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21 p, 1.7 MB Long-read based assembly and synteny analysis of a reference Drosophila subobscura genome reveals signatures of structural evolution driven by inversions recombination-suppression effects / Karageorgiou, Charikleia (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Gámez Visairas, Víctor (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Tarrío, Rosa (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Rodríguez-Trelles, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Background: Drosophila subobscura has long been a central model in evolutionary genetics. Presently, its use is hindered by the lack of a reference genome. To bridge this gap, here we used PacBio long-read technology, together with the available wealth of genetic marker information, to assemble and annotate a high-quality nuclear and complete mitochondrial genome for the species. [...]
2019 - 10.1186/s12864-019-5590-8
BMC genomics, Vol. 20 (March 2019) , art. 223  
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