1.
|
13 p, 4.5 MB |
iMAGING : a novel automated system for malaria diagnosis by using artificial intelligence tools and a universal low-cost robotized microscope
/
Rubio Maturana, Carles (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
de Oliveira, Allisson Dantas (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Nadal, Sergi (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Serrat, Francesc Zarzuela (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Sulleiro Igual, Elena (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Ruiz, Edurne (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Bilalli, Besim (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Veiga, Anna (Probitas Foundation) ;
Espasa, Mateu (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)) ;
Abelló, Alberto (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Segú, Marta (Futbol Club Barcelona Foundation) ;
López-Codina, Daniel (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Clols, Elisa Sayrol (Universitat Pompeu Fabra) ;
Joseph-Munné, Joan (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Malaria is one of the most prevalent infectious diseases in sub-Saharan Africa, with 247 million cases reported worldwide in 2021 according to the World Health Organization. Optical microscopy remains the gold standard technique for malaria diagnosis, however, it requires expertise, is time-consuming and difficult to reproduce. [...]
2023 - 10.3389/fmicb.2023.1240936
Frontiers in microbiology, Vol. 14 (november 2023)
|
|
2.
|
9 p, 147.0 KB |
Influenza vaccine effectiveness in reducing severe outcomes over six influenza seasons, a case-case analysis, Spain, 2010/11 to 2015/16
/
Godoy, Pere (Servei Català de la Salut) ;
Romero, Arantxa (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Soldevila, Núria (Universitat de Barcelona) ;
Torner, Nuria (Servei Català de la Salut) ;
Jané, Mireia (Servei Català de la Salut) ;
Martínez, Ana (Servei Català de la Salut) ;
Domínguez, Ángela (Universitat de Barcelona) ;
Alsedà, Miquel (Servei Català de la Salut) ;
Álvarez, Josep (Servei Català de la Salut) ;
Arias, César (Servei Català de la Salut) ;
Balañà, Pilar Jorgina (Servei Català de la Salut) ;
Barrabeig i Fabregat, Irene (Servei Català de la Salut) ;
Camps, Neus (Servei Català de la Salut) ;
Carol, Mónica (Servei Català de la Salut) ;
Ferràs, J. (Servei Català de la Salut) ;
Ferrús, Glòria (Servei Català de la Salut) ;
Follia, Núria (Servei Català de la Salut) ;
Godoy, Pere (Servei Català de la Salut) ;
Bach Foradada, Pilar (Servei Català de la Salut) ;
Jané, Mireia (Servei Català de la Salut) ;
Martínez, Ana (Servei Català de la Salut) ;
Minguell, Sofia (Servei Català de la Salut) ;
Parrón, Ignacio (Servei Català de la Salut) ;
Plasència, Elsa (Servei Català de la Salut) ;
Sala-Farré, Maria Rosa (Servei Català de la Salut) ;
Torner, Nuria (Servei Català de la Salut) ;
Torra Bastardas, Roser (Servei Català de la Salut) ;
Torres, J. (Servei Català de la Salut) ;
Caylà, Joan A (Agència de Salut Pública de Barcelona) ;
Gorrindo, Pilar (Agència de Salut Pública de Barcelona) ;
Rius i Gibert, Maria Cristina (Agència de Salut Pública de Barcelona) ;
Marcos, María Ángeles (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Mosquera, Maria del Mar (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Vilella, Anna (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Antón, Andrés (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Campins Martí, Magda (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
García, D. (Hospital Universitari de Girona Doctor Josep Trueta) ;
Espejo, Elena (Hospital Terrassa) ;
Freixas, Núria (Mútua Terrassa) ;
Riera Garcia, Montserrat (Mútua Terrassa) ;
Maraver, Encarna (Hospital Altahia Manresa) ;
Mas, Dolors (Hospital Altahia Manresa) ;
Perez, Rafael (Hospital Altahia Manresa) ;
Rebull Fatsini, Josep (Hospital de Tortosa Verge de la Cinta) ;
Pou, J. (Hospital Sant Joan de Déu (Manresa)) ;
García-Pardo, Graciano (Hospital Universitari Joan XXIII de Tarragona) ;
Olona, Montserrat (Hospital Universitari Joan XXIII de Tarragona) ;
Barcenilla, Fernando (Hospital Arnau de Vilanova (València)) ;
Castellana, Dolors (Hospital Arnau de Vilanova (València)) ;
Navarro Rubio, Gema (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)) ;
Force, Lluís (Hospital Mataró) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
When influenza vaccination is ineffective in preventing influenza virus infection, it may still reduce the severity of influenza-associated disease. Here, we estimate the effect of influenza vaccination in preventing severe outcomes e. [...]
2018 - 10.2807/1560-7917.ES.2018.23.43.1700732
Eurosurveillance, Vol. 23 Núm. 43 (25 2018) , p. 1700732
|
|
3.
|
10 p, 1.5 MB |
Assessment of two complementary influenza surveillance systems : Sentinel primary care influenza-like illness versus severe hospitalized laboratory-confirmed influenza using the moving epidemic method
/
Torner, Nuria (Universitat de Barcelona) ;
Basile, Luca (Generalitat de Catalunya) ;
Martínez, Ana (Instituto de Salud Carlos III) ;
Rius i Gibert, Maria Cristina (Agència de Salut Pública de Barcelona) ;
Godoy, Pere (Agència de Salut Pública de Catalunya) ;
Jané, Mireia (Instituto de Salud Carlos III) ;
Domínguez, Ángela (Universitat de Barcelona) ;
Aizpurua, J. ;
Alonso, J. ;
Azemar, J. ;
Aizpurua, P. ;
Ardaya, P.M. ;
Basas, M.D. ;
Batalla, J. ;
Biendicho, P. ;
Bonet, M. ;
Callado, M. ;
Campos, S. ;
Casanovas, J. M. ;
Ciurana, E. ;
Clapes, M. ;
Cots, J.M. ;
De La Rica, D. ;
Domingo, I. ;
Elizalde, G. ;
Escapa, P. ;
Fajardo, S. ;
Fau, E. ;
Fernandez, O. ;
Fernandez, M. ;
Ferrer, C. ;
Forcada, A. ;
Fos, E. ;
Gadea, G. ;
Garcia, J. ;
Garcia, R. ;
Gatius, C. ;
Gelado, M.J. ;
Grau, M. ;
Grivé, M. ;
Guzman, M.C. ;
Hernández, R. ;
Jimenez, G. ;
Juscafresa, A. ;
Llussa, A.M. ;
López, C. ;
Kristensen, L. ;
MacIà, E. ;
Mainou, A. ;
Marco, E. ;
Martínez, M. ;
Martínez, J.G. ;
Marulanda, K.V. ;
Masa, R. ;
Moncosí, X. ;
Naranjo, M.A. ;
Navarro, D. ;
Ortolà, E. ;
París, F. ;
Pérez, M.M. ;
Pozo, C. ;
Pujol, R. ;
Ribatallada, A. ;
Ruiz, G. ;
Sabaté, S. ;
Sanchez, R. ;
Sarrà, N. ;
Tarragó, E. ;
Teixidó, A.M. ;
Torres, A. ;
Valén, E. ;
Van Esso, D. ;
Van Tarjcwick, C. ;
Vink Schoenholzer, R. ;
Zabala, E. ;
Marcos, María Ángeles ;
Mosquera, Maria del Mar ;
De Molina, P. ;
Rubio, E. ;
Isanta, Ricard ;
Antón, Andrés ;
Pumarola Suñé, Tomàs ;
Vilella, Anna ;
Gorrindo, Pilar ;
Espejo, Elena ;
Andrés Santamaría, Marta ;
Barcenilla, Fernando ;
Navarro Rubio, Gema ;
Barrabeig, Irene (Agència de Salut Pública de Catalunya) ;
Pou, J. ;
Alvarez, P. ;
Plasencia, Elsa ;
Rebull Fatsini, Josep ;
Sala-Farré, Maria Rosa ;
Riera Garcia, Montserrat ;
Camps, Neus ;
Follia, Núria ;
Oller, A. ;
Bach Foradada, Pilar ;
Hernández, R. ;
Perez, Rafael ;
Torra Bastardas, Roser ;
Carol, Mónica ;
Minguell, Sofía ;
Marce, R. ;
Garcia-Pardo, Graciano ;
Olona, Montserrat ;
Alvarez, A. ;
Ramon, J.M. ;
Mòdol, Josep Maria (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Mena Pinilla, Guillermo ;
Campins Martí, Magda ;
Massuet, C. ;
Tora, G. ;
Ferràs, Joaquim (Agència de Salut Pública de Catalunya) ;
Ferrús, Glòria (Agència de Salut Pública de Catalunya) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Monitoring seasonal influenza epidemics is the corner stone to epidemiological surveillance of acute respiratory virus infections worldwide. This work aims to compare two sentinel surveillance systems within the Daily Acute Respiratory Infection Information System of Catalonia (PIDIRAC), the primary care ILI and Influenza confirmed samples from primary care (PIDIRAC-ILI and PIDIRAC-FLU) and the severe hospitalized laboratory confirmed influenza system (SHLCI), in regard to how they behave in the forecasting of epidemic onset and severity allowing for healthcare preparedness. [...]
2019 - 10.1186/s12889-019-7414-9
BMC public health, Vol. 19 Núm. 1 (13 2019) , p. 1089
|
|
4.
|
15 p, 897.4 KB |
Risk factors associated with severe outcomes in adult hospitalized patients according to influenza type and subtype
/
Martínez, Ana (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Soldevila, Núria (Universitat de Barcelona) ;
Romero-Tamarit, Arantxa (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Torner, Núria (Universitat de Barcelona) ;
Godoy, Pere (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Rius i Gibert, Maria Cristina (Agència de Salut Pública de Barcelona) ;
Jané, Mireia (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Domínguez, Ángela (Universitat de Barcelona) ;
Marcos, M.A. (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Mosquera, Maria del Mar (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Vilella, A. (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Antón, A. (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Campins Martí, Magda (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Navarro-Rubio, G. (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Seasonal influenza is a cause of hospitalization, especially in people with underlying disease or extreme age, and its severity may differ depending on the types and subtypes of circulating viruses. We investigated the factors associated with ICU admission or death in hospitalized patients with severe laboratory-confirmed influenza according to the viral type and subtype. [...]
2019 - 10.1371/journal.pone.0210353
PloS one, Vol. 14 Núm. 1 (january 2019) , p. e0210353
|
|
5.
|
11 p, 1.4 MB |
Mumps : MMR vaccination and genetic diversity of mumps virus, 2007-2011 in Catalonia, Spain
/
Barrabeig, Irene (Hospital Universitari de Bellvitge) ;
Antón, Andrés (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Torner, Nuria (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Costa, Josep (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Domínguez, À. (Universitat de Barcelona) ;
Rius i Gibert, Maria Cristina (Agència de Salut Pública de Barcelona) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Mumps is a vaccine-preventable disease but outbreaks have been reported in persons vaccinated with two doses of MMR vaccine. The objective was to describe the demographic features, vaccination effectiveness and genetic mumps virus diversity among laboratory-confirmed cases between 2007 and 2011 in Catalonia. [...]
2019 - 10.1186/s12879-019-4496-z
BMC Infectious diseases, Vol. 19 Núm. 1 (september 2019) , p. 954
|
|
6.
|
7 p, 513.1 KB |
Hospital-acquired influenza infections detected by a surveillance system over six seasons, from 2010/2011 to 2015/2016
/
Godoy, Pere ;
Torner, Núria ;
Soldevila, Núria (Universitat de Barcelona) ;
Rius i Gibert, Maria Cristina (Agència de Salut Pública de Barcelona) ;
Jané, Mireia (Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública) ;
Martínez, Ana ;
Caylà, Joan A ;
Domínguez, Ángela (Universitat de Barcelona) ;
Alsedà, Miquel ;
Álvarez, Josep ;
Arias, César ;
Balaña, Pilar Jorgina ;
Barrabeig, Irene ;
Camps, Neus ;
Carol, Mónica ;
Ferràs, Joaquim ;
Ferrús, Glòria ;
Follia, Núria ;
Bach Foradada, Pilar ;
Minguell, Sofia ;
Parrón, Ignacio ;
Plasència, Elsa ;
Sala-Farré, Maria Rosa ;
Torra i Bastardas, Roser ;
Torres, J. ;
Caylà, Joan A ;
Gorrindo, Pilar ;
Marcos, María Ángeles ;
Mosquera, Maria del Mar ;
Vilella-Figuerola, Alba (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Antón, Andrés ;
Pumarola Suñé, Tomàs ;
Campins Martí, Magda ;
Garciá, D. ;
Espejo, Elena ;
Freixas, Núria ;
Riera Garcia, Montserrat ;
Maraver, Encarna ;
Mas, Dolors ;
Perez, Rafael ;
Rebull Fatsini, Josep ;
Pou, J. ;
Garciá-Pardo, Graciano ;
Olona, Montserrat ;
Barcenilla, Fernando ;
Castellana, Dolors ;
Navarro Rubio, Gemma ;
Force, Lluís ;
Universitat Autònoma de Barcelona
In addition to outbreaks of nosocomial influenza, sporadic nosocomial influenza infections also occur but are generally not reported in the literature. This study aimed to determine the epidemiologic characteristics of cases of nosocomial influenza compared with the remaining severe cases of severe influenza in acute hospitals in Catalonia (Spain) which were identified by surveillance. [...]
2020 - 10.1186/s12879-020-4792-7
BMC Infectious diseases, Vol. 20 Núm. 1 (28 2020) , p. 80
|
|
7.
|
16 p, 1.9 MB |
Cross-sectional evaluation of circulating hepatitis B virus RNA and DNA : Different quasispecies?
/
García-García, Selene (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Tabernero, David (Instituto de Salud Carlos II) ;
Gregori i Font, Josep (Instituto de Salud Carlos II) ;
Vila, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Pacín Ruiz, Beatriz (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Quer, Josep 1963- (Instituto de Salud Carlos II) ;
Casillas, Rosario (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Castillo-Ribelles, Laura (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ferrer-Costa, Roser (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Trejo-Zahínos, Jesús (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Casis-Saez, Ernesto (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Esteban, Rafael (Instituto de Salud Carlos II) ;
Riveiro Barciela, Mar (Instituto de Salud Carlos II) ;
Buti, Maria (Instituto de Salud Carlos II) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Different forms of pregenomic and other hepatitis B virus (HBV) RNA have been detected in patients' sera. These circulating HBV-RNAs may be useful for monitoring covalently closed circular DNA activity, and predicting hepatitis B e-antigen seroconversion or viral rebound after nucleos(t)ide analog cessation. [...]
2021 - 10.3748/wjg.v27.i41.7144
World Journal of Gastroenterology, Vol. 27 (november 2021) , p. 7144-7158
|
|
8.
|
17 p, 1.8 MB |
Advances and challenges in automated malaria diagnosis using digital microscopy imaging with artificial intelligence tools : A review
/
Rubio Maturana, Carles (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
de Oliveira, Allisson Dantas (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Nadal, Sergi (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Bilalli, Besim (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Serrat, Francesc Zarzuela (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Espasa, Mateu (Parc Taulí Hospital Universitari. Institut d'Investigació i Innovació Parc Taulí (I3PT)) ;
Sulleiro Igual, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Bosch, Mercedes (Probitas Foundation) ;
Lluch, Anna Veiga (Probitas Foundation) ;
Abelló, Alberto (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
López-Codina, Daniel (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Clols, Elisa Sayrol (Universitat Politècnica de Catalunya) ;
Joseph-Munné, Joan (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Malaria is an infectious disease caused by parasites of the genus Plasmodium spp. It is transmitted to humans by the bite of an infected female Anopheles mosquito. It is the most common disease in resource-poor settings, with 241 million malaria cases reported in 2020 according to the World Health Organization. [...]
2022 - 10.3389/fmicb.2022.1006659
Frontiers in microbiology, Vol. 13 (november 2022)
|
|
9.
|
8 p, 576.9 KB |
Increasing trend of antimicrobial resistance in Shigella associated with MSM transmission in Barcelona, 2020-21 : outbreak of XRD Shigella sonnei and dissemination of ESBL-producing Shigella flexneri
/
Moreno-Mingorance, Albert (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Mir-Cros, Alba (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Goterris, Lidia (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Rodríguez Garrido, Virginia (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Sulleiro Igual, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Barberà, Maria Jesús (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Alberny, Mireia (Institut Català de la Salut) ;
Hoyos, Y. (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Descalzo, Vicente (Institut Català de la Salut) ;
Bravo, Albert (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Roca Grande, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Viñado, Belén (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Larrosa, María Nieves (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
González-López, Juanjo 1975- (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Several countries have recently reported the detection of ESBL-producing Shigella sonnei associated with transmission among MSM. In a previous study by our group, 2. 8% of Shigella spp. obtained from MSM in Barcelona between 2015 and 2019 were ESBL producers. [...]
2023 - 10.1093/jac/dkad031
Journal of antimicrobial chemotherapy, Vol. 78 (february 2023) , p. 975-982
|
|
10.
|
16 p, 1.7 MB |
Excess hospitalizations and mortality associated with seasonal influenza in Spain, 2008-2018
/
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Díez-Domingo, J. (Universitat de València) ;
Martinón-Torres, F. (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Respiratorias) ;
Redondo Margüello, E. (International Health Center Madrid Health) ;
de Lejarazu Leonardo, R. Ortiz (Hospital Clínico Universitario de Valladolid) ;
Carmo, M. (IQVIA) ;
Bizouard, G. (IQVIA) ;
Drago, G. (Sanofi) ;
López-Belmonte, J. L. (Sanofi) ;
Bricout, H. (Sanofi) ;
de Courville, C. (Sanofi) ;
Gil-de-Miguel, A. (Universidad Rey Juan Carlos) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Influenza may trigger complications, particularly in at-risk groups, potentially leading to hospitalization or death. However, due to lack of routine testing, influenza cases are infrequently coded with influenza-specific diagnosis. [...]
2023 - 10.1186/s12879-023-08015-3
BMC Infectious diseases, Vol. 23 (february 2023)
|
|