Results overview: Found 11 records in 0.04 seconds.
Articles, 10 records found
Research literature, 1 records found
Articles 10 records found  
1.
17 p, 3.4 MB Protein environment : A crucial triggering factor in josephin domain aggregation: The role of 2,2,2-trifluoroethanol / Visentin, Cristina (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Navarro, Susanna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Grasso, Gianvito (Università della Svizzera italiana. Istituto Dalle Molle di Studi sull'Intelligenza Artificiale (IDSIA)) ; Regonesi, Maria Elena (Università di Milano-Bicocca. Dipartimento di Biotecnologie e Bioscienze) ; Deriu, Marco Agostino (Università della Svizzera italiana. Istituto Dalle Molle di Studi sull'Intelligenza Artificiale (IDSIA)) ; Tortora, Paolo (Università di Milano-Bicocca. Dipartimento di Biotecnologie e Bioscienze) ; Ventura i Zamora, Salvador (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular)
The protein ataxin-3 contains a polyglutamine stretch that triggers amyloid aggregation when it is expanded beyond a critical threshold. This results in the onset of the spinocerebellar ataxia type 3. [...]
2018 - 10.3390/ijms19082151
International Journal of Molecular Sciences, Vol. 19, Núm. 8 (August 2018) , art. 2151  
2.
14 p, 319.0 KB Tècniques bioinformàtiques aplicades a la modelització i simulació de l'estructura i l'activitat de receptors acoblats a proteïnes G / Deupí i Corral, Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; Olivella, Mireia (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional) ; Pardo Carrasco, Leonardo (Universitat Autònoma de Barcelona. Laboratori de Medicina Computacional)
El receptor de la tirotropina (TSHr) i el receptor de quimiocines CCR5 pertanyen a la família dels receptors acoblats a proteïnes G. Hi ha diverses malalties associades al seu funcionament anòmal, des del desenvolupament de tumors a la tiroide fins a la sida. [...]
2002
Treballs de la Societat Catalana de Biologia, Vol. 53 (2002) , p. 77-90  
3.
12 p, 6.4 MB Computer simulations of lipid nanoparticles / Fernandez-Luengo Flores, Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Física) ; Camacho Castro, Juan (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Física) ; Faraudo Gener, Jordi (Institut de Ciència de Materials de Barcelona)
Lipid nanoparticles (LNP) are promising soft matter nanomaterials for drug delivery applications. In spite of their interest, little is known about the supramolecular organization of the components of these self-assembled nanoparticles. [...]
2017 - 10.3390/nano7120461
Nanomaterials, Vol. 7, Núm. 12 (December 2017) , art. 461  
4.
20 p, 2.7 MB Thermal and transport properties of pristine single-layer hexagonal boron nitride : a first principles investigation / Illera Sergio (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Pruneda, Miguel (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Colombo, Luciano (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Ordejón Rontomé, Pablo (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia)
Molecular dynamics is used in combination with density functional theory to determine the thermal transport properties of the single-layer hexagonal boron nitride (SL h-BN) from ab initio calculations. [...]
2017 - 10.1103/PhysRevMaterials.1.044006
Physical review materials, Vol. 1, issue 4 (Sep. 2017) , art. 44006  
5.
8 p, 1.6 MB Mechanisms behind the enhancement of thermal properties of graphene nanofluids / Rodríguez-Laguna, María del Rocío (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Castro Álvarez, Alejandro (Universitat de Barcelona) ; Sledzinska, Marianna (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Maire, Jeremie (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Costanzo, Francesca (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Ensing, Bernd (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Pruneda, Miguel (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Ordejón Rontomé, Pablo (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Sotomayor Torres, Clivia M. (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Gómez-Romero, Pedro (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Chávez Ángel, Emigdio (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia) ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Química
While the dispersion of nanomaterials is known to be effective in enhancing the thermal conductivity and specific heat capacity of fluids, the mechanisms behind this enhancement remain to be elucidated. [...]
2018 - 10.1039/c8nr02762e
Nanoscale, Vol. 10, Núm. 32 (August 2018) , p. 15402-15409  
6.
10 p, 1.2 MB A single cysteine post-translational oxidation suffices to compromise globular proteins kinetic stability and promote amyloid formation / Marinelli, Patrizia (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Navarro, Susanna (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular) ; Graña Montes, Ricardo (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Bañó-Polo, Manuel (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Fernández Gallegos, Ma. Rosario (María Rosario) (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; Papaleo, Elena (Kræftens Bekæmpelse) ; Ventura i Zamora, Salvador (Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Oxidatively modified forms of proteins accumulate during aging. Oxidized protein conformers might act as intermediates in the formation of amyloids in age-related disorders. However, it is not known whether this amyloidogenic conversion requires an extensive protein oxidative damage or it can be promoted just by a discrete, localized post-translational modification of certain residues. [...]
2017 - 10.1016/j.redox.2017.10.022
Redox Biology, Vol. 14 (April 2018) , p. 566-575  
7.
14 p, 23.8 MB Shining Light On An mGlu5 Photoswitchable NAM : A Theoretical Perspective / Dalton, James A.R. (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Neurociències) ; Lans, Isaias (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Neurociències) ; Rovira Algans, Xavier (Institut de Génomique Fonctionnelle) ; Malhaire, Fanny (Institut de Génomique Fonctionnelle) ; Gómez-Santacana, Xavier (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Neurociències) ; Pittolo, Silvia (Institute for Bioengineering of Catalonia (IBEC)) ; Gorostiza, Pau (Institute for Bioengineering of Catalonia (IBEC)) ; Llebaria, Amadeu (Institut de Química Avançada de Catalunya) ; Goudet, Cyril (Institut de Génomique Fonctionnelle) ; Pin, Jean-Philippe (Institut de Génomique Fonctionnelle) ; Giraldo, Jesús (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Neurociències)
Metabotropic glutamate receptors (mGluRs) are important drug targets because of their involvement in several neurological diseases. Among mGluRs, mGlu5 is a particularly high-profile target because its positive or negative allosteric modulation can potentially treat schizophrenia or anxiety and chronic pain, respectively. [...]
2016 - 10.2174/1570159X13666150407231417
Curr Neuropharmacol, Vol. 14, Num. 5 (2016) , p. 441-454  
8.
48 p, 8.9 MB The first crystal structure of human RNase6 reveals a novel substrate binding and cleavage site arrangement. / Prats-Ejarque, G. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Arranz-Trullén, J. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Blanco, JA. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Pulido, D. (Imperial College London) ; Nogués, MV. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Moussaoui, M. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular) ; Boix, E. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Human RNase 6 is a cationic secreted protein that belongs to the RNase A superfamily. Its expression is induced in neutrophils and monocytes upon bacterial infection, suggesting a role in host defence. [...]
2016 - 10.1042/BCJ20160245
The Biochemical journal, 2016  
9.
8 p, 2.7 MB The influence of pore size on the indentation behavior of metallic nanoporous materials : a molecular dynamics study / Esqué-de los Ojos, D. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Física) ; Pellicer Vilà, Eva M. (Eva Maria) (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Física) ; Sort Viñas, Jordi (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Física)
In general, the influence of pore size is not considered when determining the Young's modulus of nanoporous materials. Here, we demonstrate that the pore size needs to be taken into account to properly assess the mechanical properties of these materials. [...]
2016 - 10.3390/ma9050355
Materials, Vol. 9 Issue 5 (May 2016) , p. 1-8  
10.
4 p, 327.5 KB Theoretical evidence for the kick-out mechanism for B diffusion in SiC / Rurali, Riccardo (Centro Nacional de Microelectrónica) ; Godignon, Philippe (Centro Nacional de Microelectrónica) ; Rebollo Palacios, José Andrés (Centro Nacional de Microelectrónica) ; Ordejón Rontomé, Pablo (Institut de Ciència de Materials de Barcelona) ; Hernández, E. (Institut de Ciència de Materials de Barcelona) ; American Physical Society
In this letter, we analyze by means of first-principles electronic structure calculations the diffusion of B impurities in 3C-SiC. We find, through molecular dynamics, that substitutional B at a Si lattice site is readily displaced by a nearby Si interstitial by the process known as a kick-out mechanism, in agreement with recent experimental results. [...]
2002 - 10.1063/1.1515369
Applied Physics Letters, Vol. 81, Issue 16 (October 2002) , p. 2989-2991  

Research literature 1 records found  
1.
292 p, 5.5 MB Application of Molecular Dynamics methods to the study of biological systems / Perez Benito, Laura, autor ; Pardo Carrasco, Leonardo, supervisor acadèmic ; Cordomí Montoya, Arnau, supervisor acadèmic ; Tresadern, Gary, supervisor acadèmic ; Duñach, Mireia, supervisor acadèmic ; Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i Biologia Molecular
La aplicación de métodos de dinámica molecular (MD) para el estudio de sistemas biológicos. Esta tesis se centra en la aplicación tanto de dinámica molecular clásica como perturbación de energía libre (FEP) para estudiar sistemas biológicos tales como los receptores acoplados a proteínas G y los inhibidores de BACE1. [...]
Application of Molecular Dynamics (MD) methods to the study of biological systems. This thesis is focused on the application of both classical MD and free energy perturbation (FEP) to study biological systems such as G protein-coupled receptors and BACE1 inhibitors. [...]

[Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, 2017  

Interested in being notified about new results for this query?
Set up a personal email alert or subscribe to the RSS feed.