1.
21 p, 2.1 MB Co-expression network analysis predicts a key role of microRNAs in the adaptation of the porcine skeletal muscle to nutrient supply / Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; González Prendes, Rayner (Universitat de Lleida) ; Tibau, Joan (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The role of non-coding RNAs in the porcine muscle metabolism is poorly understood, with few studies investigating their expression patterns in response to nutrient supply. Therefore, we aimed to investigate the changes in microRNAs (miRNAs), long intergenic non-coding RNAs (lincRNAs) and mRNAs muscle expression before and after food intake. [...]
2020 - 10.1186/s40104-019-0412-z
Journal of animal science and biotechnology, Vol. 11 (January 2020) , art. 10  
2.
18 p, 2.1 MB Comparing the mRNA expression profile and the genetic determinism of intramuscular fat traits in the porcine gluteus medius and longissimus dorsi muscles / González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pena i Subirà, Ramona Natacha (Universitat de Lleida-Agrotecnio Centre. Departament de Ciència Animal) ; Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Cánovas, Ángela (University of Guelph. Centre for Genetic Improvement of Livestock. Department of Animal Biosciences (Canada)) ; Díaz, Isabel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Noguera Jiménez, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries. Programa de cria i genètica d'animals) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Mercadé Carceller, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments
Background: Intramuscular fat (IMF) content and composition have a strong impact on the nutritional and organoleptic properties of porcine meat. The goal of the current work was to compare the patterns of gene expression and the genetic determinism of IMF traits in the porcine gluteus medius (GM) and longissimus dorsi (LD) muscles. [...]
2019 - 10.1186/s12864-019-5557-9
BMC genomics, Vol. 20 (March 2019) , art. 170  
3.
12 p, 977.9 KB Role of AMPK signalling pathway during compensatory growth in pigs / Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; González-Rodríguez, Olga (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pascual, Mariam (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Panella Riera, Núria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Díaz Reviriego, Isabel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Tibau, Joan (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Universitat Autònoma de Barcelona
Background: The molecular basis of compensatory growth in monogastric animals has not yet been fully explored. Herewith, in this study we aim to determine changes in the pig skeletal muscle transcriptome profile during compensatory growth following a feed restriction period. [...]
2018 - 10.1186/s12864-018-5071-5
BMC genomics, Vol. 19 (September 2018) , art. 682  
4.
17 p, 1.8 MB Integrating genome-wide co-association and gene expression to identify putative regulators and predictors of feed efficiency in pigs / Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ballester Devis, Maria (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Sánchez Serrano, Juan Pablo (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
Background: Feed efficiency (FE) has a major impact on the economic sustainability of pig production. We used a systems-based approach that integrates single nucleotide polymorphism (SNP) co-association and gene-expression data to identify candidate genes, biological pathways, and potential predictors of FE in a Duroc pig population. [...]
2019 - 10.1186/s12711-019-0490-6
Genetics, selection, evolution, Vol. 51 (September 2019) , art. 48  
5.
15 p, 2.0 MB About the existence of common determinants of gene expression in the porcine liver and skeletal muscle / González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Zidi, Ali (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramayo-Caldas, Yuliaxis (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cánovas Tienda, Ángela (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Background: The comparison of expression QTL (eQTL) maps obtained in different tissues is an essential step to understand how gene expression is genetically regulated in a context-dependent manner. In the current work, we have compared the transcriptomic and eQTL profiles of two porcine tissues (skeletal muscle and liver) which typically show highly divergent expression profiles, in 103 Duroc pigs genotyped with the Porcine SNP60 BeadChip (Illumina) and with available microarray-based measurements of hepatic and muscle mRNA levels. [...]
2019 - 10.1186/s12864-019-5889-5
BMC genomics, Vol. 20 (June 2019) , art. 518  
6.
9 p, 732.7 KB RNA-seq based detection of differentially expressed genes in the skeletal muscle of Duroc pigs with distinct lipid profiles / Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cánovas Tienda, Ángela (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Canela-Xandri, Oriol (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries)
We have used a RNA-seq approach to investigate differential expression in the skeletal muscle of swine (N=52) with divergent lipid profiles i. e. HIGH (increased intramuscular fat and muscle saturated and monounsaturated fatty acid contents, higher serum lipid concentrations and fatness) and LOW pigs (leaner and with an increased muscle polyunsaturated fatty acid content). [...]
2017 - 10.1038/srep40005
Scientific reports (Nature Publishing Group), Vol. 7 (2017) , art. 40005  
7.
9 p, 875.1 KB Joint QTL mapping and gene expression analysis identify positional candidate genes influencing pork quality traits / González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Cánovas Tienda, Ángela (University of Guelph. Department of Animal Biosciences) ; Manunza, Arianna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica Animal) ; Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Noguera Jiménez, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Pena i Subirà, Ramona Natacha (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Meat quality traits have an increasing importance in the pig industry because of their strong impact on consumer acceptance. Herewith, we have combined phenotypic and microarray expression data to map loci with potential effects on five meat quality traits recorded in the longissimus dorsi (LD) and gluteus medius (GM) muscles of 350 Duroc pigs, i. [...]
2017 - 10.1038/srep39830
Scientific reports (Nature Publishing Group), Vol. 7 (2017) , art. 39830  
8.
12 p, 786.7 KB Differential expression of mRNA isoforms in the skeletal muscle of pigs with distinct growth and fatness profiles / Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Castelló Farré, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Cánovas Tienda, Ángela (University of Guelph. Department of Animal Biosciences)
Background: the identification of genes differentially expressed in the skeletal muscle of pigs displaying distinct growth and fatness profiles might contribute to identify the genetic factors that influence the phenotypic variation of such traits. [...]
2018 - 10.1186/s12864-018-4515-2
BMC genomics, Vol. 19 (2018) , art. 145  
9.
11 p, 2.1 MB Nutrient supply affects the mRNA expression profile of the porcine skeletal muscle / Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Quintanilla, Raquel (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Tibau, Joan (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Gil, Marta (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Mármol-Sánchez, Emilio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; González-Rodríguez, Olga (Capes Foundation) ; González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Amills i Eras, Marcel (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
Background: The genetic basis of muscle fat deposition in pigs is not well known. So far, we have only identified a limited number of genes involved in the absorption, transport, storage and catabolism of lipids. [...]
2017 - 10.1186/s12864-017-3986-x
BMC genomics, Vol. 18 (Aug. 2017) , art. 603  
10.
12 p, 237.4 KB A genome-wide association analysis for porcine serum lipid traits reveals the existence of age-specific genetic determinants / Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Quintanilla, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; González Prendes, Rayner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Pena i Subirà, Ramona Natacha (Universitat de Lleida. Departament de Producció Animal) ; Tibau, Joan (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Mercadé Carceller, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Castelló Farré, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ; Aznárez, Nitdia (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Hernández Sánchez, Jules (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ; Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
Background: The genetic determinism of blood lipid concentrations, the main risk factor for atherosclerosis, is practically unknown in species other than human and mouse. Even in model organisms, little is known about how the genetic determinants of lipid traits are modulated by age-specific factors. [...]
2014 - 10.1186/1471-2164-15-758
BMC genomics, Vol. 15, N. 758 (September 2014) , p. 1-12  

Research literature 1 records found  
1.
200 p, 3.2 MB Genome-wide association analysis of meat quality and gene expression phenotypes in Duroc pigs / González Prendes, Rayner ; Amills i Eras, Marcel, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments ; Universitat Autònoma de Barcelona. Centre de Recerca en Agrigenòmica
El principal objetivo de la presente tesis fue identificar regiones genómicas asociadas con la variación fenotípica de caracteres relacionados con la calidad de la carne. Para ello se realizaron estudios de asociación genómica (GWAS) para el contenido y la composición de la grasa intramuscular así como para la conductividad eléctrica, el pH, y el color de la carne. [...]
The main objective of this thesis was to identify genomic regions associated with technological and lipid composition meat quality traits. In this way, we carried out a GWAS for 57 phenotypes measured in the gluteus medius (GM) and longissimus dorsi (LD) muscles of pigs from a commercial Duroc line. [...]

Bellaterra : Universitat Autònoma de Barcelona, 2017  

Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.