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1.
26 p, 426.3 KB Empirical analysis of daily cash flow time-series and its implications for forecasting / Salas-Molina, Francisco (Universitat de València) ; Rodríguez Aguilar, Juan Antonio (Institut d'Investigació en Intel·ligència Artificial (IIIA-CSIC)) ; Serra Sagristà, Joan (Telefónica Research (Barcelona, Catalunya)) ; Guillén, Montserrat (Universitat de Barcelona. Departament d'Econometria) ; Martin, Francisco J. (BigML, Inc. (Corvallis, Estats Units d'Amèrica))
Usual assumptions on the statistical properties of daily net cash flows include normality, absence of correlation and stationarity. We provide a comprehensive study based on a real-world cash flow data set showing that: (i) the usual assumption of normality, absence of correlation and stationarity hardly appear; (ii) non-linearity is often relevant for forecasting; and (iii) typical data transformations have little impact on linearity and normality. [...]
2018 - 10.2436/20.8080.02.70
SORT : statistics and operations research transactions, Vol. 42 Núm. 1 (January-June 2018) , p. 73-98 (Articles)  
2.
4 p, 966.2 KB A hypothesis explaining why so many pathogen virulence proteins are moonlighting proteins / Franco-Serrano, Luís (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Pérez-Pons, Josep A. (Josep Antoni) (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Mozo Villarias, Ángel (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Piñol Ribas, Jaume (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Amela, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Querol Murillo, Enric (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Moonlighting or multitasking proteins refer to those proteins with two or more functions performed by a single polypeptide chain. Proteins that belong to key ancestral functions and metabolic pathways such as primary metabolism typically exhibit moonlighting phenomenon. [...]
2018 - 10.1093/femspd/fty046
Pathogens and disease, Vol. 76, issue 5 (July 2018)  
3.
4 p, 947.1 KB MultitaskProtDB-II : an update of a database of multitasking/moonlighting proteins / Franco-Serrano, Luís (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Hernández, Sergio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departamento de Bioquímia i Biologia Molecular) ; Calvo, Alejandra (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Severi, María A. (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Ferragut, Gabriela (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Pérez-Pons, Josep A. (Josep Antoni) (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Piñol Ribas, Jaume (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Pich, Òscar M. (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Mozo Villarias, Ángel (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Amela, Isaac (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Querol Murillo, Enrique (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología)
Multitasking, or moonlighting, is the capability of some proteins to execute two or more biological functions. MultitaskProtDB-II is a database of multifunctional proteins that has been updated. In the previous version, the information contained was: NCBI and UniProt accession numbers, canonical and additional biological functions, organism, monomeric/oligomeric states, PDB codes and bibliographic references. [...]
2017 - 10.1093/nar/gkx1066
Nucleic acids research, Vol. 46, Database issue D645–D648 (2018) , p. D645-D648  
4.
16 p, 3.2 MB Bioinformatics and moonlighting proteins / Hernández, Sergio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departamento de Bioquímia i Biologia Molecular) ; Franco-Serrano, Luís (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Calvo, Alejandra (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Ferragut, Gabriela (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Hermoso, Antoni (Universitat de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Amela, Isaac (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Gómez, Antonio (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ; Querol Murillo, Enrique (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología)
Multitasking or moonlighting is the capability of some proteins to execute two or more biochemical functions. Usually, moonlighting proteins are experimentally revealed by serendipity. For this reason, it would be helpful that Bioinformatics could predict this multifunctionality, especially because of the large amounts of sequences from genome projects. [...]
2015 - 10.3389/fbioe.2015.00090
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, Vol. 3 (June 2015) , art. 90  
5.
2 p, 152.1 KB MGDB : crossing the marker genes of a user microarray with a database of public-microarrays marker genes / Huerta Casado, Mario (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Munyi, Marc (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria) ; Expósito Pérez, David (Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria) ; Querol Murillo, Enrique (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología)
Summary: The microarrays performed by scientific teams grow exponentially. These microarray data could be useful for researchers around the world, but unfortunately they are underused. To fully exploit these data, it is necessary (i) to extract these data from a repository of the high-throughput gene expression data like Gene Expression Omnibus (GEO) and (ii) to make the data from different microarrays comparable with tools easy to use for scientists. [...]
2013 - 10.1093/bioinformatics/btu109
Bioinformatics, Vol. 30, issue 12 (June 2014) , p. 1780–1781, p. 1780-1781  
6.
4 p, 2.6 MB MultitaskProtDB : a database of multitasking proteins / Hernández, Sergio (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Ferragut, Gabriela (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Amela, Isaac (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Pérez-Pons, Josep A. (Josep Antoni) (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Piñol Ribas, Jaume (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Mozo Villarias, Angel (Universitat de Lleida. Departament de Medicina Experimental) ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República Regional Norte-Salto. Laboratorio de Inmunología) ; Querol Murillo, Enrique (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
We have compiled MultitaskProtDB, available online at , to provide a repository where the many multitasking proteins found in the literature can be stored. Multitasking or moonlighting is the capability of some proteins to execute two or more biological functions. [...]
2013 - 10.1093/nar/gkt1153
Nucleic acids research, Vol. 42, Database issue D517–D520 (2014)  
7.
5 p, 243.9 KB Biological activities of histidine-rich peptides; merging biotechnology and nanomedicine / Ferrer Miralles, Neus (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Corchero Nieto, José Luis (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Kumar, Pradeep (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology) ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universidad de la República (Uruguay).) ; Gupta, Kailash C (CSIR-Indian Institute of Toxicology Research) ; Villaverde Corrales, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Vázquez Gómez, Esther (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Histidine-rich peptides are commonly used in recombinant protein production as purification tags, allowing the one-step affinity separation of the His-tagged proteins from the extracellular media or cell extracts. [...]
2011 - 10.1186/1475-2859-10-101
Microbial cell factories, Vol. 10 (2011) , art. 101  
8.
11 p, 1.3 MB Gene ontology function prediction in Mollicutes using protein-protein association networks / Gómez, Antonio (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Amela, Isaac (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Planas, Antoni (Institut Químic de Sarrià) ; Piñol Ribas, Jaume (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Querol Murillo, Enrique (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Many complex systems can be represented and analysed as networks. The recent availability of large-scale datasets, has made it possible to elucidate some of the organisational principles and rules that govern their function, robustness and evolution. [...]
2011 - 10.1186/1752-0509-5-49
BMC systems biology, Vol. 5 (April 2011) , art. 49  
9.
8 p, 741.7 KB PCOPGene-Net : holistic characterisation of cellular states from microarray data based on continuous and non-continuous analysis of gene-expression relationships / Huerta Casado, Mario (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Peña, Dario (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Rodriguez, Antonio (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Querol Murillo, Enrique (Instituto de Biotecnología y Biomedicina "Vicent Villar Palasi")
Microarray technology is so expensive and powerful that it is essential to extract maximum value from microarray data, specially from large-sample-series microarrays. Our web tools attempt to respond to these researchers' needs by facilitating the possibility to test and formulate from a hypothesis to entire models under a holistic point of view. [...]
2009 - 10.1186/1471-2105-10-138
BMC Bioinformatics, Vol. 10 (2009) , art. 138  
10.
7 p, 953.8 KB NCR-PCOPGene : An Exploratory Tool for Analysis of Sample-Classes Effect on Gene-Expression Relationships / Cedano Rodríguez, Juan Antonio (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Huerta Casado, Mario (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Querol Murillo, Enrique (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
Background. Microarray technology is so expensive and powerful that it is essential to extract maximum value from microarray data. Our tools allow researchers to test and formulate from a hypothesis to entire models. [...]
2008
Advances in bioinformatics, Vol. 2008 (Desember 2008) , art. 789026  

Artículos : Encontrados 18 registros   1 - 10siguiente  ir al registro:
Documentos de investigación Encontrados 6 registros  
1.
221 p, 5.5 MB Solving the glucocorticoid paradox in cancer using expression data / Huerta Casado, Mario ; Querol Murillo, Enrique, dir. ; Cedano Rodriguez, Juan Antonio, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
Els glucocorticoides s'utilitzen comunament com a tractament adjuvant per tractar efectes secundaris i tenen una activitat antiproliferativa en diversos tumors però, d'altra banda, el seu efecte proliferatiu s'ha documentat en diversos estudis i en alguns d'ells implica la propagació del càncer. [...]
Glucocorticoids are commonly used as an adjuvant treatment for side-effects and have anti-proliferative activity in several tumours. Inspite of this fact, there has been reported a proliferative effect in several studies, that some of them involving the spread of cancer. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2016  
2.
135 p, 5.5 MB Análisis bioinformático de las proteínas multifuncinales (Moonlighting) / Hernández Ranzani, Sergio ; Querol Murillo, Enrique, dir. ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio, dir. ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
Moonlighting es la capacidad de algunas proteínas para ejecutar dos o más funciones bioquímicas. En general, las proteínas multifuncionales se identifican experimentalmente por casualidad (serendipia). [...]
Multitasking or moonlighting is the capability of some proteins to execute two or more biochemical functions. Usually, moonlighting proteins are experimentally revealed by serendipity. For this reason, it would be helpful that Bioinformatics could predict this multifunctionality, especially because of the large amounts of sequences from genome projects. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2016  
3.
174 p, 2.7 MB Bioinformatics approaches to protein interaction and complexes : application to pathogen-host epitope mimicry and to Fe-S cluster biogenesis model / Amela Abellan, Isaac ; Querol Murillo, Enrique, dir. (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio, dir. (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí"
Les interaccions antigen/anticòs són un dels tipus més interessants d'interaccions proteiques. La millor manera de prevenir les malalties causades per patògens és mitjançant l'ús de vacunes. L'aparició de la genòmica permet fer cerques a tot el genoma de nous candidats vacunals, tècnica anomenada vaccinologia inversa. [...]
Antigen/antibody interactions are one of the most interesting kinds of protein interactions. The best way to prevent diseases caused by pathogens is by the use of vaccines. The advent of genomics enables genome-wide searches of new vaccine candidates, called reverse vaccinology. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2013  
4.
107 p, 2.0 MB Análisis del ciclo de vida de sistemas de tratamiento de aguas residuales : influencia de los materiales utilizados / Vega Rodríguez, Juan Antonio ; Rodríguez Viejo, Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Física) ; Pacciani, Roberta ; Vega, Lourdes ; Universitat Autònoma de Barcelona. Escola d'Enginyeria
En este proyecto se tiene como objetivo comparar una EDAR específica con otras tres, desde el punto de vista ambiental, y establecer diferentes alternativas. En particular, se ha evaluado la mejor alternativa en la obtención de energía eléctrica para la propia utilización de la planta de tratamiento de aguas residuales, a partir del biogás generado en el digestor en la línea de lodos. [...]
2010  
5.
285 p, 2.8 MB On the design and construction of agent-mediated institutions / Rodríguez Aguilar, Juan Antonio ; Sierra García, Carles, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament d'Informàtica) ; Garcia i Calvés, Pere, dir.
El presente trabajo aborda la especificación, diseño e implementación de organizaciones abiertas de agentes. Se defiende que tales organizaciones pueden ser diseñadas e implementadas de manera efectiva como organizaciones electrónicas institucionalizadas (instituciones electrónicas) compuestas de un gran número de agentes heterogéneos (tanto humanos como software) adoptando diversos roles e interactuando por medio de ilocuciones. [...]
Ilustramos la construcción práctica de instituciones electrónicas mediadas por agentes describiendo el desarrollo de una casa electrónica de subastas inspirada en las lonjas de pescado tradicionales donde agentes heterogéneos (humanos y software) pueden comerciar. [...]
This thesis focuses on the specification, design and implementation of open agent organisations. We argue that open agent organisations can be effectively designed and implemented as institutionalised electronic organisations (electronic institutions) composed of a vast amount of heterogeneous (human and software) agents playing different roles and interacting by means of speech acts. [...]
We illustrate the practical realisation of agent-mediated electronic institutions by describing the development of an electronic auction house inspired by the age old institution of the fish market where heterogeneous (software and human) agents may trade. [...]

Bellaterra : Universitat Autònoma de Barcelona, 2003  
6.
24 p, 459.7 KB Rediseño de la eficiencia catalítica y de la termorresistencia de la [Beta](1-->3)(1-->4)glucanasa de Bacillus licheniformis / Cedano Rodríguez, Juan Antonio ; Querol Murillo, Enrique, dir. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Planas i Sauter, Antoni, dir.
Introducción Las b(lŸ3)(lŸ4) glucanasas son enzimas de gran interés biotecnólogico tanto en la industria cervezera como en la de fabricación de piensos. Los objetivos de esta tesis han sido: rediseñar la glucanasa de bacillus licheniformis con objeto de tratar de mejorar la actividad enzimática y determinar la función del lazo mayor del centro activo en dicho proceso, así como analizar y rediseñar la estabilidad térmica del enzima, en particular determinar la influencia del lazo mayor en la desnaturalización térmica, relacionándolo con el proceso y tipo de plegamiento. [...]
Introduction The (l-3)(l-4) glucanases are enzymes of great biotechnologyc interest in the brewery industry and in the manufacture of fodder. One objective of this thesis is to redesign the glucanase of bacillus licheniformis trying to improve its enzymatic activity to determine the function that the big loop, situated in the active centre, in this process. [...]

Bellaterra : Universitat Autònoma de Barcelona, 2003
4 documentos

Materiales académicos Encontrados 3 registros  
1.
3 p, 44.7 KB Bioinformàtica [25422] / Barbadilla Prados, Antonio ; Pérez-Pons, Josep A. (Josep Antoni) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Gibert, Isidre ; Ponte Marull, Inmaculada ; Cerdano Rodríguez, Juan Antonio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
2007-08
Llicenciat en Biotecnologia [529]  
2.
3 p, 47.4 KB Bioinformàtica [25422] / Barbadilla Prados, Antonio ; Pérez-Pons, Josep A. (Josep Antoni) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Gibert, Isidre ; Ponte Marull, Inmaculada ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Ciències
2003-04
Llicenciat en Biotecnologia [529]  
3.
3 p, 143.7 KB Bioinformàtica [25422] / Barbadilla Prados, Antonio ; Pérez-Pons, Josep A. (Josep Antoni) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Gibert, Isidre ; Ponte Marull, Inmaculada ; Cedano Rodríguez, Juan Antonio ; Universitat Autònoma de Barcelona. Facultat de Biociències
2006-07
Llicenciat en Biotecnologia [529]  

Documentos gráficos y multimedia Encontrados 1 registros  
1.
Technologies for simulating and Learning the past / Rodríguez, Juan Antonio (Institut d'Investigació en Intel·ligència Artificial) ; Universitat Autònoma de Barcelona. CORE en Patrimoni Cultural
2015
Gamificació i Patrimoni Cultural. Bellaterra, Cerdanyola del Vallès, : 2015  

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1 Rodriguez, J.J.
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