Results overview: Found 5 records in 0.02 seconds.
Articles, 5 records found
Articles 5 records found  
1.
8 p, 1.1 MB Selective single molecule sequencing and assembly of a human Y chromosome of African origin / Kuderna, Lukas F. K. (Institute of Evolutionary Biology (UPF-CSIC)) ; Lizano, Esther (Institute of Evolutionary Biology (UPF-CSIC)) ; Julià, Eva (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Gómez-Garrido, Jessica (Centre de Regulació Genòmica) ; Serres-Armero, Aitor (Institute of Evolutionary Biology (UPF-CSIC)) ; Kuhlwilm, Martin (Institute of Evolutionary Biology (UPF-CSIC)) ; Antoni Alandes, Regina (Centre de Regulació Genòmica) ; Alvarez-Estape, Marina (Institute of Evolutionary Biology (UPF-CSIC)) ; David Juan (Institute of Evolutionary Biology (UPF-CSIC)) ; Heath, Simon (Centre de Regulació Genòmica) ; Alioto, Tyler (Centre de Regulació Genòmica) ; Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ; Gut, Ivo (Centre de Regulació Genòmica) ; Heide Schierup, Mikkel (Aarhus University. Bioinformatics Research Center) ; Fornas, Oscar (Centre de Regulació Genòmica) ; Marquès i Bonet, Tomàs, 1975- (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont)
Mammalian Y chromosomes are often neglected from genomic analysis. Due to their inherent assembly difficulties, high repeat content, and large ampliconic regions, only a handful of species have their Y chromosome properly characterized. [...]
2019 - 10.1038/s41467-018-07885-5
Nature communications, Vol. 10 (January 2019) , art. 4  
2.
11 p, 1.3 MB Benchmarking of Whole Exome Sequencing and Ad Hoc Designed Panels for Genetic Testing of Hereditary Cancer / Feliubadaló, Lidia (Institut Català d'Oncologia) ; Tonda, Raúl (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG)) ; Gausachs, Mireia (Institut Català d'Oncologia) ; Trotta, Jean-Rémi (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG)) ; Castellanos, Elisabeth (Institut Germans Trias i Pujol) ; López-Doriga, Adriana (Institut Català d'Oncologia) ; Teulé, Àlex (Institut Català d'Oncologia) ; Tornero,Eva (Institut Català d'Oncologia) ; del Valle, Jesús (Institut Català d'Oncologia) ; Gel,Bernat (Institut Germans Trias i Pujol) ; Gut,Marta (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG)) ; Pineda,Marta (Institut Català d'Oncologia) ; González,Sara (Institut Català d'Oncologia) ; Menéndez,Mireia (Institut Català d'Oncologia) ; Navarro, Matilde (Institut Català d'Oncologia) ; Capellá, Gabriel (Institut Català d'Oncologia) ; Gut, Ivo (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG)) ; Serra, Eduard (Institut Germans Trias i Pujol) ; Brunet, Joan (Institut Català d'Oncologia. IdibGi Girona) ; Beltran, Sergi (Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG)) ; Lázaro, Conxi (Institut Català d'Oncologia)
Next generation sequencing panels have been developed for hereditary cancer, although there is some debate about their cost-effectiveness compared to exome sequencing. The performance of two panels is compared to exome sequencing. [...]
2017 - 10.1038/srep37984
Scientific Reports, 2017-11  
3.
9 p, 1.2 MB From Wet‐Lab to Variations : Concordance and Speed of Bioinformatics Pipelines for Whole Genome and Whole Exome Sequencing / Laurie, Steve (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Fernandez‐Callejo, Marcos (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Marco‐Sola, Santiago (Universitat Pompeu Fabra) ; Trotta, Jean‐Remi (Universitat Pompeu Fabra) ; Camps, Jordi (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Chacón, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Espinosa, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Gut, Marta (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Gut, Ivo (Universitat Pompeu Fabra) ; Heath, Simon (Universitat Pompeu Fabra) ; Beltran, Sergi (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica)
As whole genome sequencing becomes cheaper and faster, it will progressively substitute targeted next‐generation sequencing as standard practice in research and diagnostics. However, computing cost–performance ratio is not advancing at an equivalent rate. [...]
2016 - 10.1002/humu.23114
Human Mutation, Vol. 37, Issue 12 (December 2016) , p. 1263-1271  
4.
12 p, 1.0 MB Genome sequence of the olive tree, Olea europaea / Cruz, Fernando (Universitat Pompeu Fabra) ; Julca, Irene (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Gómez-Garrido, Jèssica (Universitat Pompeu Fabra) ; Loska, Damian (The Barcelona Institute of Science and Technology) ; Marcet-Houben, Marina (The Barcelona Institute of Science and Technology) ; Cano, Emilio (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Galán, Beatriz (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Frias, Leonor (Universitat Pompeu Fabra) ; Ribeca, Paolo (Universitat Pompeu Fabra) ; Derdak, Sophia (Universitat Pompeu Fabra) ; Gut, Marta (Universitat Pompeu Fabra) ; Sánchez Fernández, Manuel (Grupo Santander) ; García, José Luis (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Gut, Ivo (Universitat Pompeu Fabra) ; Vargas, Pablo (Royal Botanical Garden of Madrid) ; Alioto, Tyler (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Gabaldón, Toni (CRG-Centre for Genomic Regulation)
The Mediterranean olive tree (Olea europaea subsp. europaea) was one of the first trees to be domesticated and is currently of major agricultural importance in the Mediterranean region as the source of olive oil. [...]
2016 - 10.1186/s13742-016-0134-5
GigaScience, Vol. 5, Issue 1 (December 2016) , art. 29  
5.
18 p, 591.0 KB Genomics of ecological adaptation in cactophilic Drosophila / Guillén Montalbán, Yolanda (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Rius Camps, Nuria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Delprat Obeaga, Alejandra (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Williford, Anna (University of Texas. Department of Biology) ; Muyas Remolar, Francesc (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Puig Font, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Casillas Viladerrams, Sònia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Ràmia Jesús, Miquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Egea Sánchez, Raquel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Negre de Bofarull, Bárbara (Centre de Regulació Genòmica (Barcelona)) ; Mir, Gisela (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Camps, Jordi (Centro Nacional de Análisis Genómico) ; Moncunill, Valentí (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ; Ruiz-Ruano, Francisco J. (Universidad de Granada. Departamento de Genética) ; Cabrero, Josefa (Universidad de Granada. Departamento de Genética) ; De Lima, Leonardo G. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ; Dias, Guilherme B. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ; Ruiz, Jeronimo C. (Centro de Pesquisa René Rachou) ; Kapusta, Aurélie (University of Utah. Department of Human Genetics) ; Garcia Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gut, Marta (Centro Nacional de Análisis Genómico) ; Gut, Ivo (Centro Nacional de Análisis Genómico) ; Torrents, David (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ; Camacho, Juan P. (Universidad de Granada. Departamento de Genética) ; Kuhn, Gustavo C.S. G. (Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Biologia Geral) ; Feschotte, Cédric (University of Utah. Department of Human Genetics) ; Clark, Andrew G. (Cornell University. Department of Molecular Biology and Genetics) ; Betrán, Esther (University of Texas. Department of Biology) ; Barbadilla Prados, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Ruiz, Alfredo, (Ruiz Panadero) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Cactophilic Drosophila species provide a valuable model to study gene-environment interactions and ecological adaptation. Drosophila buzzatii and Drosophila mojavensis are two cactophilic species that belong to the repleta group, but have very different geographical distributions and primary host plants. [...]
2014 - 10.1093/gbe/evu291
Genome biology and evolution, Vol. 7, no. 1 (Jan. 2015) , p. 349-366  

See also: similar author names
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.