Dipòsit Digital de Documents de la UAB 5 registres trobats  La cerca s'ha fet en 0.00 segons. 
1.
19 p, 6.2 MB Extreme genomic erosion after recurrent demographic bottlenecks in the highly endangered Iberian lynx / Abascal, Federico (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ; Corvelo, André (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Cruz, Fernando (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Villanueva-Cañas, J. L. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ; Marcet-Houben, Marina (Centre de Regulació Genòmica) ; Martínez-Cruz, B. (Estación Biológica de Doñana) ; Cheng, J. Y. (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ; Prieto, P. (Centre de Regulació Genòmica) ; Quesada, V. (Universidad de Oviedo. Instituto Universitario de Oncología) ; Quilez, J. (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ; Li, G. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ; García, Francisca (Universitat Autònoma de Barcelona. Servei de Cultius Cel·lulars, Producció d'Anticossos i Citometria) ; Rubio-Camarillo, M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ; Frias, Leonor (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Ribeca, Paolo (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Capella-Gutiérrez, Salvador (Centre de Regulació Genòmica) ; Rodríguez, J. M. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ; Câmara, F. (Centre de Regulació Genòmica) ; Lowy, Ernesto (Centre de Regulació Genòmica) ; Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica) ; Erb, I. (Centre de Regulació Genòmica) ; Tress, M. L. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ; Rodriguez-Ales, J. L. (Centre de Regulació Genòmica) ; Ruiz-Orera, J. (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Reverter, F. (Centre de Regulació Genòmica) ; Casas-Marce, M. (Estación Biológica de Doñana) ; Soriano, L. (Estación Biológica de Doñana) ; Arango, Javier R (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ; Derdak, Sophia (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Galán, Beatriz (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ; Blanc, Julie (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Gut, Marta (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Lorente-Galdos, Belen (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona)) ; Andrés Nieto, Marta (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí") ; López-Otín, C. (Universidad de Oviedo. Departamento de Bioquímica y Biología Molecular) ; Valencia, A. (Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas) ; Gut, I. (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; García, J. L. (Centro de Investigaciones Biológicas (Madrid)) ; Guigó, R. (Centre de Regulació Genòmica) ; Murphy, W. J. (Texas A;M University. Department of Veterinary Integrative Biosciences) ; Ruiz-Herrera Moreno, Aurora (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia) ; Marques-Bonet, Tomas. 1975- (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Roma, Guglielmo (Centre de Regulació Genòmica) ; Notredame, C. (Centre de Regulació Genòmica) ; Mailund, Thomas (Aarhus University. Bioinformatics Research Centre) ; Albà, M. Mar (Institut Hospital del Mar d'Investigacions Mèdiques) ; Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica) ; Alioto, Tyler Scott (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Godoy, J. A. (Estación Biológica de Doñana)
Background: Genomic studies of endangered species provide insights into their evolution and demographic history, reveal patterns of genomic erosion that might limit their viability, and offer tools for their effective conservation. [...]
2016 - 10.1186/s13059-016-1090-1
Genome biology, Vol. 17 (2016) , art. 251  
2.
50 p, 962.3 KB Transposons played a major role in the diversification between the closely related almond and peach genomes : Results from the almond genome sequence / Alioto, Tyler Scott (Centre de Regulació Genòmica) ; Alexiou, Konstantinos G. (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Bardil, Amélie (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Barteri, Fabio (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Castanera, Raúl (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Cruz, Fernando (Centre de Regulació Genòmica) ; Dhingra, Amit (Washington State University. Department of Horticulture) ; Duval, Henri (Institut National de la Recherche Agronomique (França)) ; Fernández i Martí, Angel (University of California) ; Frias, Leonor (Centre de Regulació Genòmica) ; Galán, Beatriz (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; García, José Luis (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Howad, Werner (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gómez-Garrido, Jessica (Centre de Regulació Genòmica) ; Gut, Marta (Centre de Regulació Genòmica) ; Julca, Irene (Centre de Regulació Genòmica) ; Morata, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Puigdomènech, Pere, 1948- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Ribeca, Paolo (Centre de Regulació Genòmica) ; Rubio Cabetas, María José (Centro de Investigación y Tecnología Agroalimentaria de Aragón) ; Vlasova, Anna (Centre de Regulació Genòmica) ; Wirthensohn, Michelle (The University of Adelaide. School of Agriculture, Food and Wine) ; Garcia-Mas, Jordi (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica) ; Casacuberta i Suñer, Josep M. 1962- (Centre de Recerca en Agrigenòmica) ; Arús i Gorina, Pere (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
We sequenced the genome of the highly heterozygous almond Prunus dulcis cv. Texas combining short and long-read sequencing. We obtained a genome assembly totaling 227. 6 Mb of the estimated 238 Mb almond genome size, of which 91% is anchored to eight pseudomolecules corresponding to its haploid chromosome complement, and annotated 27,969 protein-coding genes and 6,747 non-coding transcripts. [...]
2020 - 10.1111/tpj.14538
The Plant journal, Vol. 101, Issue 2 (January 2020) , p. 455-472  
3.
13 p, 1.4 MB The site frequency/dosage spectrum of autopolyploid populations / Ferretti, Luca (The Pirbright Institute (Regne Unit)) ; Ribeca, Paolo (The Pirbright Institute (Regne Unit)) ; Ramos-Onsins, Sebastian (Centre de Recerca en Agrigenòmica)
The Site Frequency Spectrum (SFS) and the heterozygosity of allelic variants are among the most important summary statistics for population genetic analysis of diploid organisms. We discuss the generalization of these statistics to populations of autopolyploid organisms in terms of the joint Site Frequency/Dosage Spectrum and its expected value for autopolyploid populations that follow the standard neutral model. [...]
2018 - 10.3389/fgene.2018.00480
Frontiers in genetics, Vol. 9 (Oct. 2018) , art. 480  
4.
12 p, 1.0 MB Genome sequence of the olive tree, Olea europaea / Cruz, Fernando (Universitat Pompeu Fabra) ; Julca, Irene (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Gómez-Garrido, Jessica (Universitat Pompeu Fabra) ; Loska, Damian (Centre de Regulació Genòmica) ; Marcet-Houben, Marina (Centre de Regulació Genòmica) ; Cano, Emilio (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Galán, Beatriz (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Frias, Leonor (Universitat Pompeu Fabra) ; Ribeca, Paolo (Universitat Pompeu Fabra) ; Derdak, Sophia (Universitat Pompeu Fabra) ; Gut, Marta (Universitat Pompeu Fabra) ; Sánchez Fernández, Manuel (Grupo Santander) ; García, José Luis (Consejo Superior de Investigaciones Científicas) ; Gut, Ivo (Universitat Pompeu Fabra) ; Vargas, Pablo (Vargas Gómez) (Consejo Superior de Investigaciones Científicas. Real Jardín Botànico de Madrid) ; Alioto, Tyler Scott (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Gabaldón, Toni (Centre de Regulació Genòmica)
The Mediterranean olive tree (Olea europaea subsp. europaea) was one of the first trees to be domesticated and is currently of major agricultural importance in the Mediterranean region as the source of olive oil. [...]
2016 - 10.1186/s13742-016-0134-5
GigaScience, Vol. 5, Issue 1 (December 2016) , art. 29  
5.
13 p, 995.3 KB Boosting the FM-index on the GPU : effective techniques to mitigate random memory access / Chacón, Alejandro (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Marco-Sola, Santiago (Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica) ; Espinosa, Antonio (Universitat Autònoma de Barcelona) ; Ribeca, Paolo (The Pirbright Institute (Regne Unit)) ; Moure, Juan C (Universitat Autònoma de Barcelona)
The recent advent of high-throughput sequencing machines producing big amounts of short reads has boosted the interest in efficient string searching techniques. As of today, many mainstream sequence alignment software tools rely on a special data structure, called the FM-index, which allows for fast exact searches in large genomic references. [...]
2015 - 10.1109/TCBB.2014.2377716
IEEE/ACM Transactions on computational biology and bioinformatics, Vol. 12, No. 5 (Sep.-Oct. 2015)  

Us interessa rebre alertes sobre nous resultats d'aquesta cerca?
Definiu una alerta personal via correu electrònic o subscribiu-vos al canal RSS.