Home > Search Results: Marco Sola, Santiago
  Search Tips
Advanced Search
Search collections:
Sort by: Display results: Output format:
Results overview: Found 14 records in 0.02 seconds.
Articles, 2 records found
Contributions to meetings and congresses, 2 records found
Research literature, 1 records found
Course materials, 9 records found
Articles 2 records found  
1.
9 p, 1.2 MB From Wet-Lab to Variations : Concordance and Speed of Bioinformatics Pipelines for Whole Genome and Whole Exome Sequencing / Laurie, Steve (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Fernandez-Callejo, Marcos (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Marco-Sola, Santiago (Universitat Pompeu Fabra) ; Trotta, Jean-Remi (Universitat Pompeu Fabra) ; Camps, Jordi (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Chacón, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Espinosa, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Gut, Marta (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica) ; Gut, Ivo (Universitat Pompeu Fabra) ; Heath, Simon (Universitat Pompeu Fabra) ; Beltran, Sergi (Barcelona Institute of Science and Technology. Centre de Regulació Genòmica)
As whole genome sequencing becomes cheaper and faster, it will progressively substitute targeted next-generation sequencing as standard practice in research and diagnostics. However, computing cost-performance ratio is not advancing at an equivalent rate. [...]
2016 - 10.1002/humu.23114
Human Mutation, Vol. 37, Issue 12 (December 2016) , p. 1263-1271  
Detailed record - Creative Commons
2.
13 p, 995.3 KB Boosting the FM-index on the GPU : effective techniques to mitigate random memory access / Chacón de San Baldomero, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Marco-Sola, Santiago (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Espinosa Morales, Antonio Miguel (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Ribeca, Paolo (The Pirbright Institute) ; Moure López, Juan Carlos (Universitat Autònoma de Barcelona)
The recent advent of high-throughput sequencing machines producing big amounts of short reads has boosted the interest in efficient string searching techniques. As of today, many mainstream sequence alignment software tools rely on a special data structure, called the FM-index, which allows for fast exact searches in large genomic references. [...]
2015 - 10.1109/TCBB.2014.2377716
IEEE/ACM Transactions on computational biology and bioinformatics, Vol. 12, No. 5 (Sep.-Oct. 2015)  
Detailed record -

Contributions to meetings and congresses 2 records found  
1.
9 p, 645.7 KB FM-index on GPU : a cooperative scheme to reduce memory footprint / Chacón de San Baldomero, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Marco-Sola, Santiago (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
The FM-index is a data structure which is seeing more and more pervasive use, in particular in the field of highthroughput bioinformatics. Algorithms based on it show a pseudo-random memory access pattern. [...]
2014 - 10.1109/ISPA.2014.10
ISPA : IEEE International Symposium on Parallel and Distributed Processing with Applications. Milà, Itàlia, 12è : 2014  
Detailed record -
2.
10 p, 646.3 KB Thread-cooperative, bit-parallel computation of Levenshtein distance on GPU / Chacón de San Baldomero, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Marco-Sola, Santiago (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica)
Approximate string matching is a very important problem in computational biology; it requires the fast computation of string distance as one of its essential components. Myers' bit-parallel algorithm improves the classical dynamic programming approach to Levenshtein distance computation, and offers competitive performance on CPUs. [...]
2014 - 10.1145/2597652.2597677
ICS : International Conference on Supercomputing. Munic, Alemanya, : 2014  
Detailed record -

Research literature 1 records found  
1.
9 p, 1.4 MB Aceleración de algoritmos de emparejamiento de secuencias genéticas / Gutiérrez Martín, Francisco ; Moure López, Juan Carlos, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Marco Sola, Santiago, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Arquitectura de Computadors i Sistemes Operatius) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
El emparejamiento de secuencias genéticas se puede definir como la búsqueda de las diferencias que existen entre dos cadenas de caracteres: patrón y texto. Existe una gran variedad de algoritmos que resuelven este problema con diferentes costes computacionales. [...]
The matching of genetic sequences can be defined as the search for the differences between two-character strings: pattern and text. A great variety of algorithms can solve this problem with different computational costs. [...]
L'aparellament de seqüències genètiques es pot definir com la recerca de les diferències que hi ha entre dues cadenes de caràcters: patró i text. Hi ha una gran varietat d'algoritmes que resolen aquest problema amb diferents costos computacionals. [...]
2018-07-11
Enginyeria Informàtica [958]  
Detailed record - Creative Commons

Course materials 9 records found  
1.
4 p, 100.5 KB Computació d'Altes Prestacions i Anàlisi de Big Data [43917] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure Lopez, Juan Carlos ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
Aquest mòdul pretén proporcionar als estudiants els coneixements i habilitats necessàries (1) per implementar aproximacions d'enginyeria de rendiment a les plataformes d'informàtica modernes i (2) per realitzar anàlisis estadístiques de Big Data.
Este módulo tiene como objetivo proporcionar a los estudiantes los conocimientos y habilidades necesarios (1) para implementar aproximaciones de ingeniería de rendimiento en plataformas informáticas modernas y (2) para realizar análisis estadísticos de Big Data.
2019-20
Màster Universitari en Bioinformàtica / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
2.
4 p, 107.7 KB Treball de Final de Màster [42402] / Barbadilla Prados, Antoni ; Pardo Carrasco, Leonardo ; Ruíz Panadero, Alfredo ; Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure Lopez, Juan Carlos ; Marechal, Jean-Didier Pierre ; Cordomi Montoya, Arnau ; González Wong, Angel ; Yero Corona, Daniel ; Marco Sola, Santiago ; Cáceres Aguilar, Mario ; Espinosa Morales, Antonio ; Masgrau Fontanet, Laura ; González Ruíz, Juan Ramón ; Casillas Viladerrams, Sònia ; Egea Sánchez, Raquel ; Daura Ribera, Xavier ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
La Tesi de Màster (MT) és un treball de recerca autònom i individual que brinda a l'estudiant l'oportunitat de centrar-se en alguns dels temes tractats en els mòduls acadèmics del màster, així com d'integrar totes les capacitats i competències assolides al llarg del màster. [...]
La Tesis de Máster (MT) es un trabajo de investigación autónomo e individual que brinda al estudiante la oportunidad de centrarse en algunos de los temas tratados en los módulos académicos del máster, así como de integrar todas las capacidades y competencias logradas a lo largo del máster. [...]
2019-20
Màster Universitari en Bioinformàtica / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
3.
4 p, 105.6 KB Programació en Bioinformàtica [42401] / Espinosa Morales, Antonio ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
Els objectius generals d'aquest mòdul són l'aplicació de les eines i tècniques bàsiques per al desenvolupament en aquesta àrea. Es treballen les capacitats de resoldre reptes i adaptar-se a les tecnologies i paradigmes de la bioinformàtica.
Los objetivos generales de este módulo son la aplicación de las herramientas y técnicas bàsicas para el desarrollo en esta área. Se trabajan las capacidades de resolver retos y adaptarse a las tecnologías y paradigmas de la bioinformática.
2019-20
Màster Universitari en Bioinformàtica / Bioinformatics [1112]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
4.
6 p, 111.3 KB Arquitectura de computadors [102775] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure Lopez, Juan Carlos ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
1. Entendre les tècniques arquitectòniques basades en paral·lelisme per millorar el rendiment del computador. 2. Entendre el principi de localitat d'accés a dades i les solucions arquitectòniques aplicades a la jerarquia de memòria. [...]
1. Entender las técnicas arquitectónicas basadas en paralelismo para mejorar el rendimiento del computador. 2. Entender el principio de localidad de acceso a datos y las soluciones arquitectónicas aplicadas a la jerarquía de memoria. [...]
2019-20
Enginyeria Informàtica [958]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
5.
6 p, 112.1 KB Sistemes Operatius [102747] / Espinosa Morales, Antonio ; Hernández Bude, Porfidio ; Yang, Xiaoyuan ; Carrillo Jordan, Carles ; Marco Sola, Santiago ; Serra Vizern, Montse ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Coneixements L'estudiant aprendrà els serveis que a nivell de descripció funcional proporciona el Sistema Operatiu i també les polítiques de gestió aplicades als mòduls bàsics que el configuren. [...]
Conocimientos El estudiante aprenderá los servicios que proporciona el Sistema Operativo considerando la descripción funcional. Se verán las políticas de gestión aplicadas a los módulos básicos que configuran el sistema. [...]
2019-20
Enginyeria Informàtica [958]
3 documents
Detailed record - Creative Commons
6.
4 p, 79.8 KB Treball de Final de Màster [42402] / Barbadilla Prados, Antoni ; Pardo Carrasco, Leonardo ; Ruíz Panadero, Alfredo ; Senar Rosell, Miquel Àngel ; Marechal, Jean-Didier Pierre ; Cordomi Montoya, Arnau ; González Wong, Angel ; Yero Corona, Daniel ; Marco Sola, Santiago ; Cáceres Aguilar, Mario ; Espinosa Morales, Antonio ; Masgrau Fontanet, Laura ; Negre de Bofarull, Barbara ; Conchillo Solé, Oscar ; González Ruíz, Juan Ramón ; Casillas Viladerrams, Sònia ; Egea Sánchez, Raquel ; Daura Ribera, Xavier ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
1 The Master's Thesis (MT) is an autonomous and individually research work that gives the student the opportunity to focus on some of the topics dealt with in the academic modules of the Master, as well as, to integrate all together the capacities and competences achieved along the Master's degree. [...]
2018-19
Màster Universitari en Bioinformàtica / Bioinformatics [1112]  
Detailed record - Creative Commons
7.
6 p, 89.1 KB Arquitectura de computadors [102775] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure Lopez, Juan Carlos ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
1. Entendre les tècniques arquitectòniques basades en paral·lelisme per millorar el rendiment del computador. 2. Entendre el principi de localitat d'accés a dades i les solucions arquitectòniques aplicades a la jerarquia de memòria. [...]
2018-19
Enginyeria Informàtica [958]  
Detailed record - Creative Commons
8.
6 p, 88.5 KB Arquitectura de computadors [102775] / Senar Rosell, Miquel Àngel ; Moure Lopez, Juan Carlos ; Marco Sola, Santiago ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
1. Entendre les tècniques arquitectòniques basades en paral·lelisme per millorar el rendiment del computador. 2. Entendre el principi de localitat d'accés a dades i les solucions arquitectòniques aplicades a la jerarquia de memòria. [...]
2017-18
Enginyeria Informàtica [958]  
Detailed record - Creative Commons
9.
6 p, 90.6 KB Sistemes Operatius [102747] / Cortés Fité, Ana ; Sorribes Gomis, Joan ; Marco Sola, Santiago ; Espinosa Morales, Antonio Miguel ; Ivars Camáñez, Vicente José ; Serra Vizern, Montse ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
Coneixements L'estudiant aprendrà els serveis que a nivell de descripció funcional proporciona el Sistema Operatiu i també les polítiques de gestió aplicades als mòduls bàsics que el configuren. [...]
2017-18
Enginyeria Informàtica [958]  
Detailed record - Creative Commons

Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.
UAB Digital Repository of Documents :: Search :: Submit :: Personalize :: Help
Powered by Invenio v1.1.6
Maintained by ddd.bib@uab.cat  :: Metadata license:
Working with