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1.
11 p, 3.1 MB GPCRtm : An amino acid substitution matrix for the transmembrane region of class A G Protein-Coupled Receptors / Rios Azuara, Santiago (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; Fernandez, Marta F. (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; Caltabiano, Gianluigi 1978- (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; Campillo Grau, María Mercedes (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; González Wong, Angel (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional)
Protein sequence alignments and database search methods use standard scoring matrices calculated from amino acid substitution frequencies in general sets of proteins. These general-purpose matrices are not optimal to align accurately sequences with marked compositional biases, such as hydrophobic transmembrane regions found in membrane proteins. [...]
2015 - 10.1186/s12859-015-0639-4
BMC Bioinformatics, Vol. 16 (July 2015) , art. 2016  

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1.
113 p, 5.4 MB Sequence and structure-based bioinformatic tools to the characterization, clustering and modeling of G-protein-coupled receptors (GPCRs) / Rios Azuara, Santiago, autor. ; Caltabiano, Gianluigi 1978- supervisor acadèmic. (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; González Wong, Ángel, supervisor acadèmic. ; Duñach i Masjuan, Mireia, supervisor acadèmic. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular.
En este trabajo, hemos desarrollado nuevas herramientas para el estudio de los receptores acoplados a proteína G (GPCRs). La importancia farmacológica de estos receptores motiva el desarrollo de métodos alternativos para ayudar su clasificación, identificación farmacológica y modelaje por comparación. [...]
In this work, we developed new bioinformatic tools for the study of G-protein-coupled receptors (GPCRs). The pharmacological importance of these receptors motivates the development of alternative methods to assist their classification, pharmacological identification and comparative modeling. [...]

[Bellaterra] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2017.  

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