1.
|
73 p, 1.9 MB |
Parallelizing Population Genetics Applications
/
Montemuiño Sosa, Carlos ;
Hernández Budé, Porfidio, dir. ;
Ramos-Onsins, Sebastián, dir.
Amb la creixent disponibilitat de dades a escala de l'genoma per a la investigació genètica, els genetistes de poblacions moleculars han de treballar amb models més complexos, el que no pot fer-se en un temps determinat utilitzant el mètode coalescent estàndard. [...] Con la creciente disponibilidad de datos a escala del genoma para la investigación genética, los genetistas de poblaciones moleculares tienen que trabajar con modelos más complejos, lo que no puede hacerse en un tiempo determinado utilizando el método coalescente estándar. [...] With the increasing availability of genome-scale data for genetic research, molecular population geneticists need to work with more complex models, which cannot be done in a time-fashion using the standard coalescent methods. [...] Universitat Autònoma de Barcelona. Programa de Doctorat en Informàtica.
2021
|
|
2.
|
12 p, 2.7 MB |
Servicio para el desarrollo de aplicaciones en el cloud basado en Euclid
/
Riera Marcer, Marc ;
Hernández Budé, Porfidio, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Escola d'Enginyeria
Un proyecto en continuo desarrollo por la Agencia Espacial Europea (ESA), y diseñado para comprender el origen de la expansión acelerada del universo, es Euclid. Este proyecto, realiza un proceso de captación de imágenes y datos a través de un satélite, los cuales son almacenados, y posteriormente procesados en sus respectivos centros de datos. [...] Un projecte en continu desenvolupament per l'Agència Espacial Europea (ESA), i dissenyat per comprendre l'origen de l'expansió accelerada de l'univers, és Euclid. Aquest projecte, realitza un procés de captació d'imatges i dades a través d'un satèl·lit, les quals són emmagatzemades, i posteriorment processades en els seus respectius centres de dades. [...] A project in continuous development by the European Space Agency (ESA), and designed to understand the origin of the accelerated expansion of the universe, is Euclid. This project performs a process of capturing images and data through a satellite, which are stored, and then processed in their respective data centers. [...]
2018-07-02 Enginyeria Informàtica [958]
|
|
3.
|
124 p, 6.3 MB |
Planificador consciente del almacenamiento para Multiworkflows en Cluster Galaxy
/
Acevedo Giménez, César Esteban ;
Hernández Budé, Porfidio, dir. ;
Espinosa, Antonio, dir. ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius
En l'àmbit bioinformàtic, l'experimentació es realitza a través de seqüències d'execucions d'aplicacions, cada aplicació utilitza com a arxiu d'entrada el generat per l'aplicació anterior. Aquest procés d'anàlisi format per una llista d'aplicacions descrivint una cadena de dependència es diu Workflow. [...] En el ámbito bioinformático, la experimentación se realiza a través de secuencias de ejecuciones de aplicaciones, cada aplicación utiliza como archivo de entrada el generado por la aplicación anterior. [...] In the bioinformatic field, experimentation is performed through sequential execution of applications, each application uses as input file the one generated by the previous application. This analysis process consisting of a list of applications describing a dependency chain is called Workflow. [...]
[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2017.
|
|
4.
|
49 p, 1.8 MB |
Cuadro de mando para la dirección general de una compañía
/
Coronilla Arenilla, Simón José ;
Hernández Budé, Porfidio ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Escola d'Enginyeria
En este documento encontraremos una solución a un problema propuesto. Se hará un estudio de la situación, una planificación temporal y de costes. Encontraremos también el diseño y la implementación propuesta para una primera versión de la solución del problema propuesto de una aplicación personalizada para la visualización de los enlaces KPI de una compañía. [...] En aquest document trobarem una solució a un problema proposat. Es farà un estudi de la situació, una planificació temporal i de costos. Trobarem també el disseny i la imprementació proposada per a una primera versió de la solució del problema proposat d'una aplicació personalitzada per a la visualització dels enllaços KPI d'una companyia. [...] In this document we will find a solution to a proposed problem. A study of the situation, a time schedule and costs will be. Also we will find the design and implementation proposal for a first version of the solution proposed, a custom application for displaying KPIs links. [...]
2015
|
|
5.
|
|
6.
|
171 p, 1.9 MB |
Planificación de diferentes clases de aplicaciones en entornos no dedicados considerando procesadores multicore
/
García Gutiérrez, José Ramón ;
Hernández Budé, Porfidio, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius)
A día de hoy es prácticamente imposible encontrar una gran institución que no disponga de un parque de ordenadores considerable, debido al alto nivel de informatización de la sociedad actual. El enorme potencial que representan estos miles de ordenadores atrae poderosamente la atención en los ámbitos científicos e industriales, generando opciones viables para su aprovechamiento. [...] Today it is virtually impossible to find an institution that does not have a considerable amount of computers, due to the high level of computerization of society. The enormous potential of these large number of computers attract a lot of attention in science and industry, generating viable options for their use. [...]
Bellaterra: Universitat Autònoma de Barcelona, 2011
|
|
7.
|
110 p, 2.7 MB |
Integración de Hadoop con planificadores batch
/
Díaz Cañizares, José Fidel ;
Hernández Budé, Porfidio ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Escola d'Enginyeria
Cada vez es mayor el número de aplicaciones desarrolladas en el ámbito científico, como en la Bioinformática o en las Geociencias, escritas bajo el modelo MapReduce, empleando herramientas de código abierto como Apache Hadoop. [...] Cada cop és més gran el número d'aplicacions desenvolupades a l'àmbit científic, com la Bioinformàtica o les Geociències, escrites sota el model MapReduce, fent servir eines de codi obert com Apache Hadoop. [...] A growing number of codes in scientific domain such a Bioinformatics and Geosciences are being written using open source MapReduce tools such as Apache Hadoop. Of the need to integrate Hadoop in HPC environments, to make possible to execute applications developed under the MapReduce paradigm, born this project. [...]
2011
|
|
8.
|
106 p, 3.4 MB |
Extensió de COMP Superscalar
/
Rafanell Mas, Roger ;
Hernández Budé, Porfidio ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Escola d'Enginyeria
COMPSs és un entorn de programació paral·lela desenvolupat per BSC-CNS. Aquest projecte busca estendre aquest entorn per tal de dotar-lo de funcionalitats inicialment no suportades. Aquest conjunt d'extensions radiquen principalment en la implementació de mecanismes que permetin incrementar la flexibilitat, robustesa i polivalència del sistema. COMPSs es un entorno de programación paralela desarrollado por BSC-CNS. Este proyecto busca extender el entorno para dotarlo de funcionalidades inicialmente no soportadas. Este conjunto de extensiones radican principalmente en la implementación de mecanismos que permitan incrementar la flexibilidad, robustez y polivalencia del sistema. COMPSs is a parallel programming environment developed by BSC-CNS. The project aim is extend this environment giving it some features that were not initially supported. This set of extensions lies mainly in the implementation of mechanisms that allow to increase the flexibility, robustness and system versatility.
2011
2 documents
|
|
9.
|
71 p, 1.2 MB |
Programació d'aplicacions bioinformàtiques
/
Bosch Muntal, Josep Maria ;
Hernández Budé, Porfidio ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Escola d'Enginyeria
Avui en dia la biologia aporta grans quantitats de dades que només la informàtica pot tractar. Les aplicacions bioinformàtiques són la més important eina d'anàlisi i comparació que tenim per entendre la vida i aconseguir desxifrar aquestes dades. [...] Hoy en día la biología aporta grandes cantidades de datos que solo con la informática podemos tratar. Las aplicaciones bioinformáticas son la más importante herramienta de análisis y comparación para entender la vida y lograr descifrar estos datos. [...] Biology is nowadays able to extract great amounts of data from which we can obtain a lot of information. Bioinformatics applications are the most important analysis tool we have to decode this data and to understand life. [...]
2010
|
|
10.
|
101 p, 3.1 MB |
MR MAQ : algorisme de Read Mapping utilitzant la plataforma Hadoop
/
Protasio Ramírez, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Enginyeria de la Informació i de les Comunicacions) ;
Hernández Budé, Porfidio ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Escola d'Enginyeria
L'èxit del Projecte Genoma Humà (PGH) l'any 2000 va fer de la "medicina personalitzada" una realitat més propera. Els descobriments del PGH han simplificat les tècniques de seqüenciació de tal manera que actualment qualsevol persona pot aconseguir la seva seqüència d'ADN complerta. [...] El éxito del Proyecto Genoma Humano (PGH) en el año 2. 000 hizo de la "medicina personalizada" una relidad más cercana. Los descubrimientos del PGH han simplificado las técnicas de secuenciación de tal manera que actualmente cualquier persona puede conseguir su secuencia de ADN completa. [...] In the 2000th the Human Genome Project (PGH) was accomplished successfully and it made "personalized medicine" a closer reality. The PGH has simplified the sequencing techniques in a high way so nowadays anyone can get his full ADN sequence. [...]
2010
|
|