Results overview: Found 42 records in 0.02 seconds.
Articles, 2 records found
Contributions to meetings and congresses, 1 records found
Research literature, 22 records found
Course materials, 17 records found
Articles 2 records found  
1.
11 p, 1.1 MB Optimized next-generation sequencing genotype-haplotype calling for genome variability analysis / Navarro Fernández, Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Nevado, Bruno (University of Oxford. Department of Plant Sciences) ; Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Vera Rodríguez, Gonzalo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ramos Onsins, Sebastián E. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The accurate estimation of nucleotide variability using next-generation sequencing data is challenged by the high number of sequencing errors produced by new sequencing technologies, especially for nonmodel species, where reference sequences may not be available and the read depth may be low due to limited budgets. [...]
2017
Evolutionary bioinformatics, Vol. 13, (August 2017) , p. 1-11  
2.
6 p, 1.2 MB Approaching long genomic regions and large recombination rates with msParSm as an alternative to MaCS / Montemuiño, Carlos (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Espinosa Morales, Antonio Miguel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Moure López, Juan Carlos (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Vera Rodríguez, Gonzalo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Ramos Onsins, Sebastián E. (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The msParSm application is an evolution of msPar, the parallel version of the coalescent simulation program ms, which removes the limitation for simulating long stretches of DNA sequences with large recombination rates, without compromising the accuracy of the standard coalescence. [...]
2016 - 10.4137/EBO.S40268
Evolutionary bioinformatics online, Vol. 12 (Oct. 2016) , p. 223-228  

Contributions to meetings and congresses 1 records found  
1.
9 p, 524.7 KB Sistema web per a la gestió de problemes i pràctiques / Heymann, Elisa (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola Tècnica Superior d'Enginyeria. Departament d’Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Cesar, Eduardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola Tècnica Superior d'Enginyeria. Departament d’Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Cortés, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola Tècnica Superior d'Enginyeria. Departament d’Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola Tècnica Superior d'Enginyeria. Departament d’Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Suppi Boldrito, Remo (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola Tècnica Superior d'Enginyeria. Departament d’Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Sorribes Gomis, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius)
El projecte desenvolupat consisteix en una eina que ajuda a que els professors deixin de banda el paper de relator-dictador d’apunts i es transformin en tutors-formadors que exerceixin de guia en l’aprenentatge de l’estudiant. [...]
2007
Jornades d'Innovació Docent de la UAB, 4es : 2007  

Research literature 22 records found  1 - 10nextend  jump to record:
1.
12 p, 2.7 MB Servicio para el desarrollo de aplicaciones en el cloud basado en Euclid / Riera Marcer, Marc ; Hernández Budé, Porfidio, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Un proyecto en continuo desarrollo por la Agencia Espacial Europea (ESA), y diseñado para comprender el origen de la expansión acelerada del universo, es Euclid. Este proyecto, realiza un proceso de captación de imágenes y datos a través de un satélite, los cuales son almacenados, y posteriormente procesados en sus respectivos centros de datos. [...]
Un projecte en continu desenvolupament per l'Agència Espacial Europea (ESA), i dissenyat per comprendre l'origen de l'expansió accelerada de l'univers, és Euclid. Aquest projecte, realitza un procés de captació d'imatges i dades a través d'un satèl·lit, les quals són emmagatzemades, i posteriorment processades en els seus respectius centres de dades. [...]
A project in continuous development by the European Space Agency (ESA), and designed to understand the origin of the accelerated expansion of the universe, is Euclid. This project performs a process of capturing images and data through a satellite, which are stored, and then processed in their respective data centers. [...]

2018-07-02
Enginyeria Informàtica [958]  
2.
124 p, 6.3 MB Planificador consciente del almacenamiento para Multiworkflows en Cluster Galaxy / Acevedo Giménez, César Esteban, autor. ; Hernández Budé, Porfidio, supervisor acadèmic. ; Espinosa Morales, Antonio Miguel, supervisor acadèmic. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius.
En l'àmbit bioinformàtic, l'experimentació es realitza a través de seqüències d'execucions d'aplicacions, cada aplicació utilitza com a arxiu d'entrada el generat per l'aplicació anterior. Aquest procés d'anàlisi format per una llista d'aplicacions descrivint una cadena de dependència es diu Workflow. [...]
En el ámbito bioinformático, la experimentación se realiza a través de secuencias de ejecuciones de aplicaciones, cada aplicación utiliza como archivo de entrada el generado por la aplicación anterior. [...]
In the bioinformatic field, experimentation is performed through sequential execution of applications, each application uses as input file the one generated by the previous application. This analysis process consisting of a list of applications describing a dependency chain is called Workflow. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2017.  
3.
49 p, 1.8 MB Cuadro de mando para la dirección general de una compañía / Coronilla Arenilla, Simón José ; Hernández Budé, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
En este documento encontraremos una solución a un problema propuesto. Se hará un estudio de la situación, una planificación temporal y de costes. Encontraremos también el diseño y la implementación propuesta para una primera versión de la solución del problema propuesto de una aplicación personalizada para la visualización de los enlaces KPI de una compañía. [...]
En aquest document trobarem una solució a un problema proposat. Es farà un estudi de la situació, una planificació temporal i de costos. Trobarem també el disseny i la imprementació proposada per a una primera versió de la solució del problema proposat d'una aplicació personalitzada per a la visualització dels enllaços KPI d'una companyia. [...]
In this document we will find a solution to a proposed problem. A study of the situation, a time schedule and costs will be. Also we will find the design and implementation proposal for a first version of the solution proposed, a custom application for displaying KPIs links. [...]

2015  
4.
113 p, 1.5 MB Planificación de trabajos en clusters hadoop compartidos / Lopes Bezerra, Aprigio Augusto ; Hernández Budé, Porfidio, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius
La industria y los científicos han buscado alternativas para procesar con eficacia el gran volumen de datos que se generan en diferentes áreas del conocimiento. MapReduce se presenta como una alternativa viable para el procesamiento de aplicaciones intensivas de datos. [...]
Industry and scientists have sought alternatives to process effectively the large volume of data generated in different areas of knowledge. MapReduce is presented as a viable alternative for the processing of data intensive application. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2015  
5.
171 p, 1.9 MB Planificación de diferentes clases de aplicaciones en entornos no dedicados considerando procesadores multicore / García Gutiérrez, José Ramón ; Hernández Budé, Porfidio, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius)
A día de hoy es prácticamente imposible encontrar una gran institución que no disponga de un parque de ordenadores considerable, debido al alto nivel de informatización de la sociedad actual. El enorme potencial que representan estos miles de ordenadores atrae poderosamente la atención en los ámbitos científicos e industriales, generando opciones viables para su aprovechamiento. [...]
Today it is virtually impossible to find an institution that does not have a considerable amount of computers, due to the high level of computerization of society. The enormous potential of these large number of computers attract a lot of attention in science and industry, generating viable options for their use. [...]

Bellaterra: Universitat Autònoma de Barcelona, 2011  
6.
110 p, 2.7 MB Integración de Hadoop con planificadores batch / Díaz Cañizares, José Fidel ; Hernández Budé, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Cada vez es mayor el número de aplicaciones desarrolladas en el ámbito científico, como en la Bioinformática o en las Geociencias, escritas bajo el modelo MapReduce, empleando herramientas de código abierto como Apache Hadoop. [...]
Cada cop és més gran el número d'aplicacions desenvolupades a l'àmbit científic, com la Bioinformàtica o les Geociències, escrites sota el model MapReduce, fent servir eines de codi obert com Apache Hadoop. [...]
A growing number of codes in scientific domain such a Bioinformatics and Geosciences are being written using open source MapReduce tools such as Apache Hadoop. Of the need to integrate Hadoop in HPC environments, to make possible to execute applications developed under the MapReduce paradigm, born this project. [...]

2011  
7.
106 p, 3.4 MB Extensió de COMP Superscalar / Rafanell Mas, Roger ; Hernández Budé, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
COMPSs és un entorn de programació paral·lela desenvolupat per BSC-CNS. Aquest projecte busca estendre aquest entorn per tal de dotar-lo de funcionalitats inicialment no suportades. Aquest conjunt d'extensions radiquen principalment en la implementació de mecanismes que permetin incrementar la flexibilitat, robustesa i polivalència del sistema.
COMPSs es un entorno de programación paralela desarrollado por BSC-CNS. Este proyecto busca extender el entorno para dotarlo de funcionalidades inicialmente no soportadas. Este conjunto de extensiones radican principalmente en la implementación de mecanismos que permitan incrementar la flexibilidad, robustez y polivalencia del sistema.
COMPSs is a parallel programming environment developed by BSC-CNS. The project aim is extend this environment giving it some features that were not initially supported. This set of extensions lies mainly in the implementation of mechanisms that allow to increase the flexibility, robustness and system versatility.

2011
2 documents
8.
71 p, 1.2 MB Programació d'aplicacions bioinformàtiques / Bosch Muntal, Josep Maria ; Hernández Budé, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Avui en dia la biologia aporta grans quantitats de dades que només la informàtica pot tractar. Les aplicacions bioinformàtiques són la més important eina d'anàlisi i comparació que tenim per entendre la vida i aconseguir desxifrar aquestes dades. [...]
Hoy en día la biología aporta grandes cantidades de datos que solo con la informática podemos tratar. Las aplicaciones bioinformáticas son la más importante herramienta de análisis y comparación para entender la vida y lograr descifrar estos datos. [...]
Biology is nowadays able to extract great amounts of data from which we can obtain a lot of information. Bioinformatics applications are the most important analysis tool we have to decode this data and to understand life. [...]

2010  
9.
101 p, 3.1 MB MR MAQ : algorisme de Read Mapping utilitzant la plataforma Hadoop / Protasio Ramírez, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria de la Informació i de les Comunicacions) ; Hernández Budé, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
L'èxit del Projecte Genoma Humà (PGH) l'any 2000 va fer de la “medicina personalitzada” una realitat més propera. Els descobriments del PGH han simplificat les tècniques de seqüenciació de tal manera que actualment qualsevol persona pot aconseguir la seva seqüència d'ADN complerta. [...]
El éxito del Proyecto Genoma Humano (PGH) en el año 2. 000 hizo de la “medicina personalizada” una relidad más cercana. Los descubrimientos del PGH han simplificado las técnicas de secuenciación de tal manera que actualmente cualquier persona puede conseguir su secuencia de ADN completa. [...]
In the 2000th the Human Genome Project (PGH) was accomplished successfully and it made “personalized medicine” a closer reality. The PGH has simplified the sequencing techniques in a high way so nowadays anyone can get his full ADN sequence. [...]

2010  
10.
81 p, 1.7 MB El impacto de las aplicaciones intensivas de E/S en la planificación de trabajos en clusters no-dedicados / Bezerra, Aprigio Augusto Lopes ; Hernández Budé, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius
Con la mayor capacidad de los nodos de procesamiento en relación a la potencia de cómputo, cada vez más aplicaciones intensivas de datos como las aplicaciones de la bioinformática, se llevarán a ejecutar en clusters no dedicados. [...]
Amb la major capacitat dels nodes de processament en relació a potència de còmput, cada vegada més aplicacions intensives de dades com les aplicacions de la bioinformàtica, es duran a executar en clusters no dedicats. [...]
With the increased capacity of processing nodes in relation to computing power, increasingly data-intensive applications such as applications of bioinformatics, will be run on non-dedicated clusters. [...]

2010  

Research literature : 22 records found   1 - 10nextend  jump to record:
Course materials 17 records found  1 - 10next  jump to record:
1.
6 p, 92.1 KB Sistemes Distribuïts [102740] / Hernández Bude, Porfidio ; Alcaraz Rodriguez, Jordi ; Espinosa Morales, Antonio ; Panadero Martinez, Javier ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La matèria de Sistemes Distribuïts pretén mostrar els conceptes fonamentals, i problemàtiques més habituals dels sistemes distribuïts, així com les tècniques més usuals de gestió dels recursos en aquest tipus de sistemes. [...]
2018-19
Grau en Enginyeria Informàtica [958]  
2.
5 p, 90.0 KB Gestió i Administració de Xarxes [102776] / Suppi Boldrito, Remo Lucio ; Hernández Bude, Porfidio ; Alcaraz Rodriguez, Jordi ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Proporcionar a l'alumne els coneixements necessaris per a l'administració i gestió d'una xarxa de computadors i aplicar aquests tant en aspectes de la seva configuració i del serveis típics associats com de la seva monitorització, estudi de prestacions, gestió de fallides i seguretat.
2018-19
Grau en Enginyeria Informàtica [958]  
3.
6 p, 90.9 KB Sistemes Distribuïts [102740] / Hernández Bude, Porfidio ; Hernández Juárez, Dani ; Mendez Muñoz, Victor ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La matèria de Sistemes Distribuïts pretén mostrar els conceptes fonamentals, i problemàtiques més habituals dels sistemes distribuïts, així com les tècniques més usuals de gestió dels recursos en aquest tipus de sistemes. [...]
2017-18
Grau en Enginyeria Informàtica [958]  
4.
5 p, 90.8 KB Gestió i Administració de Xarxes [102776] / Suppi Boldrito, Remo Lucio ; Hernández Bude, Porfidio ; Alcaraz Rodriguez, Jordi ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Proporcionar a l'alumne els coneixements necessaris per a l'administració i gestió d'una xarxa de computadors, tant en aspectes de la seva configuració i del serveis típics associats com de la seva monitorització, estudi de prestacions, gestió de fallides i seguretat.
2017-18
Grau en Enginyeria Informàtica [958]  
5.
6 p, 86.8 KB Sistemes Distribuïts [102740] / Hernández Bude, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La matèria de Sistemes Distribuïts pretén mostrar els conceptes fonamentals, i problemàtiques més habituals dels sistemes distribuïts, així com les tècniques més usuals de gestió dels recursos en aquest tipus de sistemes. [...]
2016-17
Enginyeria Informàtica [958]  
6.
6 p, 31.0 KB Sistemes Distribuïts [102740] / Hernández Bude, Porfidio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La matèria de Sistemes Distribuïts pretén mostrar els conceptes fonamentals, i problemàtiques més habituals dels sistemes distribuïts, així com les tècniques més usuals de gestió dels recursos en aquest tipus de sistemes. [...]
2015-16
Enginyeria Informàtica [958]  
7.
5 p, 107.8 KB Sistemes Paral·lels i Distribuïts de Còmput [43343] / Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Al final d'aquesta assignatura, els estudiants hauran de tenir prou coneixements, mètodes i habilitats tècniques per a la investigació sobre solucions innovadores als problemes dels sistemes distribuïts. [...]
At the end of this subject, students should have enough knowledge, methods and technical skills to research on innovative solutions to distributed systems problems. Competence Description Knowledge Analyze and evaluate parallel architectures and distributed computers, and advanced software development and optimization. [...]

2014-15
Modelització per a la Ciència i l'Enginyeria / Modelling for Science and Engineering [1293]
2 documents
8.
6 p, 108.3 KB Sistemes Distribuïts [102740] / Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La matèria de Sistemes Distribuïts pretén mostrar els conceptes fonamentals, i problemàtiques més habituals dels sistemes distribuïts, així com les tècniques més usuals de gestió dels recursos en aquest tipus de sistemes. [...]
2014-15
Enginyeria Informàtica [958]  
9.
5 p, 106.7 KB Sistemes Distribuïts [102740] / Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La matèria de Sistemes Distribuïts pretén mostrar els conceptes fonamentals, i problemàtiques més habituals dels sistemes distribuïts, així com les tècniques més usuals de gestió dels recursos en aquest tipus de sistemes. [...]
2013-14  
10.
4 p, 17.9 KB Gestió i Administració de Xarxes [102776] / Hernández Budé, Porfidio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Proporcionar a l'alumnes els coneixement s necessaris per l'administració i gestió d'una xarxa de computadors, tant en els aspectes de la seva configuració del serveis típic associats així com de la seva monitorització, prestacions, gestió de fallides i seguretat.
2012-13
Enginyeria Informàtica [958]  

Course materials : 17 records found   1 - 10next  jump to record:
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.