1.
|
15 p, 19.7 MB |
A single-cell tumor immune atlas for precision oncology
/
Nieto, Paula (Centre de Regulació Genòmica) ;
Elosua-Bayes, Marc (Centre de Regulació Genòmica) ;
Trincado, Juan L. (Centre de Regulació Genòmica) ;
Marchese, Domenica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Massoni-Badosa, Ramon (Centre de Regulació Genòmica) ;
Salvany, Maria (Institut Recerca Biomèdica de Barcelona) ;
Henriques, Ana (Institut Recerca Biomèdica de Barcelona) ;
Nieto Sáchica, Juan Camilo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Aguilar-Fernández, Sergio (Centre de Regulació Genòmica) ;
Mereu, Elisabetta (Centre de Regulació Genòmica) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Ruiz, Sara (Centre de Regulació Genòmica) ;
Lorden, Patricia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Chin, Vanessa T. (St. Vincent Hospital Sydney) ;
Kaczorowski, Dominik (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Chan, Chia Ling (Garvan Institute of Medical Research (Darlinghurst, Austràlia)) ;
Gallagher, Richard (University of Notre Dame) ;
Chou, Angela (University of Sydney) ;
Planas-Rigol, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Gut, Ivo (Centre de Regulació Genòmica) ;
Piulats, Josep M. (Institut Català d'Oncologia) ;
Seoane Suárez, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ;
Powell, Joseph E. (University of New South Wales) ;
Batlle, Eduard (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra)
2021 - 10.1101/gr.273300.120
Genome research, Vol. 31 Núm. 10 (october 2021) , p. 1913-1926
|
|
2.
|
|
3.
|
10 p, 4.1 MB |
Immune cell profiling of the cerebrospinal fluid enables the characterization of the brain metastasis microenvironment
/
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Planas-Rigol, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Trincado, Juan L. (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Bonfill-Teixidor, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Arias, Alexandra (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Marchese, Domenica (Centre de Regulació Genòmica) ;
Moutinho, Catia (Centre de Regulació Genòmica) ;
Serna, Garazi (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Pedrosa, Leire (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Iurlaro, Raffaella (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Martinez-Ricarte, Fran (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Escudero, Laura (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Cordero Asanza, Esteban (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Cicuendez, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Ruiz, Sara (Centre de Regulació Genòmica) ;
Parra, Genís (Centre de Regulació Genòmica) ;
Nuciforo, Paolo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Gonzalez, Josep (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Pineda, Estela (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Sahuquillo Barris, Juan (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Tabernero, Josep (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Heyn, Holger (Universitat Pompeu Fabra) ;
Seoane Suárez, Joan (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Brain metastases are the most common tumor of the brain with a dismal prognosis. A fraction of patients with brain metastasis benefit from treatment with immune checkpoint inhibitors (ICI) and the degree and phenotype of the immune cell infiltration has been used to predict response to ICI. [...]
2021 - 10.1038/s41467-021-21789-x
Nature communications, Vol. 12 (march 2021)
|
|
4.
|
6 p, 916.0 KB |
Cerebrospinal fluid-derived circulating tumour DNA better represents the genomic alterations of brain tumours than plasma
/
De Mattos-Arruda, Leticia (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Mayor, Regina (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Ng, Charlotte K. Y. (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Weigelt, Britta (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Martinez-Ricarte, Fran (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Torrejon, Davis (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Oliveira, Mafalda (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Arias, Alexandra (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Raventós, Carolina (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Tang, Jiabin (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Guerini-Rocco, Elena (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Martinez-Saez, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Lois, Sergio (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Marín, Oscar (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
de la Cruz, Xavier (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Piscuoglio, Salvatore (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Towers, Russel (Department of Surgery, Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Vivancos, Ana (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Peg, Vicente (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ramón y Cajal, Santiago (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Carles, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Rodon, Jordi (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
González-Cao, María (Quirón Dexeus University Hospital) ;
Tabernero, Josep (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Felip, Enriqueta (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Sahuquillo Barris, Juan (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Berger, Michael F. (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Cortés, Javier (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Reis-Filho, Jorge S. (Memorial Sloan Kettering Cancer Center) ;
Seoane Suárez, Joan (Universitat Autònoma de Barcelona)
Cell-free circulating tumour DNA (ctDNA) in plasma has been shown to be informative of the genomic alterations present in tumours and has been used to monitor tumour progression and response to treatments. [...]
2015 - 10.1038/ncomms9839
Nature communications, Vol. 6 (november 2015)
|
|
5.
|
10 p, 982.8 KB |
Blockade of the SNARE Protein Syntaxin 1 Inhibits Glioblastoma Tumor Growth
/
Ulloa, Fausto (Centro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades Neurodegenerativas) ;
Gonzàlez-Juncà, Alba (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Meffre, Delphine (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular) ;
Barrecheguren, Pablo José (Institute for Research in Biomedicine) ;
Martínez-Mármol, Ramón (Centro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades Neurodegenerativas) ;
Pazos, Irene (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular) ;
Olivé, Núria (Universitat de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular) ;
Cotrufo, Tiziana (Centro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades Neurodegenerativas) ;
Seoane Suárez, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Soriano García, Eduardo (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Glioblastoma (GBM) is the most prevalent adult brain tumor, with virtually no cure, and with a median overall survival of 15 months from diagnosis despite of the treatment. SNARE proteins mediate membrane fusion events in cells and are essential for many cellular processes including exocytosis and neurotransmission, intracellular trafficking and cell migration. [...]
2015 - 10.1371/journal.pone.0119707
PloS one, Vol. 10 (march 2015)
|
|
6.
|
11 p, 2.2 MB |
Circulating tumour DNA from the cerebrospinal fluid allows the characterisation and monitoring of medulloblastoma
/
Escudero, Laura (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Llort, Anna (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Arias, Alexandra (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Diaz-Navarro, Ander (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Martinez-Ricarte, Fran (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Mayor, Regina (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Caratù, Ginevra (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Martinez-Saez, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Vázquez-Méndez, Élida (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Lesende-Rodríguez, Iván (Universidade da Coruña) ;
Hladun, Raquel (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Gros, Luis (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ramón y Cajal, Santiago (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Poca Pastor, María Antonia (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Puente, Xose S. (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Sahuquillo Barris, Juan (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Gallego, Soledad (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Seoane Suárez, Joan (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
The molecular characterisation of medulloblastoma, the most common paediatric brain tumour, is crucial for the correct management and treatment of this heterogenous disease. However, insufficient tissue sample, the presence of tumour heterogeneity, or disseminated disease can challenge its diagnosis and monitoring. [...]
2020 - 10.1038/s41467-020-19175-0
Nature communications, Vol. 11 (october 2020)
|
|
7.
|
9 p, 6.7 MB |
Cell free circulating tumor DNA in cerebrospinal fluid detects and monitors central nervous system involvement of B-cell lymphomas
/
Bobillo, Sabela (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Crespo, Marta (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Escudero, Laura (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Mayor, Regina (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Raheja, Priyanka (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Carpio Segura, Cecilia del Carmen (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Tazon-Vega, Barbara ;
Palacio-García, Carles (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Carabia, Júlia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Jimenez, Isabel (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Nieto Sáchica, Juan Camilo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Montoro Gómez, Julia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Martinez-Ricarte, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Castellvi, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Simo, Marc (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Puigdefabregas, Lluis (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Abrisqueta, Pau (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Bosch José, Francesc Xavier 1947- (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Seoane Suárez, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
The levels of cell free circulating tumor DNA (ctDNA) in plasma correlate with treatment response and outcome in systemic lymphomas. Notably, in brain tumors, the levels of ctDNA in the cerebrospinal fluid (CSF) are higher than in plasma. [...]
2020 - 10.3324/haematol.2019.241208
Haematologica, Vol. 106 (february 2020) , p. 513-521
|
|
8.
|
13 p, 3.3 MB |
Repolarization of tumor infiltrating macrophages and increased survival in mouse primary CNS lymphomas after XPO1 and BTK inhibition
/
Jiménez, Isabel (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Carabia, Júlia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Bobillo, Sabela (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Palacio-García, Carles (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Abrisqueta, Pau (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Pagès, Carlota (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Nieto Sáchica, Juan Camilo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Castellvi, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Martinez-Ricarte, Fran (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Escoda, Lourdes (Hospital Universitari Joan XXIII de Tarragona) ;
Perla, Cristóbal (Hospital Universitari Joan XXIII de Tarragona) ;
Céspedes Torrez, Dennis H. (Hospital Universitari Joan XXIII de Tarragona) ;
Boix, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Purroy i Zuriguel, Noèlia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ;
Puigdefàbregas, Lluís (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Seoane Suárez, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Bosch José, Francesc Xavier 1947- (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Crespo, Marta (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia)
Patients diagnosed with primary central nervous system lymphoma (PCNSL) often face dismal outcomes due to the limited availability of therapeutic options. PCNSL cells frequently have deregulated B-cell receptor (BCR) signaling, but clinical responses to its inhibition using ibrutinib have been brief. [...]
2020 - 10.1007/s11060-020-03580-y
Journal of Neuro-Oncology, Vol. 149 (july 2020) , p. 13-25
|
|
9.
|
30 p, 7.5 MB |
The Genomic and Immune Landscapes of Lethal Metastatic Breast Cancer
/
De Mattos-Arruda, Leticia (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Sammut, Stephen-John (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Ross, Edith M. (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Bashford-Rogers, Rachael (Department of Medicine. University of Cambridge) ;
Greenstein, Erez (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Markus, Havell (Mayo Clinic Center for Individualized Medicine) ;
Morganella, Sandro (Department of Medical Genetics. The Clinical School. University of Cambridge) ;
Teng, Yvonne (Cancer Molecular Diagnosis Laboratory. NIHR Cambridge Biomedical Research Centre) ;
Maruvka, Yosef (Massachusetts General Hospital (Boston)) ;
Pereira, Bernard (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Rueda, Oscar M. (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Chin, Suet-Feung (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Contente-Cuomo, Tania (Mayo Clinic Center for Individualized Medicine) ;
Mayor, Regina (Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer) ;
Arias, Alexandra (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Ali, H. Raza (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Cope, Wei (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Tiezzi, Daniel (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Dariush, Aliakbar (Institute of Astronomy. University of Cambridge) ;
Dias Amarante, Tauanne (Department of Medical Genetics. The Clinical School. University of Cambridge) ;
Reshef, Dan (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Ciriaco, Nikaoly (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Martinez-Saez, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Peg, Vicente (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Ramón y Cajal, Santiago (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Cortés, Javier (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Vassiliou, George (Wellcome Trust/MRC Cambridge Stem Cell Institute) ;
Getz, Gad (Massachusetts General Hospital (Boston)) ;
Nik-Zainal, Serena (Department of Medical Genetics. The Clinical School. University of Cambridge) ;
Murtaza, Muhammed (Mayo Clinic Center for Individualized Medicine) ;
Friedman, Nir (Weizmann Institute of Science (Israel). Department of Immunology) ;
Markowetz, Florian (Department of Oncology and Cancer Research UK Cambridge Institute. Li Ka Shing Centre. University of Cambridge) ;
Seoane Suárez, Joan (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Caldas, Carlos (Cancer Research UK Cambridge Cancer Centre (Regne Unit)) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
The detailed molecular characterization of lethal cancers is a prerequisite to understanding resistance to therapy and escape from cancer immunoediting. We performed extensive multi-platform profiling of multi-regional metastases in autopsies from 10 patients with therapy-resistant breast cancer. [...]
2019 - 10.1016/j.celrep.2019.04.098
Cell reports, Vol. 27 Núm. 9 (28 2019) , p. 2690-2708.e10
|
|
10.
|
11 p, 3.2 MB |
LIF regulates CXCL9 in tumor-associated macrophages and prevents CD8+ T cell tumor-infiltration impairing anti-PD1 therapy
/
Pascual-García, Mónica (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Bonfill-Teixidor, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Planas-Rigol, Ester (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Rubio-Perez, Carlota (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Iurlaro, Raffaella (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Arias, Alexandra (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Cuartas, Isabel (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Sala-Hojman, Ada (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Escudero, Laura (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Martinez-Ricarte, Fran (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Huber-Ruano, Isabel (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Nuciforo, Paolo (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Pedrosa, Leire (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Marques, Carlota (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Braña, Irene (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Garralda, Elena (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Vieito, María (Vall d'Hebron Institut d'Oncologia) ;
Squatrito, Juan (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ;
Pineda, Estela (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Graus Ribas, Francesc (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Espejo, Carmen (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Sahuquillo Barris, Juan (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Tabernero, Josep (Universitat Autònoma de Barcelona) ;
Seoane Suárez, Joan (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Cancer response to immunotherapy depends on the infiltration of CD8 T cells and the presence of tumor-associated macrophages within tumors. Still, little is known about the determinants of these factors. [...]
2019 - 10.1038/s41467-019-10369-9
Nature communications, Vol. 10 Núm. 1 (january 2019) , p. 2416
|
|