Home > Search Results: Marco Sola, Santiago
  Search Tips
Advanced Search
Search collections:
Sort by: Display results: Output format:
Results overview: Found 22 records in 0.01 seconds.
Articles, 2 records found
Contributions to meetings and congresses, 2 records found
Research literature, 3 records found
Course materials, 15 records found
Articles 2 records found  
1.
9 p, 1.2 MB From Wet-Lab to Variations : Concordance and Speed of Bioinformatics Pipelines for Whole Genome and Whole Exome Sequencing / Laurie, Steve (Centre de Regulació Genòmica) ; Fernandez-Callejo, Marcos (Centre de Regulació Genòmica) ; Marco-Sola, Santiago (Universitat Pompeu Fabra) ; Trotta, Jean-Remi (Universitat Pompeu Fabra) ; Camps, Jordi (Centre de Regulació Genòmica) ; Chacón, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Espinosa, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ; Gut, Ivo (Universitat Pompeu Fabra) ; Heath, Simon (Universitat Pompeu Fabra) ; Beltran, Sergi (Centre de Regulació Genòmica)
As whole genome sequencing becomes cheaper and faster, it will progressively substitute targeted next-generation sequencing as standard practice in research and diagnostics. However, computing cost-performance ratio is not advancing at an equivalent rate. [...]
2016 - 10.1002/humu.23114
Human mutation, Vol. 37, Issue 12 (December 2016) , p. 1263-1271  
Detailed record - Creative Commons
2.
13 p, 995.3 KB Boosting the FM-index on the GPU : effective techniques to mitigate random memory access / Chacón de San Baldomero, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Marco-Sola, Santiago (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Espinosa Morales, Antonio Miguel (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Ribeca, Paolo (The Pirbright Institute (Regne Unit)) ; Moure, Juan C (Universitat Autònoma de Barcelona)
The recent advent of high-throughput sequencing machines producing big amounts of short reads has boosted the interest in efficient string searching techniques. As of today, many mainstream sequence alignment software tools rely on a special data structure, called the FM-index, which allows for fast exact searches in large genomic references. [...]
2015 - 10.1109/TCBB.2014.2377716
IEEE/ACM Transactions on computational biology and bioinformatics, Vol. 12, No. 5 (Sep.-Oct. 2015)  
Detailed record -

Contributions to meetings and congresses 2 records found  
1.
9 p, 645.7 KB FM-index on GPU : a cooperative scheme to reduce memory footprint / Chacón de San Baldomero, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Marco-Sola, Santiago (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
The FM-index is a data structure which is seeing more and more pervasive use, in particular in the field of highthroughput bioinformatics. Algorithms based on it show a pseudo-random memory access pattern. [...]
2014 - 10.1109/ISPA.2014.10
ISPA : IEEE International Symposium on Parallel and Distributed Processing with Applications. Milà, Itàlia, 12è : 2014  
Detailed record -
2.
10 p, 646.3 KB Thread-cooperative, bit-parallel computation of Levenshtein distance on GPU / Chacón de San Baldomero, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Marco-Sola, Santiago (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Approximate string matching is a very important problem in computational biology; it requires the fast computation of string distance as one of its essential components. Myers' bit-parallel algorithm improves the classical dynamic programming approach to Levenshtein distance computation, and offers competitive performance on CPUs. [...]
2014 - 10.1145/2597652.2597677
ICS : International Conference on Supercomputing. Munic, Alemanya, : 2014  
Detailed record -

Research literature 3 records found  
1.
9 p, 509.6 KB Filtrado eficiente de secuencias de ADN / Salym, Zaina ; Moure, Juan C, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Marco-Sola, Santiago, dir. (Universitat Pompeu Fabra) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
La secuenciación genómica es un avance científico clave que permite decodificar secuencias de ADN, detectar variaciones genéticas y diagnosticar enfermedades. En la actualidad existen una gran variedad de algoritmos que permiten encontrar mutaciones en secuencias genómicas. [...]
La seqüenciació genòmica és un avenç científic clau que permet descodificar seqüències d'ADN, detectar variacions genètiques i diagnosticar malalties. En l'actualitat hi ha una gran varietat d'algoritmes que permeten trobar mutacions en seqüències genòmiques. [...]
Genomic sequencing is a key scientific advance that allows decoding DNA sequences, detecting genetic variations, and diagnosing diseases. Nowadays, there is a great variety of algorithms that allow finding mutations in genomic sequences. [...]
2020
Enginyeria Informàtica [958]  
Detailed record - Creative Commons
2.
9 p, 405.6 KB Aceleración del algoritmo Wavefront Aligner para emparejamiento de secuencias genéticas / Hernández Chinappi, Ernesto ; Marco-Sola, Santiago, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Moure, Juan C, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
El alineamiento de secuencias se define como la búsqueda de las diferencias que existen entre dos cadenas de caracteres: patrón y texto. Este trabajo utiliza técnicas de Ingeniería de Rendimiento para caracterizar, optimizar y paralelizar el algoritmo Wavefront Aligner de alineamiento de secuencias. [...]
L'alineament de seqüències es defineix com la recerca de les diferències entre dues cadenes de caràcters: patró i text. Aquest treball utilitza tècniques d'Enginyeria de Rendiment per a caracteritzar, optimitzar i paral·lelitzar l'algoritme Wavefront Aligner d'alineament de seqüències. [...]
Sequence alignment consists in searching for differences between two strings: pattern and text. The present work employs Performance Engineering techniques to characterize, optimize, and parallelize the Wavefront Alignment algorithm. [...]
2020
Enginyeria Informàtica [958]  
Detailed record - Creative Commons
3.
9 p, 1.4 MB Aceleración de algoritmos de emparejamiento de secuencias genéticas / Gutiérrez Martín, Francisco ; Moure, Juan C, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Marco Sola, Santiago, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
El emparejamiento de secuencias genéticas se puede definir como la búsqueda de las diferencias que existen entre dos cadenas de caracteres: patrón y texto. Existe una gran variedad de algoritmos que resuelven este problema con diferentes costes computacionales. [...]
The matching of genetic sequences can be defined as the search for the differences between two-character strings: pattern and text. A great variety of algorithms can solve this problem with different computational costs. [...]
L'aparellament de seqüències genètiques es pot definir com la recerca de les diferències que hi ha entre dues cadenes de caràcters: patró i text. Hi ha una gran varietat d'algoritmes que resolen aquest problema amb diferents costos computacionals. [...]
2018-07-11
Enginyeria Informàtica [958]  
Detailed record - Creative Commons

Course materials 15 records found  1 - 10next  jump to record:
1.
4 p, 101.4 KB Computació d'Altes Prestacions i Anàlisi de Big Data [43917] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure, Juan C ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
Aquest mòdul pretén proporcionar als estudiants els coneixements i habilitats necessàries (1) per implementar aproximacions d'enginyeria de rendiment a les plataformes d'informàtica modernes i (2) per realitzar anàlisis estadístiques de Big Data.
Este módulo tiene como objetivo proporcionar a los estudiantes los conocimientos y habilidades necesarios (1) para implementar aproximaciones de ingeniería de rendimiento en plataformas informáticas modernas y (2) para realizar análisis estadísticos de Big Data.
2020-21
Máster Universitario en Bioinformática / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
2.
5 p, 109.8 KB Treball de Final de Màster [42402] / Barbadilla Prados, Antoni ; Pardo Carrasco, Leonardo ; Ruíz Panadero, Alfredo ; Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure, Juan C ; Marechal, Jean-Didier Pierre ; Cordomi Montoya, Arnau ; Coronado Zamora, Marta ; González Wong, Angel ; Yero Corona, Daniel ; Marco Sola, Santiago ; Martínez Urtaza, Jaime ; Cáceres Aguilar, Mario ; Espinosa Morales, Antonio ; Masgrau Fontanet, Laura ; González Ruíz, Juan Ramón ; Puig Font, Marta ; Casillas Viladerrams, Sònia ; Egea Sánchez, Raquel ; Daura Ribera, Xavier ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
La Tesi de Màster (MT) és un treball de recerca autònom i individual que brinda a l'estudiant l'oportunitat de centrar-se en alguns dels temes tractats en els mòduls acadèmics del màster, així com d'integrar totes les capacitats i competències assolides al llarg del màster. [...]
La Tesis de Máster (MT) es un trabajo de investigación autónomo e individual que brinda al estudiante la oportunidad de centrarse en algunos de los temas tratados en los módulos académicos del máster, así como de integrar todas las capacidades y competencias logradas a lo largo del máster. [...]
2020-21
Máster Universitario en Bioinformática / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
3.
4 p, 104.8 KB Programació en Bioinformàtica [42401] / Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
Els objectius generals d'aquest mòdul són l'aplicació de les eines i tècniques bàsiques per al desenvolupament en aquesta àrea. Es treballen les capacitats de resoldre reptes i adaptar-se a les tecnologies i paradigmes de la bioinformàtica.
Los objetivos generales de este módulo son la aplicación de las herramientas y técnicas bàsicas para el desarrollo en esta área. Se trabajan las capacidades de resolver retos y adaptarse a las tecnologías y paradigmas de la bioinformática.
2020-21
Máster Universitario en Bioinformática / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
4.
4 p, 103.0 KB Pràctiques Professionals [42400] / Egea Sánchez, Raquel ; Barbadilla Prados, Antoni ; Ruíz Panadero, Alfredo ; Senar Rosell, Miquel Àngel ; Ventura Zamora, Salvador ; Marechal, Jean-Didier Pierre ; Coronado Zamora, Marta ; Yero Corona, Daniel ; Marco Sola, Santiago ; Masgrau Fontanet, Laura ; Conchillo Solé, Oscar ; González Ruíz, Juan Ramón ; Casillas Viladerrams, Sònia ; Daura Ribera, Xavier ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
1 El principal objectiu d'aquestes pràctiques és promoure la interacció dels estudiants amb els ambients de recerca i professional que hi ha al seu voltant.
1 El principal objetivo de estas prácticas es promover la interacción de los estudiantes con los ambientes de investigación y profesional que hay a su alrededor.
2020-21
Máster Universitario en Bioinformática / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
5.
6 p, 111.4 KB Arquitectura de computadors [102775] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure, Juan C ; Villar Mesurado, Sergio ; Marco Sola, Santiago ; Sanjuán Figuerola, Gemma ; Panadero Martinez, Javier ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
1. Entendre les tècniques arquitectòniques basades en paral·lelisme per millorar el rendiment del computador. 2. Entendre el principi de localitat d'accés a dades i les solucions arquitectòniques aplicades a la jerarquia de memòria. [...]
1. Entender las técnicas arquitectónicas basadas en paralelismo para mejorar el rendimiento del computador. 2. Entender el principio de localidad de acceso a datos y las soluciones arquitectónicas aplicadas a la jerarquía de memoria. [...]
2020-21
Grau en Enginyeria Informàtica (Menció en Enginyeria de Computadors) i Grau en Enginyeria Electrònic [1206]
Grau en Enginyeria Informàtica (Menció en Tecnologies de la Informació) i Grau en Enginyeria de Sist [1207]
Màster Universitari en Enginyeria Informàtica /Computer Engineering [1269]
Enginyeria Informàtica [958]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
6.
6 p, 112.5 KB Sistemes Operatius [102747] / Espinosa Morales, Antonio ; Hernández Budé, Porfidio ; Yang, Xiaoyuan ; Carrillo Jordan, Carles ; Marco Sola, Santiago ; Ivars Camáñez, Vicente José ; Manresa Robledo, Antonio Ricardo ; Serra Vizern, Montse ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Coneixements L'estudiant aprendrà els serveis que a nivell de descripció funcional proporciona el Sistema Operatiu i també les polítiques de gestió aplicades als mòduls bàsics que el configuren. [...]
Conocimientos El estudiante aprenderá los servicios que proporciona el Sistema Operativo considerando la descripción funcional. Se verán las políticas de gestión aplicadas a los módulos básicos que configuran el sistema. [...]
2020-21
Grau en Enginyeria Informàtica (Menció en Enginyeria de Computadors) i Grau en Enginyeria Electrònic [1206]
Grau en Enginyeria Informàtica (Menció en Tecnologies de la Informació) i Grau en Enginyeria de Sist [1207]
Màster Universitari en Enginyeria Informàtica /Computer Engineering [1269]
Enginyeria Informàtica [958]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
7.
4 p, 100.5 KB Computació d'Altes Prestacions i Anàlisi de Big Data [43917] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure, Juan C ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
Aquest mòdul pretén proporcionar als estudiants els coneixements i habilitats necessàries (1) per implementar aproximacions d'enginyeria de rendiment a les plataformes d'informàtica modernes i (2) per realitzar anàlisis estadístiques de Big Data.
Este módulo tiene como objetivo proporcionar a los estudiantes los conocimientos y habilidades necesarios (1) para implementar aproximaciones de ingeniería de rendimiento en plataformas informáticas modernas y (2) para realizar análisis estadísticos de Big Data.
2019-20
Máster Universitario en Bioinformática / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
8.
4 p, 107.7 KB Treball de Final de Màster [42402] / Barbadilla Prados, Antoni ; Pardo Carrasco, Leonardo ; Ruíz Panadero, Alfredo ; Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure, Juan C ; Marechal, Jean-Didier Pierre ; Cordomi Montoya, Arnau ; González Wong, Angel ; Yero Corona, Daniel ; Marco Sola, Santiago ; Cáceres Aguilar, Mario ; Espinosa Morales, Antonio ; Masgrau Fontanet, Laura ; González Ruíz, Juan Ramón ; Casillas Viladerrams, Sònia ; Egea Sánchez, Raquel ; Daura Ribera, Xavier ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
La Tesi de Màster (MT) és un treball de recerca autònom i individual que brinda a l'estudiant l'oportunitat de centrar-se en alguns dels temes tractats en els mòduls acadèmics del màster, així com d'integrar totes les capacitats i competències assolides al llarg del màster. [...]
La Tesis de Máster (MT) es un trabajo de investigación autónomo e individual que brinda al estudiante la oportunidad de centrarse en algunos de los temas tratados en los módulos académicos del máster, así como de integrar todas las capacidades y competencias logradas a lo largo del máster. [...]
2019-20
Máster Universitario en Bioinformática / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
9.
4 p, 105.6 KB Programació en Bioinformàtica [42401] / Espinosa Morales, Antonio ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
Els objectius generals d'aquest mòdul són l'aplicació de les eines i tècniques bàsiques per al desenvolupament en aquesta àrea. Es treballen les capacitats de resoldre reptes i adaptar-se a les tecnologies i paradigmes de la bioinformàtica.
Los objetivos generales de este módulo son la aplicación de las herramientas y técnicas bàsicas para el desarrollo en esta área. Se trabajan las capacidades de resolver retos y adaptarse a las tecnologías y paradigmas de la bioinformática.
2019-20
Máster Universitario en Bioinformática / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
10.
6 p, 111.3 KB Arquitectura de computadors [102775] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure, Juan C ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
1. Entendre les tècniques arquitectòniques basades en paral·lelisme per millorar el rendiment del computador. 2. Entendre el principi de localitat d'accés a dades i les solucions arquitectòniques aplicades a la jerarquia de memòria. [...]
1. Entender las técnicas arquitectónicas basadas en paralelismo para mejorar el rendimiento del computador. 2. Entender el principio de localidad de acceso a datos y las soluciones arquitectónicas aplicadas a la jerarquía de memoria. [...]
2019-20
Enginyeria Informàtica [958]
3 documents
Detailed record - Creative Commons

Course materials : 15 records found   1 - 10next  jump to record:
Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.
UAB Digital Repository of Documents :: Search :: Submit :: Personalize :: Help
Powered by Invenio v1.1.6
Maintained by ddd.bib@uab.cat  :: Metadata license:
Working with