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1.
18 p, 2.7 MB Partial restoration of immune response in Hepatitis C patients after viral clearance by direct-acting antiviral therapy / Llorens-Revull, Meritxell (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Costafreda, Maria Isabel (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya)) ; Rico, Angie (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya)) ; Guerrero-Murillo, Mercedes (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Soria, Maria Eugenia (Universidad Autónoma de Madrid) ; Píriz-Ruzo, Sofía (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Vargas-Accarino, Elena (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gabriel-Medina, Pablo (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Rodríguez-Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Perales, Celia (Universidad Autónoma de Madrid) ; Quer, Josep (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Sauleda, Silvia (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya)) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Bes, Marta (Banc de Sang i Teixits (Barcelona, Catalunya))
HCV CD4+ and CD8+ specific T cells responses are functionally impaired during chronic hepatitis C infection. DAAs therapies eradicate HCV infection in more than 95% of treated patients. However, the impact of HCV elimination on immune responses remain controversial. [...]
2021 - 10.1371/journal.pone.0254243
PloS one, Vol. 16 (july 2021)  
2.
20 p, 4.3 MB Population Disequilibrium as Promoter of Adaptive Explorations in Hepatitis C Virus / García-Crespo, Carlos (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Gallego, Isabel (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Soria, María Eugenia (Instituto de Investigación Sanitaria de la Fundación Jiménez Díaz) ; de Ávila, Ana Isabel (Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa") ; Martínez-González, Brenda (Instituto de Investigación Sanitaria de la Fundación Jiménez Díaz) ; Vázquez-Sirvent, Lucía (Instituto de Investigación Sanitaria de la Fundación Jiménez Díaz) ; Lobo-Vega, Rebeca (Instituto de Investigación Sanitaria de la Fundación Jiménez Díaz) ; Moreno del Olmo, Elena (Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa") ; Gómez, Jordi (Instituto de Parasitología y Biomedicina "López-Neyra") ; Briones, Carlos (Centro de Astrobiología (CAB, CSIC-INTA), Torrejón de Ardoz, 28850 Madrid, Spain) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Quer, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Domingo, Esteban (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Perales, Celia (Instituto de Investigación Sanitaria de la Fundación Jiménez Díaz) ; Universitat Autònoma de Barcelona
Replication of RNA viruses is characterized by exploration of sequence space which facilitates their adaptation to changing environments. It is generally accepted that such exploration takes place mainly in response to positive selection, and that further diversification is boosted by modifications of virus population size, particularly bottleneck events. [...]
2021 - 10.3390/v13040616
Viruses, Vol. 13 (april 2021)  
3.
19 p, 2.2 MB Lethal Mutagenesis of Hepatitis C Virus Induced by Favipiravir / de Ávila, Ana Isabel (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Gallego, Isabel (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Soria, Maria Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Roche Diagnostics (Sant Cugat)) ; Quer, Josep (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Rice, Charles M. (The Rockefeller University) ; Domingo, Esteban (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Perales, Celia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Lethal mutagenesis is an antiviral approach that consists in extinguishing a virus by an excess of mutations acquired during replication in the presence of a mutagen. Here we show that favipiravir (T-705) is a potent mutagenic agent for hepatitis C virus (HCV) during its replication in human hepatoma cells. [...]
2016 - 10.1371/journal.pone.0164691
PloS one, Vol. 11 (october 2016)  
4.
17 p, 3.0 MB Rare haplotype load as marker for lethal mutagenesis / Gregori i Font, Josep (Roche Diagnostics) ; Soria, María Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gallego, Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Guerrero-Murillo, Mercedes (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Quer, Josep (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Perales Viejo, Celia (Centro de Biología Molecular "Severo Ochoa" (CSIC-UAM)) ; Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa)
RNA viruses replicate with a template-copying fidelity, which lies close to an extinction threshold. Increases of mutation rate by nucleotide analogues can drive viruses towards extinction. This transition is the basis of an antiviral strategy termed lethal mutagenesis. [...]
2018 - 10.1371/journal.pone.0204877
PloS one, Vol. 13 (october 2018)  
5.
15 p, 3.3 MB Pipeline for specific subtype amplification and drug resistance detection in hepatitis C virus / Soria, María Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Chen, Qian (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Garcia-Cehic, Damir (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Llorens, Meritxell (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; de Ávila, Ana Isabel (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Beach, Nathan M. (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Rodríguez-Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Buti, Maria (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Esteban, Rafael (Esteban Mur) (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Quer, Josep (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Perales Viejo, Celia (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa)
Despite the high sustained virological response rates achieved with current directly-acting antiviral agents (DAAs) against hepatitis C virus (HCV), around 5-10% of treated patients do not respond to current antiviral therapies, and basal resistance to DAAs is increasingly detected among treatment-naïve infected individuals. [...]
2018 - 10.1186/s12879-018-3356-6
BMC Infectious diseases, Vol. 18 (september 2018)  
6.
4 p, 131.8 KB Baseline hepatitis C virus resistance-associated substitutions present at frequencies lower than 15% may be clinically significant / Perales, Celia (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Chen, Qian (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Soria, Maria Eugenia (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ; Gregori i Font, Josep (Roche Diagnostics SL) ; Garcia-Cehic, D. (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Nieto-Aponte, Leonardo (Liver Pathology Unit, Department of Biochemistry and Microbiology, HUVH, Barcelona, Spain) ; Castells, Lluís (Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas) ; Imaz, Arkaitz (Hospital Universitari de Bellvitge) ; Llorens-Revull, Meritxell (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ; Domingo, Esteban (Centro de Biología Molecular Severo Ochoa) ; Buti, Maria (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Esteban Mur, Juan Ignacio (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina) ; Quer, Josep (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Medicina)
Controversy is ongoing about whether a minority mutant present at frequencies below 15% may be clinically relevant and should be considered to guide treatment. Resistance-associated substitution (RAS) studies were performed in patients before and at failure of antiviral treatments using Next-generation hepatitis C virus (HCV) sequencing (NGS). [...]
2018 - 10.2147/IDR.S172226
Infection and drug resistance, Vol. 11 (november 2018) , p. 2207-2210  

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1 Soria, M.
6 Soria, María Eugenia
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