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1.
18 p, 1.7 MB Expansion of the SOS regulon of Vibrio cholerae through extensive transcriptome analysis and experimental validation / Krin, Evelyne (Institut Pasteur. Département Génomes et Génétique) ; Pierlé, Sebastian Aguilar (Institut Pasteur. Département Génomes et Génétique) ; Sismeiro, Odile (Institut Pasteur. Biomics Center for Innovation and Technological Research) ; Jagla, Bernd (Institut Pasteur. UtechS CB and Hub Bioinformatique et Biostatistique) ; Dillies, Marie-Agnès (Institut Pasteur. Hub Bioinformatique et Biostatistique) ; Varet, Hugo (Institut Pasteur. Biomics Center for Innovation and Technological Research) ; Irazoki, Oihane (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Campoy Sánchez, Susana (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia) ; Rouy, Zoé (Université Evry-Val-d'Essonne. Institut de Biologie François Jacob) ; Cruveiller, Stéphane (Université Evry-Val-d'Essonne. Institut de Biologie François Jacob) ; Médigue, Claudine (Université Evry-Val-d'Essonne. Institut de Biologie François Jacob) ; Coppée, Jean-Yves (Institut Pasteur. Biomics Center for Innovation and Technological Research) ; Mazel, Didier (Institut Pasteur. Département Génomes et Génétique)
The SOS response is an almost ubiquitous response of cells to genotoxic stresses. The full complement of genes in the SOS regulon for Vibrio species has only been addressed through bioinformatic analyses predicting LexA binding box consensus and in vitro validation. [...]
2018 - 10.1186/s12864-018-4716-8
BMC genomics, Vol. 19 (May 2018) , art. 373  
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2.
40 p, 3.7 MB Recruitment of a lineage-specific virulence regulatory pathway promotes intracellular infection by a plant pathogen experimentally evolved into a legume symbiont / Capela, Delphine (Institut national de la recherche agronomique (França). Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes) ; Marchetti, Marta (Institut national de la recherche agronomique (França). Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes) ; Clerissi, Camille (Institut national de la recherche agronomique (França). Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes) ; Perrier, Anthony (Institut national de la recherche agronomique (França). Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes) ; Guetta, Dorian (Institut national de la recherche agronomique (França). Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes) ; Gris, Carine (Institut national de la recherche agronomique (França). Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes) ; Valls, Marc (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Jauneau, Alain (Centre national de la recherche scientifique (França). Fédération de Recherches Agrobiosciences, Interactions, Biodiversity, Plateforme d'Imagerie) ; Cruveiller, Stéphane (Centre National de la Recherche Scientifique (França)) ; Rocha, Eduardo P. C. (Institut Pasteur (París, França). Microbial Evolutionary Genomics) ; Masson-Boivin, Catherine (Institut national de la recherche agronomique (França). Laboratoire des Interactions Plantes Micro-organismes)
Ecological transitions between different lifestyles, such as pathogenicity, mutualism and saprophytism, have been very frequent in the course of microbial evolution, and often driven by horizontal gene transfer. [...]
2017 - 10.1093/molbev/msx165
Molecular biology and evolution, Vol. 34, issue 10 (Oct. 2017) , p.2486-2502  
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