|
1.
|
|
7 p, 2.3 MB |
Monitoring SARS-CoV-2 variant transitions using differences in diagnostic cycle threshold values of target genes
/
Bordoy, Antoni E. (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Saludes, Verónica (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Panisello Yagüe, David (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ;
Clarà, Gemma (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Soler, Laia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Paris de León, Alexia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Casañ, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Blanco-Suárez, Ana (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Guerrero-Murillo, Mercedes (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Rodríguez-Ponga, Beatriz (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Noguera-Julian, Marc (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Català-Moll, Francesc (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Pey, Irina (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ;
Armengol, Maria Pilar (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ;
Casadellà, Maria (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Parera, Mariona (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Pluvinet, Raquel (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol. Fundació Lluita Contra les Infeccions) ;
Clotet Sala, Bonaventura (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Giménez, Montserrat (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Martró, Elisa (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Cardona, Pere-Joan (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Blanco Guillermo, Ignacio (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Monitoring the emergence of new SARS-CoV-2 variants is important to detect potential risks of increased transmission or disease severity. We investigated the identification of SARS-CoV-2 variants from real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) routine diagnostics data. [...]
2022 -  10.1038/s41598-022-25719-9
Scientific reports, Vol. 12 (december 2022)
|
|
|
2.
|
|
12 p, 1.1 MB |
A Polygenic Risk Score Based on a Cardioembolic Stroke Multitrait Analysis Improves a Clinical Prediction Model for This Stroke Subtype
/
Cárcel-Márquez, Jara (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Muiño, Elena (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Gallego-Fabrega, Cristina (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Cullell, Natalia (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Lledós, Miquel (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Llucià-Carol, Laia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ;
Sobrino, Tomás (Hospital Clínico Universitario (Santiago de Compostela, Galícia)) ;
Campos, Francisco (Hospital Clínico Universitario (Santiago de Compostela, Galícia)) ;
Castillo, José (Hospital Clínico Universitario (Santiago de Compostela, Galícia)) ;
Freijo, Marimar (Biocruces-Bizkaia Health Research Institute. Department of Neurology) ;
Arenillas, Juan Francisco (Hospital Universitario de Valladolid) ;
Obach, Victor (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Álvarez-Sabín, José (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Molina, Carlos A. (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Ribó, Marc (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Jiménez-Conde, Jordi (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Roquer, Jaume (Hospital del Mar (Barcelona, Catalunya)) ;
Muñoz-Narbona, Lucia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
López-Cancio, Elena (Hospital Central de Asturias (HUCA)) ;
Millán, Mònica (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Diaz-Navarro, Rosa (Institut d’Investigació Sanitària Illes Balears) ;
Vives-Bauza, Cristòfol (Institut d’Investigació Sanitària Illes Balears) ;
Serrano-Heras, Gemma (Complejo Hospitalario Universitario de Albacete) ;
Segura, Tomás (Complejo Hospitalario Universitario de Albacete) ;
Ibañez, Laura (Washington University School of Medicine. Department of Psychiatry) ;
Heitsch, Laura (Washington University School of Medicine. Department of Neurology) ;
Delgado, Pilar (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Dhar, Rajat (Washington University School of Medicine. Department of Neurology.) ;
Krupinski, Jerzy (Hospital Universitari MútuaTerrassa (Terrassa, Catalunya)) ;
Delgado Mederos, Raquel (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Prats-Sánchez, Luis Antonio (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Camps-Renom, Pol (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Blay, Natalia (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol) ;
de Cid, Rafael (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Montaner, Joan (Hospital Universitario Virgen Macarena (Sevilla, Andalusia)) ;
Cruchaga, Carlos (Washington University in St. Louis. Neurogenomics and Informatics Center.) ;
Lee, Jim-Moo (Washington University School of Medicine. Department of Neurology.) ;
Martí-Fàbregas, Joan (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Fernandez-Cadenas, Israel (Institut d'Investigació Biomèdica Sant Pau) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Background: Occult atrial fibrillation (AF) is one of the major causes of embolic stroke of undetermined source (ESUS). Knowing the underlying etiology of an ESUS will reduce stroke recurrence and/or unnecessary use of anticoagulants. [...]
2022 - 10.3389/fcvm.2022.940696
Frontiers in Cardiovascular Medicine, Vol. 9 (august 2022) , p. 940696
|
|
|
3.
|
|
22 p, 2.2 MB |
Detailed stratified GWAS analysis for severe COVID-19 in four European populations
/
Degenhardt, Frauke ;
Ellinghaus, David ;
Juzenas, Simonas ;
Lerga Jaso, Jon (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina Vicent Villar Palasí) ;
Wendorff, Mareike ;
Maya-Miles, Douglas (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Uellendahl-Werth, Florian ;
ElAbd, Hesham ;
Rühlemann, Malte C ;
Arora, Jatin ;
Özer, Onur ;
Lenning, Ole Bernt ;
Myhre, Ronny ;
Vadla, May Sissel ;
Wacker, Eike M ;
Wienbrandt, Lars ;
Blandino Ortiz, Aaron ;
de Salazar, Adolfo ;
Garrido Chercoles, Adolfo ;
Palom, Adriana (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Ruiz, Agustín (Universitat Internacional de Catalunya) ;
Garcia-Fernandez, Alba-Estela (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Blanco-Grau, Albert (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Mantovani, Alberto ;
Zanella, Alberto ;
Holten, Aleksander Rygh ;
Mayer, Alena ;
Bandera, Alessandra ;
Cherubini, Alessandro ;
Protti, Alessandro ;
Aghemo, Alessio ;
Gerussi, Alessio ;
Ramirez, Alfredo ;
Braun, Alice ;
Nebel, Almut ;
Barreira-Diaz, Ana (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Lleo, Ana ;
Teles, Ana ;
Kildal, Anders Benjamin ;
Biondi, Andrea ;
Caballero, Andrea (Laboratorio de Análisis Dr. Echevarne) ;
Ganna, Andrea ;
Gori, Andrea ;
Glück, Andreas ;
Lind, Andreas ;
Tanck, Anja ;
Hinney, Anke ;
Carreras Nolla, Anna (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Fracanzani, Anna Ludovica ;
Peschuck, Anna ;
Cavallero, Annalisa ;
Dyrhol-Riise, Anne Ma ;
Ruello, Antonella ;
Julià Cano, Antonio ;
Muscatello, Antonio ;
Pesenti, Antonio ;
Voza, Antonio ;
Rando-Segura, Ariadna (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Solier, Aurora ;
Schmidt, Axel ;
Cortes, Beatriz (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Mateos, Beatriz (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Nafria-Jimenez, Beatriz ;
Schaefer, Benedikt ;
Jensen, Björn ;
Bellinghausen, Carla ;
Maj, Carlo ;
Ferrando, Carlos (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
de la Horra, Carmen (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Quereda, Carmen ;
Skurk, Carsten ;
Thibeault, Charlotte ;
Scollo, Chiara ;
Herr, Christian ;
Spinner, Christoph D ;
Gassner, Christoph ;
Lange, Christoph ;
Hu, Cinzia ;
Paccapelo, Cinzia ;
Lehmann, Clara ;
Angelini, Claudio ;
Cappadona, Claudio ;
Azuure, Clinton ;
Bianco, Cristiana ;
Cea, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Sancho, Cristina ;
Hoff, Dag Arne Lihaug ;
Galimberti, Daniela ;
Prati, Daniele ;
Haschka, David ;
Jiménez Jiménez, David ;
Pestaña, David ;
Toapanta, David (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Muñiz-Diaz, Eduardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament deInmunohematología, Banc de Sang i Teixits) ;
Azzolini, Elena ;
Sandoval, Elena (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Binatti, Eleonora ;
Scarpini, Elio ;
Helbig, Elisa T ;
Casalone, Elisabetta ;
Urrechaga, Eloisa ;
Paraboschi, Elvezia Maria ;
Pontali, Emanuele ;
Reverter, Enric (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Calderón, Enrique J (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Navas, Enrique ;
Solligård, Erik ;
Contro, Ernesto ;
Arana-Arri, Eunate ;
Aziz, Fátima (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Garcia, Federico ;
García Sánchez, Félix ;
Ceriotti, Ferruccio ;
Martinelli-Boneschi, Filippo ;
Peyvandi, Flora ;
Kurth, Florian ;
Blasi, Francesco ;
Malvestiti, Francesco ;
Medrano, Francisco J ;
Mesonero, Francisco (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Rodríguez Frías, Francisco (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Hanses, Frank ;
Müller, Fredrik ;
Hemmrich-Stanisak, Georg ;
Bellani, Giacomo ;
Grasselli, Giacomo ;
Pezzoli, Gianni ;
Costantino, Giorgio ;
Albano, Giovanni ;
Cardamone, Giulia ;
Bellelli, Giuseppe ;
Citerio, Giuseppe ;
Foti, Giuseppe ;
Lamorte, Giuseppe ;
Matullo, Giuseppe ;
Baselli, Guido ;
Kurihara, Hayato ;
Neb, Holger ;
My, Ilaria ;
Kurth, Ingo ;
Hernández, Isabel (Universitat Internacional de Catalunya) ;
Pink, Isabell ;
De Rojas, Itziar (Universitat Internacional de Catalunya) ;
Galván-Femenía, Iván (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Holter, Jan Cato ;
Afset, Jan Egil ;
Heyckendorf, Jan ;
Kässens, Jan ;
Damås, Jan Kristian ;
Rybniker, Jan ;
Altmüller, Janine ;
Ampuero, Javier (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Martín, Javier ;
Erdmann, Jeanette ;
Banales, Jesus M. (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Badia, Joan Ramon (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Dopazo, Joaquín ;
Schneider, Jochen ;
Bergan, Jonas ;
Barretina, Jordi (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Walter, Jörn ;
Hernández Quero, Jose ;
Goikoetxea, Josune ;
Delgado, Juan (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Guerrero, Juan M. (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Fazaal, Julia ;
Kraft, Julia ;
Schröder, Julia ;
Risnes, Kari ;
Banasik, Karina ;
Müller, Karl Erik ;
Gaede, Karoline I ;
Garcia-Etxebarria, Koldo (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Tonby, Kristian ;
Heggelund, Lars ;
Izquierdo-Sanchez, Laura (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Bettini, Laura Rachele ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Sander, Leif Erik ;
Lippert, Lena J ;
Terranova, Leonardo ;
Nkambule, Lindokuhle ;
Knopp, Lisa ;
Gustad, Lise Tuset ;
Garbarino, Lucia ;
Santoro, Luigi ;
Téllez, Luis (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Roade, Luisa (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Ostadreza, Mahnoosh ;
Intxausti, Maider ;
Kogevinas, M. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Riveiro Barciela, Mar (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Berger, Marc M. ;
Schaefer, Marco ;
Niemi, Mari E K ;
Gutiérrez-Stampa, María A ;
Carrabba, Maria ;
Figuera Basso, Maria E ;
Valsecchi, Maria Grazia ;
Hernandez-Tejero, María (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Vehreschild, Maria J G T ;
Manunta, Maria ;
Acosta-Herrera, Marialbert ;
D'Angiò, Mariella ;
Baldini, Marina ;
Cazzaniga, Marina ;
Grimsrud, Marit M ;
Cornberg, Markus ;
Nöthen, Markus M ;
Marquié, Marta (Universitat Internacional de Catalunya) ;
Castoldi, Massimo ;
Cordioli, Mattia ;
Cecconi, Maurizio ;
D'Amato, Mauro ;
Augustin, Max ;
Tomasi, Melissa ;
Boada, Mercè (Universitat Internacional de Catalunya) ;
Dreher, Michael ;
Seilmaier, Michael J ;
Joannidis, Michael ;
Wittig, Michael ;
Mazzocco, Michela ;
Ciccarelli, Michele ;
Rodríguez-Gandía, Miguel (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Bocciolone, Monica ;
Miozzo, Monica ;
Imaz Ayo, Natale ;
Blay, Natalia (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Chueca, Natalia ;
Montano, Nicola ;
Braun, Nicole ;
Ludwig, Nicole ;
Marx, Nikolaus ;
Martínez, Nilda ;
Cornely, Oliver A ;
Witzke, Oliver ;
Palmieri, Orazio ;
Faverio, Paola ;
Preatoni, Paoletta ;
Bonfanti, Paolo ;
Omodei, Paolo ;
Tentorio, Paolo ;
Castro, Pedro (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Rodrigues, Pedro M. (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
España, Pedro Pablo ;
Hoffmann, Per ;
Rosenstiel, Philip ;
Schommers, Philipp ;
Suwalski, Phillip ;
de Pablo, Raúl ;
Ferrer, Ricard (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Bals, Robert ;
Gualtierotti, Roberta ;
Gallego-Durán, Rocío (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Nieto, Rosa ;
Carpani, Rossana ;
Morilla, Rubén (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Badalamenti, Salvatore ;
Haider, Sammra ;
Ciesek, Sandra ;
May, Sandra ;
Bombace, Sara ;
Marsal, Sara (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Pigazzini, Sara ;
Klein, Sebastian ;
Pelusi, Serena ;
Wilfling, Sibylle ;
Bosari, Silvano ;
Volland, Sonja ;
Brunak, Søren ;
Raychaudhuri, Soumya ;
Schreiber, Stefan ;
Heilmann-Heimbach, Stefanie ;
Aliberti, Stefano ;
Ripke, Stephan ;
Dudman, Susanne ;
Wesse, Tanja ;
Zheng, Tenghao ;
Bahmer, Thomas ;
Eggermann, Thomas ;
Illig, Thomas ;
Brenner, Thorsten ;
Pumarola Suñé, Tomàs (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Feldt, Torsten ;
Folseraas, Trine ;
Gonzalez Cejudo, Trinidad ;
Landmesser, Ulf ;
Protzer, Ulrike ;
Hehr, Ute ;
Rimoldi, Valeria ;
Monzani, Valter ;
Skogen, Vegard ;
Keitel, Verena ;
Kopfnagel, Verena ;
Friaza, Vicente (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Andrade, Victor ;
Moreno Aguado, Víctor (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Morros, Rosa ;
Albrecht, Wolfgang ;
Peter, Wolfgang ;
Poller, Wolfgang ;
Farré, Xavier (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Yi, Xiaoli ;
Wang, Xiaomin ;
Khodamoradi, Yascha ;
Karadeniz, Zehra ;
Latiano, Anna ;
Goerg, Siegfried ;
Bacher, Petra ;
Koehler, Philipp ;
Tran, Florian ;
Zoller, Heinz ;
Schulte, Eva C ;
Heidecker, Bettina ;
Ludwig, Kerstin U ;
Fernández, Javier (Hospital Clínic i Provincial de Barcelona) ;
Romero-Gómez, Manuel (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Albillos, Agustín ;
Invernizzi, Pietro ;
Buti, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Duga, Stefano ;
Bujanda, Luis (Centro de Investigación Biomédica en Red, Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd)) ;
Hov, Johannes R. ;
Lenz, Tobias L ;
Asselta, Rosanna ;
de Cid, Rafael (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Valenti, Luca ;
Karlsen, Tom H. ;
Cáceres Aguilar, Mario (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina Vicent Villar Palasí) ;
Franke, Andre
Given the highly variable clinical phenotype of Coronavirus disease 2019 (COVID-19), a deeper analysis of the host genetic contribution to severe COVID-19 is important to improve our understanding of underlying disease mechanisms. [...]
2022 - 10.1093/hmg/ddac158
Human Molecular Genetics, Vol. 31 (july 2022) , p. 3945-3966
|
|
|
4.
|
|
8 p, 1.6 MB |
Rapid and accurate quantification of isomiRs by RT-qPCR
/
Franco Cirera, Sandra (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Pluvinet, Raquel (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Sanchez-Herrero, Jose Francisco (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Martinez, Miguel Angel (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa)
Currently, microRNAs (miRs) are annotated as a single defined sequence (canonical), even though high-throughput small RNA sequencing has identified miR isoforms (isomiRs) that differ from their canonical counterparts in length, sequence, or both. [...]
2022 - 10.1038/s41598-022-22298-7
Scientific reports, Vol. 12 (october 2022)
|
|
|
5.
|
|
16 p, 3.9 MB |
GCAT|Panel, a comprehensive structural variant haplotype map of the Iberian population from high-coverage whole-genome sequencing
/
Valls-Margarit, Jordi (Barcelona Supercomputing Center) ;
Galván-Femenía, Iván (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Matías-Sánchez, Daniel (Barcelona Supercomputing Center) ;
Blay, Natalia (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Puiggròs, Montserrat (Barcelona Supercomputing Center) ;
Carreras, Anna (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Salvoro, Cecilia (Barcelona Supercomputing Center) ;
Cortés, Beatriz (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Amela, Ramon (Barcelona Supercomputing Center) ;
Farre, Xavier (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Lerga Jaso, Jon (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Puig Font, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
Sánchez-Herrero, Jose Francisco (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Moreno Aguado, Víctor (Universitat de Barcelona) ;
Perucho, Manuel (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Armengol, Lluís (Quantitative Genomic Medicine Laboratories) ;
Delaneau, Olivier (University of Lausanne. Department of Computational Biology) ;
Cáceres Aguilar, Mario (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ;
de Cid, Rafael (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Torrents, David (Barcelona Supercomputing Center)
The combined analysis of haplotype panels with phenotype clinical cohorts is a common approach to explore the genetic architecture of human diseases. However, genetic studies are mainly based on single nucleotide variants (SNVs) and small insertions and deletions (indels). [...]
2022 - 10.1093/nar/gkac076
Nucleic acids research, Vol. 50, Issue 5 (March 2022) , p. 2464-2479
|
|
|
6.
|
|
23 p, 3.2 MB |
Genotypic and Phenotypic Characterization of Staphylococcus aureus Isolates from the Respiratory Tract in Mechanically-Ventilated Patients
/
Lacoma, Alicia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Laabei, Maisem (Department of Biology and Biochemistry, University of Bath, Bath BA2 7AY, UK) ;
Sánchez-Herrero, Jose Francisco (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Young, Bernadette (John Radcliffe Hospital (Oxford, Regne Unit)) ;
Godoy-Tena, Gerard (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Gomes Fernandes, Meissiner (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Plans, Oriol (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Arméstar, Fernando (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Prat i Aymerich, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Staphylococcus aureus is a commensal and frequent colonizer of the upper respiratory tract. When mechanical ventilation disrupts natural defenses, S. aureus is frequently isolated from the lower airways, but distinguishing between colonization and infection is difficult. [...]
2021 - 10.3390/toxins13020122
Toxins, Vol. 13 (february 2021)
|
|
|
7.
|
|
15 p, 1.7 MB |
Epigenetic footprint enables molecular risk stratification of hepatoblastoma with clinical implications
/
Carrillo-Reixach, Juan (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Torrens, L. (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Simón-Coma, Marina (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Royo, Laura (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Domingo-Sàbat, Montse (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Abril-Fornaguera, Jordi (Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer) ;
Akers, N. (Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Nova York, Estats Units d'Amèrica)) ;
Sala Llinas, Margarita (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Ragull, Sonia (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Arnal, Magdalena (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Villalmanzo, Núria (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Cairo, Stefano (Instituto di Ricerca Pediatrica. Corso Stati Uniti 4) ;
Villanueva, Alberto (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Kappler, R. (Department of Pediatric Surgery. Dr. von Hauner Children's Hospital. Ludwig-Maximilians-University Munich) ;
Garrido-Pontnou, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Guerra, Laura (Hospital Universitario La Paz (Madrid)) ;
Sábado, Constantino (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Guillén, Gabriela (Hospital Universitari Vall d'Hebron) ;
Mallo, Maria del Mar (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras) ;
Piñeyro, David (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Vázquez-Vitali, María (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Kuchuk, O. (Mount Sinai Liver Cancer Program. Divisions of Liver Diseases. Tisch Cancer Institute. Icahn School of Medicine at Mount Sinai) ;
Mateos, María Elena (Hospital Universitario Reina Sofía (Còrdova, Espanya)) ;
Ramírez, G. (Hospital Universitario Virgen del Rocío (Sevilla, Andalusia)) ;
Santamaría, María (Hospital Universitario La Paz (Madrid)) ;
Mozo, Y. (Hospital Universitario La Paz (Madrid)) ;
Soriano, Aroa (Hospital Universitari Val d'Hebron. Institut de Recerca) ;
Grotzer, M. (Department of Pediatric Oncology. University Children's Hospital Zurich. University of Zurich) ;
Branchereau, S. (Bicêtre Hospital) ;
de Andoin, N. G. (Hospital Universitario de Donostia (Sant Sebastià, País Basc)) ;
López-Ibor, B. (Department of Pediatric Hematology and Oncology. HM Montepríncipe Hospital) ;
López-Almaraz, R. (Hospital Universitario de Cruces (Barakaldo, País Basc)) ;
Salinas, J. A. (Hospital Universitari Son Espases (Palma de Mallorca, Balears)) ;
Torres, B. (Hospital Universitari i Politècnic La Fe de València) ;
Hernández, F. (Hospital Universitario La Paz (Madrid)) ;
Uriz, J. J. (Hospital Universitario de Donostia (Sant Sebastià, País Basc)) ;
Fabre, M. (Department of Pathology. Hôpital Universitaire Necker-Enfants Malades. Assistance Publique-Hôpitaux de Paris. Université Paris Descartes) ;
Blanco, J. (Joan) (Joan) (Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya) ;
Paris, C. (Stem Cell Transplant Unit. Hospital Luis Calvo Mackenna) ;
Bajčiová, V. (Department of Pediatric Oncology. Childrens University Hospital Brno) ;
Laureys, G. (Ghent University Hospital. (Bèlgica)) ;
Masnou, Helena (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Clos, Ariadna (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Beléndez, Cristina (Hospital General Universitario Gregorio Marañón) ;
Guettier, C. (Bicêtre Hospital) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Planas, Ramón (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Jordà, Mireia (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Nonell, Lara (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ;
Czauderna, P. (Department of Surgery and Urology for Children and Adolescents. Medical University of Gdansk) ;
Morland, B. (Birmingham Women's Hospital) ;
Sia, D. (Mount Sinai Liver Cancer Program. Divisions of Liver Diseases. Tisch Cancer Institute. Icahn School of Medicine at Mount Sinai) ;
Losic, B. (Icahn Institute for Data Science and Genomic Technology (Nova York, Estats Units d'Amèrica)) ;
Buendia, M. A. (INSERM. UMR 1193. Paul-Brousse Hospital. Hepatobiliary Centre) ;
Sarrias, Maria-Rosa (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Llovet, J. M. (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats) ;
Armengol, Carolina (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Universitat Autònoma de Barcelona
Background & Aims: Hepatoblastoma (HB) is a rare disease. Nevertheless, it is the predominant pediatric liver cancer, with limited therapeutic options for patients with aggressive tumors. Herein, we aimed to uncover the mechanisms of HB pathobiology and to identify new biomarkers and therapeutic targets in a move towards precision medicine for patients with advanced HB. [...]
2020 - 10.1016/j.jhep.2020.03.025
Journal of Hepatology, Vol. 73 Núm. 2 (august 2020) , p. 328-341
|
|
|
8.
|
|
12 p, 2.3 MB |
A comprehensive custom panel design for routine hereditary cancer testing: preserving control, improving diagnostics and revealing a complex variation landscape
/
Castellanos, Elisabeth (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Gel, Bernat (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Rosas, Inma (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Tornero, Eva (Institut Català d'Oncologia) ;
Santín, Sheila (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Pluvinet, Raquel (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Velasco, Juan (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Del Valle, Jesús (Institut Català d'Oncologia) ;
Perucho, Manuel (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Blanco Guillermo, Ignacio (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Navarro, Matilde (Institut Català d'Oncologia) ;
Brunet, Joan (Institut Català d'Oncologia) ;
Pineda, Marta (Institut Català d'Oncologia) ;
Feliubadaló, Lidia (Institut Català d'Oncologia) ;
Capellá, G. (Gabriel) (Institut Català d'Oncologia) ;
Lázaro, Conxi (Institut Català d'Oncologia) ;
Serra, Eduard (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer)
We wanted to implement an NGS strategy to globally analyze hereditary cancer with diagnostic quality while retaining the same degree of understanding and control we had in pre-NGS strategies. To do this, we developed the I2HCP panel, a custom bait library covering 122 hereditary cancer genes. [...]
2017 - 10.1038/srep39348
Scientific reports, 2017, p. 1-12
|
|
|
9.
|
|
17 p, 2.9 MB |
Curcumin mediates oxaliplatin-acquired resistance reversion in colorectal cancer cell lines through modulation of CXC-Chemokine/NF-κB signalling pathway
/
Ruiz de Porras, Vicenç (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Bystrup, Sara (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Martínez Cardús, Anna (Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge) ;
Pluvinet, Raquel (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Howells, Lynne (University of Leicester. Departament of Cancer Studies) ;
James, Mark I. (University of Leicester. Departament of Cancer Studies) ;
Iwuji, Chinenye (University of Leicester. Departament of Cancer Studies) ;
Manzano, José Luis (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Layos, Laura (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Bugés, Cristina (Institut Germans Trias i Pujol) ;
Abad, Albert (Hospital Cima Sanitas (Barcelona)) ;
Martínez Balibrea, Eva (Institut Germans Trias i Pujol)
Resistance to oxaliplatin (OXA) is a complex process affecting the outcomes of metastatic colorectal cancer (CRC) patients treated with this drug. De-regulation of the NF-κB signalling pathway has been proposed as an important mechanism involved in this phenomenon. [...]
2016 - 10.1038/srep24675
Scientific reports, Vol. 6 (April 2016)
|
|
|
10.
|
|
22 p, 7.0 MB |
Expression of CD11c Is Associated with Unconventional Activated T Cell Subsets with High Migratory Potential
/
Qualai, Jamal (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Li, Lin-Xi (University of Arkansas for Medical Sciences) ;
Cantero, Jon (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa) ;
Tarrats, Antoni (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Fernández Sanmartin, Marco Antonio (Institut Germans Trias i Pujol. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol) ;
Sumoy, Lauro (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Medicina Predictiva i Personalitzada del Càncer) ;
Rodolosse, Annie (Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona)) ;
McSorley, Stephen J. (University of California) ;
Genescà Ferrer, Meritxell (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa)
CD11c is an α integrin classically employed to define myeloid dendritic cells. Although there is little information about CD11c expression on human T cells, mouse models have shown an association of CD11c expression with functionally relevant T cell subsets. [...]
2016 - 10.1371/journal.pone.0154253
PloS one, Vol. 11 Núm. 4 (April 2016)
|
|
guest ::
email alert
or subscribe to the 
RSS feed.
