|
1.
|
|
14 p, 1.0 MB |
A RNA-seq analysis to describe the boar sperm transcriptome and its seasonal changes
/
Gòdia, Marta (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Estill, Molly (Wayne State University. Department of Obstetrics and Gynecology) ;
Castelló, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Balasch, Sam (Grup Gepork S.A.) ;
Rodríguez-Gil, Joan E. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina i Cirurgia Animals) ;
Krawetz, Stephen A. (Wayne State University. Department of Obstetrics and Gynecology) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Clop, Alex (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Ciència Animal i dels Aliments.
Understanding the molecular basis of cell function and ultimate phenotypes is crucial for the development of biological markers. With this aim, several RNA-seq studies have been devoted to the characterization of the transcriptome of ejaculated spermatozoa in relation to sperm quality and fertility. [...]
2019 -  10.3389/fgene.2019.00299
Frontiers in genetics, Vol. 10 (April 2019) , art. 299
|
|
|
2.
|
|
|
3.
|
|
7 p, 1.4 MB |
Expression patterns and genetic variation of the ovine skeletal muscle transcriptome of sheep from five Spanish meat breeds.
/
Noce, Antonia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Martínez Martínez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Cánovas Tienda, Ángela (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Pons Barro, Agueda (Servei de Millora Agrària i Pesquera (SEMILLA)) ;
Bermejo Asensio, Luis Alberto (Universidad de la Laguna) ;
Landi, Vincenzo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Adán Belmonte, Silvia (Federación de Razas Autóctonas de Galicia (BOAGA)) ;
Capote, Juan (Instituto Canario de Investigaciones Agrarias) ;
Vidal i Fàbrega, Oriol (Universitat de Girona. Departament de Biologia) ;
Pazzola, Michele (University of Sassari. Department of Veterinary Medicine) ;
Vacca, Giuseppe Massimo (University of Sassari. Department of Veterinary Medicine) ;
Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
The goal of the current study is to analyse the gene expression profile of the ovine skeletal muscle as well as to characterize the genetic variation of transcripts expressed in such tissue. This aim has been achieved by sequencing the longissimus dorsi transcriptomes of 50 sheep distributed in five pools representing the Canaria de Pelo, Roja Mallorquina, Gallega, Xisqueta and Ripollesa Spanish autochthonous breeds. [...]
2018 - 10.1038/s41598-018-28760-9
Scientific reports, Vol. 8 (2018) , art. 10486
|
|
|
4.
|
|
15 p, 620.2 KB |
Endometrial gene expression profile of pregnant sows with extreme phenotypes for reproductive efficiency
/
Córdoba, Sarai (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Balcells Ortega, Ingrid (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Castelló, Anna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Ovilo, Cristina (Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria) ;
Noguera Jiménez, José Luis (Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries) ;
Timoneda i Heredia, Oriol (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Universitat Autònoma de Barcelona.
Departament de Genètica Animal
2015 0) and low (L, EBV 0) prolificacy phenotypes. For each sample, mRNA and small RNA libraries were RNA-sequenced, identifying 141 genes and 10 miRNAs differentially expressed between H and L groups. We selected four miRNAs based on their role in reproduction, and five genes displaying the highest differences and a positive mapping into known reproductive QTLs for RT-qPCR validation on the whole extreme population. Significant differences were validated for genes: PTGS2 (p = 0.03; H/L ratio = 3.50), PTHLH (p = 0.03; H/L ratio = 3.69), MMP8 (p = 0.01; H/L ratio = 4.41) and SCNN1G (p = 0.04; H/L ratio = 3.42). Although selected miRNAs showed similar expression levels between H and L groups, significant correlation was found between the expression level of ssc-miR-133a (p 0.01) and sscmiR-92a (p 0.01) and validated genes. These results provide a better understanding of the genetic architecture of prolificacy-related traits and embryo implantation failure in pigs. - 10.1038/srep14416
Scientific reports, Vol. 5 (October 2015) , art. 14416
|
|
|
5.
|
|
7 p, 990.3 KB |
Rapid genome resequencing of an atoxigenic strain of Aspergillus carbonarius
/
Cabañes Sáenz, Francisco Javier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ;
Sanseverino, Walter (Sequentia Biotech SL) ;
Castellà Gómez, Gemma (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ;
Bragulat, M. Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i d'Anatomia Animals) ;
Aiese Cigliano, Riccardo (Sequentia Biotech SL) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
In microorganisms, Ion Torrent sequencing technology has been proved to be useful in whole-genome sequencing of bacterial genomes (5 Mbp). In our study, for the first time we used this technology to perform a resequencing approach in a whole fungal genome (36 Mbp), a non-ochratoxin A producing strain of Aspergillus carbonarius. [...]
2015 - 10.1038/srep09086
Scientific reports, Vol. 5 (2015) , art. 9086
|
|
|
6.
|
|
10 p, 860.4 KB |
Population structure of eleven Spanish ovine breeds and detection of selective sweeps with BayeScan and hapFLK
/
Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Cardoso, Tainã Figueiredo (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Noce, Antonia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Martínez Martínez, Amparo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Pons Barro, Agueda (Servei de Millora Agrària i Pesquera (SEMILLA)) ;
Bermejo Asensio, Luis Alberto (Universidad de la Laguna) ;
Landi, Vincenzo (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Jordana i Vidal, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Delgado Bermejo, Juan Vicente (Universidad de Córdoba. Departamento de Genética) ;
Adán Belmonte, Silvia (Federación de Razas Autóctonas de Galicia (BOAGA)) ;
Capote, Juan (Instituto Canario de Investigaciones Agrarias) ;
Vidal i Fàbrega, Oriol (Universitat de Girona. Departament de Biologia) ;
Ugarte Sagastizabal, Eva (Neiker-Tecnalia) ;
Arranz Santos, Juan José (Universidad de León. Departamento de Producción Animal) ;
Calvo Lacosta, Jorge Hugo (Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón) ;
Casellas Vidal, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments)
The goals of the current work were to analyse the population structure of 11 Spanish ovine breeds and to detect genomic regions that may have been targeted by selection. A total of 141 individuals were genotyped with the Infinium 50 K Ovine SNP BeadChip (Illumina). [...]
2016 - 10.1038/srep27296
Scientific reports, Vol. 6 (June 2016) , art. 27296
|
|
|
7.
|
|
9 p, 905.1 KB |
Romanian wild boars and Mangalitza pigs have a European ancestry and harbour genetic signatures compatible with past population bottlenecks
/
Manunza, Arianna (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Amills i Eras, Marcel (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Noce, Antonia (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Cabrera Pane, Betlem (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Zidi, Ali (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Eghbalsaied, Shahin (Islamic Azad University (Isfahan, Iran). Department of Animal Science) ;
Carrillo de Albornoz, Eva (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Portell, M. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Mercadé Carceller, Anna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Balteanu, Valentin Adrian (University of Agricultural Sciences and Veterinary Medicine)
We aimed to analyse the genetic diversity of Romanian wild boars and to compare it with that from other wild boar and pig populations from Europe and Asia. Partial sequencing of the mitochondrial encoded cytochrome b (MT-CYB) gene from 36 Romanian wild boars and 36 domestic pigs (Mangalitza, Bazna and Vietnamese breeds) showed that the diversity of Romanian wild boars and Mangalitza pigs is fairly reduced, and that most of the members of these two populations share a common MT-CYB haplotype. [...]
2016 - 10.1038/srep29913
Scientific reports, Vol. 6 (July 2016) , art. 29913
|
|
|
8.
|
|
26 p, 1.1 MB |
Magnetic bead/gold nanoparticle double-labeled primers for electrochemical detection of isothermal amplified Leishmania DNA
/
De la Escosura Muñiz, Alfredo (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ;
Baptista Pires, Luis Miguel (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ;
Serrano, Lorena (Vetgenomics) ;
Altet, Laura (Vetgenomics) ;
Francino Martí, Olga (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Ciència Animal i dels Aliments) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Merkoçi, Arben (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia)
A novel methodology for the isothermal amplification of Leishmania DNA using labeled primers combined with the advantages of magnetic purification/preconcentration and the use of gold nanoparticle (AuNP) tags for the sensitive electrochemical detection of such amplified DNA is developed. [...]
2016 - 10.1002/smll.201502350
Small, Vol. 12, issue 2 (Jan. 2016) , p. 205-213
|
|
|
9.
|
|
|
10.
|
|
7 p, 380.5 KB |
Identification of microRNAs in PCV2 subclinically infected pigs by high throughput sequencing
/
Núñez-Hernández, Fernando (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Pérez, Lester J. (Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria (La Habana, Cuba)) ;
Muñoz, Marta (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal) ;
Vera Rodríguez, Gonzalo (Centre de Recerca en AgriGenòmica) ;
Tomás, Anna (Fundació d ́Investigació Sanitària de les Illes Balears) ;
Egea Sánchez, Raquel (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Córdoba, Sarai (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Segalés Coma, Joaquim (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Sanitat i Anatomia Animals) ;
Sánchez Bonastre, Armando (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ;
Núñez, José I (Fundació Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Porcine circovirus type 2 (PCV2) is the essential etiological infectious agent of PCV2-systemic disease and has been associated with other swine diseases, all of them collectively known as porcine circovirus diseases. [...]
2015 - 10.1186/s13567-014-0141-4
Veterinary research, Vol. 46 (march 2015)
|
|
visitant ::
identificació
alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al 
canal RSS.
